鄭芝龍既是懷揣著主意來的，那麼對南京方麵原本的出師計劃沒有太大影響。
六月底，弘光朝廷任史可法為督師，會集左夢庚、袁時中、劉良佐、劉肇基、張天祿諸軍共五萬四千兵馬渡江北伐，留劉孔炤、史德威等率領南京江防部隊繼續守護南京，另分方國安一支軍隊轉進浙江。鄭芝龍則重新鼓帆啟程，部將施福、梁立、黃廷、成升、洪習山等分批次陸續率船隊沿江入海。
南京有錢謙益坐鎮，與江西總督袁繼鹹均對史可法軍隊的後勤負責，且其時新任鳳陽總督瞿式耜走馬上任大半個月了，他是錢謙益的心腹，有他策應，史可法軍隊一路暢行無阻，十分順利。七月上旬抵達淮安、徐州交界，進駐呂梁山以東的邳州，距離山東僅僅咫尺之遙。
淮揚巡撫路振飛向史可法、左夢庚等述說了山東當前局勢。
早在五月，清都察院參政祖可法、張存仁就曾向多爾袞建言：“山東乃糧運之道，山西乃商賈之途，急宜招撫。若二省兵民歸我版圖，則財賦有出，國用不匱矣。”多爾袞納其言，先以明降臣方大猷為監軍副使招撫山東，後又使明降臣王鼇永以戶部、工部的名義前往山東收拾地方，更派固山額真巴哈納、石廷柱以及平西王吳三桂等發兵作為後盾。
山東地麵，自大順軍敗出北京，原藩封山東的魯王、德王等大明宗室或為順軍所殺或早已奔跑，各方勢力風起雲湧。嘉祥縣滿家洞的宮文彩、傅家樓的馬應試都是趁勢而起擁眾萬餘的新興大土寇，青州守備李士元、萊蕪縣德王府指揮畢維地、德平縣參將高捷、武邑縣遊擊袁燦然等等明朝舊臣亦大多與當地生員、鄉紳聯手肅清大順官員占據城池。
清軍進軍山東，占領了北部德州、樂陵縣等地後，清廷感到山西局勢變化太快，更需兵力補充，故而決定將巴哈納等軍隊轉調山西。山東方麵隻讓王鼇永、方大猷征召了數千散兵遊勇穩定局麵，雖說後續又委任了柯永盛為膠鎮總兵負責掃平膠東，但僅憑王、方、柯三部，清軍在山東的勢力顯然不牢固。且清軍用攝政王多爾袞的名義在山東遍傳檄文，收效並不理想。尤其是多爾袞強製軍民剃發的政策，更激起怨聲無數。山東各地繼反順之後開始大肆反清，各方勢力犬牙交錯，形勢極為複雜。
“韃子在五月間強令我漢家子弟剃發易服，引得天怒人怨。山東百姓盼我王師若盼時雨，我天兵一至，必得群起響應。”路振飛袒袖說道。他說百姓盼望左夢庚的軍隊，但其實左夢庚軍隊到來，最欣慰的是他。要不是顧及著形象，他真想聲淚俱下將這段時間自己頂著山東、淮揚一帶的騷亂苦苦支撐的經曆一一道來。
“聽聞去年闖賊曾派遣偽官呂弼周來代路大人？”史可法端坐問道。
“正是，那呂弼周本為河南提學副使，有才而無節操，屈膝為闖賊效力。不止他，同來的尚有進士武愫，受闖賊任命為防禦使招撫徐、沛，都給本官擊敗斬殺了。”路振飛頗有軍政才能，在任時間雖不長，但已練得兩淮團練勁卒兩三萬，全因有他鎮守淮揚作為屏障，南直隸等地才不致大亂。
“路大人既有精兵，可遣之隨軍向北。”史可法認真道。雖然他自己知道受到了排擠，而且在軍隊中沒有實權，但事關恢複大明的國事，他一樣盡心盡力，沒有半分惰怠。
“正有此意，本官即刻揀選壯勇萬人，以犬子統率，聽從督師調遣。”路振飛點點頭，手指點向坐在下首的一個年輕人，“犬子路澤農，通曉文墨、弓馬嫻熟，淮揚局麵能維持至今，他出力甚多。”
路澤農聽到，連忙起身向史可法行禮道：“路澤農見過督師。”
史可法瞧他年紀雖輕，但舉手投足之間自有一種沉穩，心中喜歡，點頭讚道：“虎父無犬子。淮揚有路大人、鳳陽有瞿大人，如兩扇門扉，緊鎖我南京門戶。”