在東京市千代田區一條街的某東別墅裏，智坐在陽台沙發上，遙望著夜晚的美麗景色。
自從特殊副本開啟後，智就在十分鍾後，被係統強製性的穿越到了這個叫做名偵探柯南的副本裏。
在智穿越的那一刻，神奇寶貝世界的時間，仿佛被凍結了一樣，所有的生命全都靜止了起來，就連沉睡中的阿爾宙斯也是一樣。
名偵探柯南，智在前世的時候看過一點，也知道一些劇情，隻是沒有追的那麼細，主要的內容就是一個叫做工藤新一的高中生，在關東地區被稱作平成年代的福爾摩斯，號稱沒有他破不了的案子。
後來在一次和青梅竹馬在遊樂園乘坐雲霄飛車的時候，發現了兩個行動詭異的黑衣男子，於是便甩開青梅竹馬的毛利蘭追了上去，不料卻被對方發現。
在被打昏的那一刻，被黑衣男子灌下了一種叫做ap4869的神秘毒藥，然而工藤新一在被灌下毒藥後，並沒有因此而死，反而因為毒藥的副作用，讓身體返回到了孩的狀態。
為了不使周圍的人受到牽連，他便化作江戶川柯南，寄住在青梅竹馬的毛利蘭家裏，利用阿笠博士發明的手表型麻醉槍讓毛利蘭的父親毛利五郎沉睡，接著用蝴蝶結變聲器模仿毛利五郎的聲音進行推理。
在利用偵探毛利五郎解決各種案件的同時，江戶川柯南也在調查著讓他身體變的黑衣人。
這些就是名偵探柯南的大概劇情，智穿越的時間點是劇情開始的前三年，這點智已經在係統哪裏確認過了。
而且智還發現，他的實力受到了極大的限製，各種忍術無法使用，神之眼被封印，隻留下了三勾玉寫輪眼，體術擁有上忍的等級。
好在這個世界的武力值並不是很高，憑借智如今的能力，依舊可以在這裏肆無忌憚。
在穿越後，智替代了原本在這個世界的分身，名字依舊是叫禦木葉智，從孤兒院出來的，這點讓智很是無語，貌似每次穿越取代的分身都是孤兒。
因為知道這個世界的主線是破案，所以智開了一家禦木偵探事務所，專門處理各種案件，三年裏，智破過的案件有很多，知名度也相當的大。
在關東地區也算是有名氣了，知名度和工藤新一差不多，都是被稱為現代破案率最高的偵探，隻不過比起工藤新一，選擇智的人要更多。
畢竟智的偵探事務所是正規的，大部分的人選擇偵探破案的話，自然會選擇智的正規事務所，而工藤新一主要是幫助警方破案，所以才會被記者挖掘出來。