在木葉忍者的奮戰下，砂忍和音忍敗退。事後，雙方確認此次事件的主謀是大蛇丸，他暗中殺死了風影並假扮風影挑起了戰爭。木葉選擇原諒砂忍並重新建立同盟關係。
此次戰鬥中，木葉大批忍者傷亡。旗木卡卡西與宇智波佐助持續昏迷，三代火影猿飛日斬在與大蛇丸的戰鬥中犧牲，其養子猿飛火葉在與砂忍戰鬥中失去了一條手臂。
“我先走了。”火葉換好了黑色的衣服，和南打了聲招呼去參加三代火影的葬禮。
“慢走。”
本來在完成一尾的抓捕後是要立即返回曉組織的，不過火葉請求等自己參加完三代火影的葬禮再走，南同意了。南也曾經失去過重要的人，她能理解現在火葉的感受。而且，經過五年的相處，她的內心已經把火葉當成親弟弟一般的存在，雖然平常沒什麼感覺，但看到火葉的左臂被打斷後她真有點難過。她也清楚，失去左臂的火葉此次回到曉組織後就會被抽走體內的三尾然後死去，南想盡量滿足火葉最後的願望。於是，南決定和火葉再在木葉停留至三代火影葬禮結束，鬼鮫帶著一尾的查克拉先行返回組織，鼬則自己還想再多了解了解木葉的變化也留了下來，並且不知藏在了哪裏。
三代火影的葬禮上，除了守衛和重傷的以外，大部分的木葉忍者都來了，在場的人看上去都十分傷心。火葉和木葉丸站在最前麵，火葉用僅有的一隻右手摟著木葉丸。
看著木葉丸那一副憋著淚的樣子，火葉便安慰他：“木葉丸，想哭就哭吧。”
木葉丸強忍著淚水回應：“我才不會哭呢。我體內可是流淌著爺爺的火影血統，才不會隨便哭的。倒是火葉大哥你，要是難過的話就哭吧，別憋壞了。”
憋壞嗎？三代火影身為火葉的養父確實是和他最親近的人，火葉此時也十分難過，但是他的眼裏沒有一滴淚水。這五年來擔驚受怕的生活讓他根本就騰不出多餘的力氣去哭，或許他早已忘記了哭是什麼。這樣的生活繼續下去，他可能連感情都會被抹消掉。
“讓一下，讓一下。”在眾人哀悼時，幾個戴著麵具的人衝入人群之中來到了火葉身邊，他們是沒有參加火影葬禮的部分忍者之一——暗部“根”的成員。
“喂，你們想在我爺爺的葬禮上幹什麼。”木葉丸生氣地看著這幾個暗部的人，但這幾個暗部的人並沒有理他，而是看向火葉。
“您就是猿飛火葉大人吧，能麻煩您陪我們走一趟嗎。”
“什麼事這麼急，不能等我參加完老爺子的葬禮再跟你們去嗎。”
“抱歉，這次事關木葉的安危，還請火葉大人立刻跟我們走一趟。”
鳴人聽到這幾個暗部成員的話從人群中衝了出來：“喂，你們這群家夥。火影老爺爺的葬禮上你們居然敢這樣，我大哥是火影老爺爺的養子，理應。。。”
“夠了，鳴人。”火葉打斷了鳴人的話，因為他感覺到這幾個暗部成員對鳴人起了殺心。
“可是，大哥。。。”
“我不想在老爺子屍骨未寒之際讓一群走狗破壞了他的葬禮。”火葉對鳴人完後轉頭看向暗部成員，“我跟你們走。”
“謝謝您的理解。”幾名暗部成員將火葉圍在中間帶他前往暗部。
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木葉暗部“根”的秘密基地，中間坐著一個右眼綁著繃帶，年齡和三代火影差不多大的男人，看上去他就是這裏的老大。
“你就是猿飛的養子吧。”這個人看了看火葉。
“閣下是？”
“我是木葉暗部組織‘根’的首領誌村團藏，也是你的養父猿飛的舊友。”
“是嗎。那不知團藏先生為什麼要在舊友的葬禮上把身為他養子的我給帶到這種地方來呢。”
“看上去你對我的印象並不好啊。那我也不和你閑聊了直奔主題吧。”團藏拄著拐杖站了起來，“猿飛火葉，你是曉組織的人對吧。”
火葉聽後心裏一驚，但臉上並沒有表現出來。