幸好太監們終於救上了朱標，朱元璋鬆了一口氣，看著落湯雞一樣的朱標歎息道：“傻孩子，朕殺人關你什麽事？好了，你贏了，朕不殺那些犯人了，你滿意了嗎？”說完看了看周圍救過太子的太監，發現有些還穿著衣服鞋子，有些已經脫了衣服鞋子。
他便下旨道：“但凡穿了衣服鞋子下水的都晉升三級，凡是脫了衣服鞋子才下水的全部殺頭。”那些脫了衣服鞋子的太監們嚇得跪下求饒，朱元璋冷冷地說：“太子落水，你們還顧著先脫衣服鞋子去救他，如此失職，全部該死！”
可能那次投水受寒，朱標自此長年被病魔纏身，終於到了洪武二十五年（公元1392年）夏天，朱標從陝西視察後返京，患上了風寒，在父親朱元璋之前逝世，終年三十七歲，諡懿文太子。
這下子打擊得朱元璋幾乎崩潰，他在禦書房哭著對學士劉三吾說：“太子是朕的長子，他出生時，朕正在率軍打仗，他出生的消息讓朕歡天喜地，朕在當地的一座山上刻字：到此山者，不患無嗣。大明皇朝一建立，朕就立他為太子，從小培訓他成為下任國君，如今他說走就走了，讓朕白發人送黑發人。真是不知作了什麽孽？朕中年喪妻，晚年喪子，加上朕是少年喪父的，人間三大不幸都在朕一人身上。”
劉三吾心想：“你不知自己作了什麽孽？你作的孽可多了，還不知道手上玷了多少血嗎？”不過他當然不敢直說，隻是口中勸道：“陛下節哀，陛下兒孫滿堂，陛下還是趕緊振作起來，盡早立下新皇儲吧。太子是一國之本，太子不早定，人心浮動呀！”
朱元璋用手帕印幹眼淚，喝了一口熱茶，定了定神，緩緩地說：“朕意欲立燕王，愛卿以為如何？”劉三吾搖頭道：“皇上如果要立燕王，那將置秦王與晉王於何地？”朱元璋用力閉上眼睛，用手指撫著隱隱作痛的太陽穴。
劉三吾這樣說也不無道理，朱棣排行第四，朱標是長子，第二子是秦王朱樉，第三子是晉王朱棡。現在長子朱標已死，但朱棣之前還有兩個哥哥，如果在兒子中找新太子，那麽也輪不到燕王朱棣。
劉三吾又說：“臣以為皇孫已經長大成人了，皇孫朱允炆是太子與太子妃的嫡子，由他接前太子的位置也合情合理。”太子朱標有五個兒子，最大的在年幼時早死，第二子就是朱允炆，朱允炆還有三個弟弟，但年紀都太小。
朱元璋沉吟片刻，最後撫須緩緩點頭道：“允炆這孩子不錯，朕也很喜歡，他比他爹更聰明，但這性子跟他爹一樣仁柔，扶這孩子上位，那些強悍的叔叔們與權臣們，他能駕禦嗎？”
這下子輪到劉三吾靜了，他想了想道：“皇孫身邊如有能人賢臣輔助，定可勝任。梅駙馬也不失為是一個好人選。駙馬梅殷娶了陛下的寧國公主，那他就是皇孫的姑父了。在陛下十六個女婿中，他是最可靠的。他是妝南侯梅思祖的兒子，通經史，善騎射，可謂文武雙全。為人又恭敬謹慎，此人可堪大用。”
朱元璋認同道：“梅駙馬是可以的。”然後他揚聲道：“來人呀！”太監進禦書房，跪下問道：“陛下有何吩咐？”朱元璋道：“傳朕旨意，冊封皇孫朱允炆為皇太孫。”於是十五歲的朱允炆成了皇太孫，做了大明帝國的新皇儲。