其他將領也紛紛打退堂鼓，麵對小規模東瀛軍隊，還有的一拚，可麵對比明軍人數還要多的東瀛軍隊，大部分將士失去正麵對決的勇氣，秦楚也理解將士士氣低迷，硬要和東瀛軍隊硬碰硬，白白流血犧牲。
他接受眾多將領意見，放棄已經挖好的戰壕，全軍撤退到惠州城，並且下令惠州城明軍帶上糧草，迅速撤回到永安，從永安撤退到和平縣。
在下達全軍撤退命令之後，秦楚內心很不是滋味，從偷襲澳門和中山開始，就出現戰略失誤，雖然計劃趕不上變化，可是明軍在惠州城損失沈樸一員大將，還有數千兵馬。
得到一大批糧草，閻可義和杜永合兩隻殘兵，還有數百隻三八步槍，看起來得到的要比失去的多，可是戰略目的沒有達到，沒有對東瀛後方形成致命打擊，反而讓東瀛補給和增援軍隊成功登陸華南，未來戰鬥中，東瀛進攻火力和進攻軍隊數量會更多，明軍將會遇到更大挑戰，秦楚越想越鬱悶。
在大軍抵達惠州城後，他進城休息片刻，陳邦彥早就知道秦楚偷襲東瀛補給車隊失敗的消息，和張家玉兩人在城中組織撤退，把惠州城城內物資全部帶走，一粒糧食都不留給東瀛人。
他看見秦楚悶悶不樂，走上前安慰秦楚。
“總督，勝負乃兵家常事，誰也料想不到東瀛人來的不僅僅是補給，還有一隻龐大援軍，總督不必過分自責，還是盡快啟程趕往贛州府。”
秦楚看著遠方，城外還有少量軍隊從遠方奔來，他們都是劉良能部騎兵，在完成最後一次對東瀛軍隊騷擾後，也撤向北方。
張家玉也來到秦楚身旁，和他說道：“總督，咱們該走了，再不走，東瀛人炮彈就要打過來了。”
秦楚默默說道：“沈樸啊，我對不起你，把你丟在這裏。”他眼睛突然一紅，都是因為他的戰略失誤，導致重逢後的沈樸死在惠州城外，他咬咬牙，戀戀不舍走下城牆，和城內剩餘軍隊撤退。
聆聽陽眼睛賊，他最後一個走下城牆，用餘光看見城外遠方人頭攢動，大聲喊道：“東瀛人來了，快走。”
眾人都沒有想到東瀛人速度會這麼快，竟然就趕過來，眾將領不由得加快步伐，帶領剩下將士從城內穿過，迅速撤退。
上川虎帶著輜重聯隊進城，發現城裏一切設施都被明軍毀壞，明軍撤退之前，把糧食等物資全部帶走，同時也毀掉城內一切設施，黑川元在城內建好的軍營，倉庫，排水溝等一切設施，都被明軍搗毀。
在城內的輜重聯隊放棄追擊明軍，從追擊部隊變成先頭部隊，在城內搭建簡單軍營，和修複一些生活設施，上川虎在城內夥房中，發現大量戰死的東瀛士兵和偽軍士兵，屍體留在城內會引發瘟疫，向聯隊長請求把屍體拖到城外掩埋。
聯隊長爽快同意這個請求，還給上川虎調了五百士兵，讓上川虎親自去負責這件事情，上川虎隻是第三師團大隊長，在第四師團這裏無依無靠，現在有這個機會，他要好好表現。
他親力親為，帶著一個士兵去拖大門口一具屍體，剛一拖動，他聽到一聲滋滋聲音，預感到危險，剛想離開，一聲巨大的轟鳴聲從夥房響起，整個夥房被炸翻，上川虎和周圍幾十個士兵瞬間被炸的粉碎。
這是秦楚給東瀛軍隊留下的禮物，用僅剩下一顆手榴彈做引爆，將全軍剩下火藥全部埋在夥房下麵，手榴彈擰開蓋子，把拉線扣在屍體胸口，隻要翻動屍體，手榴彈就會引爆，整個夥房炸藥都會殉爆。
城內一聲巨響，所有東瀛士兵都停下手中工作，巷弄清楚這是怎麼回事，輜重聯隊長趕忙帶著的士兵，來到夥房位置，看見地上鋪滿了屍塊，那叫一個氣，為防止城內還有其他陷阱造成將士傷亡，輜重聯隊在城內工作速度更慢。