石莫製定好計算機硬件的發展方向後，繼續安排其他的研發事項。
2012實驗室計算機係統研究所，主要從事圖形界麵係統、多媒體、計算機科學基礎等領域的研究，致力於推動計算機科學前沿發展，著眼下一代革命性技術的研究，助力公司實現長遠發展戰略。這個研究所由姚期知負責。
姚期知，計算機學家，1946年出生於中國上海，1967年獲得台灣大學物理學士學位；1972年獲得哈佛大學物理博士學位；1975年獲得伊利諾依大學計算機科學博士學位，之後先後在美國麻省理工學院數學係、斯坦福大學計算機係、加州大學伯克利分校計算機係任助理教授、教授；2000年圖靈獎獲得者，是美國國家科學院院士、美國藝術與科學學院院士、中國科學院院士、港科院創院院士。
姚期知的研究方向包括計算理論及其在密碼學和量子計算中的應用，最先提出量子通信複雜性，提出分布式量子計算模式，後來成為分布式量子算法和量子通訊協議安全性的基礎。
石莫任命好計算機係統研究所的負責人，姚期知就向石莫問道：“老板，這個圖形界麵係統是美國施樂公司設計的那種係統嗎？”
PC上的第一個圖形界麵係統是Xerox Alto，其於1973年被施樂公司所設計，施樂的工程師在發明鼠標的時候，順便設計了配合鼠標使用的圖形操作係統，但該係統並未商用，主要用於大學和研究機構。
現在IT行業的圖形界麵係統還很少。蘋果公司的第一個圖形界麵係統是1984年發布的。微軟的Windows 1.0係統要到1985年秋天才會正式發布，之前用的一直是DOS係統。
石莫說道：“是的，因為現在的係統使用門檻太高了，電腦的每一個操作都必須下指令，靠輸入指令來運行程序，如此難用，這會製約個人計算機的市場化普及。計算機其實可以更好用，可以通過點擊鼠標來完成大部分的操作。未來必然是操作簡單快捷的圖形界麵係統的時代，因此我們要提前布局，現在就組建團隊開始設計圖形操作係統，到82年時要配合我們的CPU芯片，研製出一台劃時代的個人電腦來，開啟操作係統和應用軟件的革命。”
“這個操作係統要完整地集成桌麵和應用程序以及圖形界麵，相比Xerox Alto係統，我們還要開發一些新技術，比如，基於窗口用圖標的UI，窗口可以被鼠標移動，可以使用鼠標拖動文件和目錄以完成文件的copy和move，可以執行多個程序並在各個程序之間自由切換。”石莫怕姚期知做的跟Xerox Alto係統一樣簡單，因為這些技術在Xerox Alto上都是沒有的，因此提示說道。
“好的，老板，我知道如何做了。”姚期知應聲道。
石莫點了點頭，繼續說道：“姚教授，除了操作係統，你負責的研究所還要做支撐軟件，包括一係列的基本工具，比如：編程語言、編譯器、數據庫管理、存儲器格式化、文件係統管理、用戶身份驗證、驅動管理、網絡連接等方麵的工具。”