建寧二年四月十日，劉辯以孝獻帝遺詔在洛陽登基為帝，改年號為元嘉，是為元嘉元年。
劉辯任盧植為太傅，荀攸為司徒，華歆為司空，朱儁為太尉，是為三公。徐榮為鎮西將軍、涼州刺史，戰時行州牧職權。杜畿為靖邊將軍、並州刺史，戰時行州牧職權。張遼為鎮北將軍、幽州刺史，戰時行州牧職權。趙雲為鎮東將軍、冀州刺史，戰時行州牧職權。呂布為鎮南將軍、徐州刺史，戰時行州牧職權。高順為陷陣將軍、司隸校尉。韓康為宣威將軍、益州刺史，戰時行州牧職權。曹昂為威遠將軍、兗州刺史，戰時行州牧職權。太史慈為橫江將軍、青州刺史，戰時行州牧職權。賈詡為軍師將軍、豫州刺史，戰時行州牧職權。伍俘為中尉，負責宮內守衛。
其他眾臣也各有封賞，因天下未定，並未封侯。
而後劉辯承認劉備帝位，並將其以帝王之禮葬於皇陵，並以關、張合葬，使三兄弟葬在一起，並立碑於其中訴說三人情誼。
同年五月，劉備任命的益州牧司馬防因劉備故去，再加上愛子殞命的打擊，病逝於永昌郡不韋縣，而後餘眾舉城降於韓康。
曆時近三年，益州終於平定，韓康、高順兩人也得以休息一番。
交州刺史朱符乃朱儁之子，差人往洛陽向劉辯效忠，雖然劉辯聽聞朱符在任上橫征暴斂，但又知尚未到對朱符動手的機會，故而隻是命人告知益州刺史韓康，派人監督朱符舉動。
故而此時天下隻有揚州、荊州兩處尚未平定，但弘農軍在與劉備一戰中損失不小，劉辯仍舊以修養生息為策，暫時放任兩處互相爭鬥。
待時機成熟後，一舉破之。
周瑜率揚州軍進入荊州後，初戰得利，然而卻被黃忠在武陵斬了數員大將，損失慘重，進軍的速度也不得不停滯下來。
但依荀攸、賈詡、郭嘉三人所言，現在還不是對其動手時候，賈詡也自告奮勇，往豫州去，從而可以打探到揚州、荊州的消息。
元嘉二年六月，孫權見周瑜久戰不勝，便親率周泰、董襲兩將趕往荊州支援，而當孫權離開後，其叔父孫靜長子定武中郎將孫暠率軍在烏程起兵，準備奪取孫權的大權，孫權之弟、年僅十四歲的丹陽太守孫翊被殺，孫暠很快便控製了丹陽郡大部分縣城。
孫暠之父昭義中郎將孫靜赴吳縣勸阻他，卻被軟禁在吳城，揚州震動。
身在長沙的孫權收到消息後，立即率軍回揚州處理內部的叛亂，將荊州之事暫時擱置。
劉辯收到消息的時間，也就比孫權晚了兩日，隨後劉辯傳令豫州刺史賈詡、徐州刺史呂布、冀州刺史趙雲兵進揚州，而益州刺史韓康兵進荊州，劉辯也與司隸校尉高順率領一軍往荊州進發。
荊州主事劉琦收到消息後，與麾下眾人商議對策，此時荊州七郡他隻有其三，再加上與袁術軍、揚州軍連年先後戰鬥，將士疲敝，形勢極為不利，若朝廷大軍趕來，恐難以守住。
蒯良、蒯越建議劉琦舉南陽、江夏、南三郡向劉辯投誠，效命於劉辯。
劉琦有些擔心地言道：“某舊日練合叔父而與其為敵，若是其趁機要某性命，為之奈何？”
“此次陛下應是為揚州而來，若主公主動投效，以陛下仁德之名，必然不會為難主公矣。”蒯良覺得劉琦有些多慮了，勸道。
劉琦聞言便打定主意，派黃忠往劉辯處請降。
劉辯聞訊心中大喜，又見黃忠生的體格健壯，善騎射，將黃忠留在身邊，而後任命劉琦為荊州刺史，蒯良為南郡太守、蒯越為江夏太守，並令其派兵與大軍一起與揚州軍作戰。
劉琦收到消息後，見劉辯並未為難自己，心中大喜，至於黃忠，跟在劉辯身邊也就跟了，人家黃忠都沒有要回來，他也不好意思跟劉辯要人。
隨後，劉琦派文聘領一軍與劉辯同行，算是完成了劉辯的囑咐。蒯良離開南陽時曾對劉琦言：“主公若是能親自率軍與陛下同行，定然大有裨益。”然而劉琦卻沒有聽進去蒯良的話，自己躲在南陽郡安樂。
劉辯見率軍而來的是文聘，而劉琦至始自終都沒有出現，對河南尹郭嘉感慨道：“本來寡人看在宗親之名，欲封其為侯，如今看來，卻是不用矣。”
郭嘉隻是點了點頭，並未言語，他可不想摻和到這些人情世故中。
劉辯見郭嘉這般模樣，搖了搖頭，暗道無趣。
隨後，待眾將各自到達位置，一齊向揚州軍發起進攻，而此時孫權仍然在吳郡與孫暠對陣，雖然已經將孫暠圍困在吳城，可似乎攻下來還需要一些時日。
周瑜心中了解揚州的重要性高於荊州，料定劉辯一定會率大軍全力進攻揚州，便調程普、韓當率軍回援，他則與黃蓋一起守衛荊南諸郡，同時也將戰場分隔衛兩塊，將益州來的人馬阻擋在荊州。