“江南賊子從未停止反抗我大軍，既然如此，為什麼不把江南丟給明人和東瀛人，讓二者相爭，我等坐收漁翁之利，豈不更好？”
代善說不過多爾袞，又被多爾袞排斥多年，說不通多爾袞，也就不再堅持，帶著仆人離開皇宮，多爾袞當天下令在南直隸，江西，湖廣，四川等地清軍立即撤到長江以北，把能帶走的人口和物資全部帶回北方，在南方各地清軍將領接到聖旨以後，都不敢相信多爾袞竟然會放棄已經打下來的土地，可麵對聖旨，清軍將領也隻能含恨離去，在撤退途中，把附近百姓和一切物資都帶走，但是多爾袞隨後又下達一道密令，大軍撤退到北方，在長江以北城池駐軍增加一倍，還有大量船隻也被劃到長江北岸，為以後反攻作準備。
有大臣提醒多爾袞還是在江淮地區布置一隻兵馬，多爾袞深思熟慮，最終還是拒絕，以大炮威力，江淮防線不再是難以攻占的要塞，隻要有船有炮有兵，隨時可以打回來，把這些地方讓給明人和東瀛人去掙得頭破血流。
一等伯索尼憂心忡忡問多爾袞：“攝政王，要是東瀛人占領江淮，湖廣和巴蜀等重地，以這為跳板，向北方進攻呢？”
“索尼，你多慮了，我軍撤到長江以北，並不是在長江以北睡大覺，而是要時刻密切注意江南局勢，東瀛人占據優勢，我們就支援明人，讓明人和他們繼續打，還有一種可能是明人占據優勢，不過你覺得那群隻會窩裏反的明人，能夠打敗東瀛人嗎？”
“這可不見得，明人在這幾年也冒出來不少出色的將領，要是明人占據優勢，攝政王是否立馬揮軍，和東瀛人夾擊明人？”
索尼說的話就是多爾袞的意思，多爾袞才不會傻乎乎兩麵開戰，他早就看到清軍主力必須要在朝鮮半島和東瀛人打，就不能在江南和明軍以及東瀛軍打，於是大步後撤，把戰場留給明東瀛兩方，讓兩者打的天黑地安，清軍漁翁得利。
清軍最開始撤退的軍隊，是在巴蜀等地清軍軍團，他們強迫數百萬百姓離開當地，這隻清軍撤到陝西，山西等地，在湖廣軍隊撤到長江以北，在南直隸軍隊同樣撤到長江以北，被洪承疇寄以厚望薑鑲西北綠營兵撤到河南。
各路清軍幾乎帶走當地一大半人口，清軍戰略撤退，讓一直被壓著打的明軍逐步恢複勢力，也正因為清軍撤退，在長江以南的明軍又開始陷入到內鬥中，在巴蜀地區主持大局的長壽伯王應熊病逝，在巴蜀之地各隻明軍彼此都不服氣。
其中以楊展實力較為雄厚，楊展是崇禎年間武進士，數次擊敗張獻忠，也有被張獻忠俘虜，即將斬首時，從斷頭台逃生的奇跡，他和另外一個將領王祥不和，兩軍大打出手，其他在四川等地明軍將領也是心生間隙，彼此拆台。
突圍到貴州的大西軍殘部，也在孫可望，李定國等將領帶領下重振兵馬，在湖廣西部的何騰蛟最幸運，他的部隊幾乎被打光，要不是忠貞營殘部在苦苦支撐，早就被清軍連根拔起，清軍撤退以後，他以湖廣總督名義繼續統治湖廣南部地區，兵力也有所恢複，這一次他再也不會輕視忠貞營力量，和堵胤錫兩人大力整頓兵馬，形成以忠貞營為主要力量的軍事力量。
各路兵馬都在蓬勃發展，唯有在梧州的永曆帝，卻陷入兩難境界，朱由崧在福建複位，按照繼承順序，朱由崧和崇禎關係最親近，現在朱由崧在福建重新登基，他這個皇帝名不正言不順，很是尷尬，大臣瞿式耜，王化澄並不相信朱由崧還活著，很有可能這個朱由崧是一個冒牌貨，兩人建議永曆帝繼續以天子名義發號施令，永曆帝朱由榔隻好坐在皇位上，繼續以天子名義，召集文武百官到廣西。