大蛇丸襲擊木葉之後，忍界又重新恢複了平靜狀態，而這種平靜的時光一晃眼又過去了三年。
這三年中，曉組織在斑的帶領下，似乎還在準備著什麼，始終低調行事，幾乎全部都是偃旗息鼓，沒有出現在各大國的眼中。
而在這種情況下，本來還因為木葉的勸告而對曉組織有些警惕的幾大國，都慢慢對曉組織放鬆了警惕，最終徹底遺忘了此事。
隻有木葉高層始終堅信曉組織依然在謀劃著什麼，始終全力監視著曉組織的行動，但也沒有收獲什麼，反而在長期的監視中，損失了不少人力。
畢竟曉組織中每個成員都是s級的叛忍，監視他們就如同在鋼絲上行走，一不心被會被發現，最終難逃一死。
木葉村中，木葉高層雖然為了曉組織的事情憂心忡忡，木葉普通的村民和非高層忍者卻對此事一無所知，仍舊無憂無慮享受著當前的和平。
木葉的十二強經過這三年的鍛煉，都取得了巨大的進步，其中大部分人都已經成功通過中忍考試，成為了中忍。
其中流明更是在三年前的中忍考試中表現出色，破格被提為了中忍，也是那屆中忍考試唯一的一個通過考試成為中忍的考生。
而原本也應該通過考試的鹿丸卻因為全程劃水，沒有太多亮眼的表現，也成為了眾多落選考生中的一員。
不過在第二年的考試中，他還是順利通過了中忍考試，不單是他自己，就連他的兩個隊友，丁次和井野也一同順利通過了考試。
除此之外，其他木葉十二強也都先後順利通過了中忍考試，但卻僅有二人除外，而這二人便是佐助和鳴人。
佐助自從上一次大戰中，先是被大蛇丸一頓蠱惑，而後又被下了咒印，早早就暈了過去，而他醒來後，卻聽到流明和鳴人大發神威的事情，內心很受打擊。
雖然佐助內心遭受很大的打擊，不過由於他如今的處境不算特別糟糕，有母親，有族人，所以並沒有選擇去投靠大蛇丸。
他在從昏迷中醒來後，就主動找到止水，要求止水給他進行地獄式訓練。
結果這個訓練一下子就持續了三年，中間的中忍考試都沒有心情去參加，於是鳴人和櫻隻好兩人組隊去參加，。
最終櫻順利通過了考試，成為了中忍。
而鳴人卻因為種種馬虎大意的行為，哪怕其中一次更是順利取得了最後比試的第一名，還是被無情的涮了下來。
同一屆的夥伴都已經先後通過中忍考試，唯有嗎人還頂著一個下忍的頭銜，當然，佐助因為長久閉關修行並不算在其中。
反正鳴人覺得自己顏麵無光，自從一年前的中忍考試失敗後，就一直憋著一口氣，想要在今年的中忍考試中，大展身手，一舉通過中忍考試。
然而就在距離中忍考試隻有不到一個月時間的時候，一場風暴卻已經悄悄形成，即將在忍界掀起驚濤駭浪。
曉組織的基地中，所有曉組織的成員齊聚一堂，斑坐在首位的椅子上，默默掃視著眾人。