大戰迫在眉睫，定國自知生靈塗炭已是在所難免，然而大明中興在此一搏，卻又不得不為之。在矛盾的心理下，定國遂命人刊刻佛家經懺五千六百二十四卷，供奉於各處寺廟，受持散布於十方，以此祈求上天庇佑蒼生，同時寄望此次出師能夠一帆風順。
臨近出征，定國又帶著高文貴、靳統武等一幹親信諸將來到高州城西郊的觀山寺中祈福禱告，在焚燒了一道祈福文書後，定國旋即來到大雄寶殿，對著佛祖虔誠膜拜，許願若是此戰能夠順利收複廣州，定重修廟宇，再塑金身。
直等到定國禮畢起身，寺中方丈方才迎上前來，恭敬地雙手合十道：“阿彌陀佛，西寧王誠心禮佛，我佛慈悲，定會護佑我大明將士，所向披靡，恢複漢家天下。”
定國趕忙也跟著雙手合十，客客氣氣地說道：“定國惟願佛祖保佑我出師清吉、人馬平安，百姓能夠早日遠離戰火，安居樂業。”
方丈聽後，不禁由衷地感佩道：“阿彌陀佛，佛法無邊，心誠則靈！西寧王掛念天下蒼生，實乃天下百姓之幸事！”
定國卻是搖了搖頭，一聲歎息道：“方丈所言差矣，定國無能，征戰數年一無建樹，辜負天下百姓重托，以致胡騎屢屢南侵，奪我家園，殺我父母，欺我姐妹！此間種種，皆吾之過也！每當念及至此，皆心如刀絞，無法自已！”
方丈見定國黯然神傷，連忙勸慰道：“世間萬物，豈有事事都能隨心如意？不過是盡人事而聽天命罷了！西寧王您也不必太過自責，待大軍凱旋之日，若有閑暇，不妨再來敝寺小住幾日，共習佛法，想必能夠有所感悟。”
定國依舊思緒難平，遂與方丈來到禪房，二人促膝長談了整整大半日，直至心中困惑盡數解開，方才起身告辭離去。
九月初三日，定國命義軍水師陳奇策部自西江進占江門，擊斃清廣東水師總兵蓋一鵬，徹底斷絕了廣州與新會之間的聯係。
尚可喜聞訊急遣右翼總兵吳進忠率部前往新會增援，然而明軍扼守江門，並於江岸兩側築起炮台，向著清軍援軍猛烈轟擊。吳進忠連攻數日皆無法突破明軍江門防線，隻得悻悻退回了廣州。
見吳進忠無功而返，尚可喜與耿繼茂為盡快恢複與新會的聯係，不得不於九月十二日親率三萬精兵，水陸並進，來奪江門。
江門的水道既淺又窄，加之明軍又在河中布滿暗樁，清軍大船無法進港，隻能挑選小哨船步步為營，拔樁而進。
在基本清除了航道上的暗樁後，清軍水師遂大舉壓進，與明軍大戰於江門。
明軍初戰失利，折損精銳三百餘人，並失去了五條大船，還有大炮十二門、小炮五十三門。趁著明軍稍退，清阿達哈哈番劉秉功迅速帶領著三千援軍進入了新會。
此時，定國也從高州抵達了興邑，他再次修書一封，派遣信使隨鄭成功使者李景一同返回廈門，約其共取新會。
書雲：“孟夏遣使帆海，詣鈐閣，悉機務，並候興居，擬閱月可得旋。不圖至今尚棲遲貴壁。今差員李景至，始知前此籧使林祚者，固不知所下落也。不穀駐師高、涼，秣勵養銳，惟候貴爵芳信，即會轡長驅，以成合擊；蓋不欲俾虜有隻蹄遁耳。乃七月中旬又接皇上敕書，切切以恢東為計。君命不俟駕，寧敢遲遲吾行哉！爰遣水陸二師，齊發新、肇，托祉有初，兩見成績。蓋殄虜於長洋，敗李酋於端水。而會城兩虜恃海攖城，尚稽戎索。茲不穀已駐興邑，刻日直搗五羊。然逆虜以新會為鎖鑰樞牖，儲糗攸資，是用悉所精神，援餉不絕。不穀之意，欲就其地以芟除，庶省城可不勞而下，故亦合力於斯。在彼望風屏息，遵陸知難，遂恃長舸艦，堵我舟師。非藉貴爵星言發夕，其誰收此一捷也。企慕甚殷，宜有關切。至於粵東水師官兵抗虜、降虜者，莫不密遣告勞。然詳所舉止，多倫觀望。不思羊城底定後，雖頻年抗節，而不千裏勤王，亦何夙績之足道哉！惟貴爵為宣此意，以慫恿各部，則五等上下，庶知國恩祗報在茲，而不謂不穀之功罪可混也。至援虜之來，向亦各聞其概，然通盤策虜，再無敬謹之強且精者，今安在哉！誠來，當盡縛以報知己。其楚、豫之間，偵使頻繁，大略粵事諧而閩、浙、直爭傳一檄。所謂張侯爵鼓楫而前，要知亦緩於今日發粵之舉。時乘其所急，名高於易收，執事寧忍置之？差員稱：貴爵從潮、惠脂車，則當以初冬為的，其水部必以速臨新邑為限。均希相要旦旦，足仞至誠，雲台虛左，不穀實厚冀於公也。暫複，不備。”
定國之所以把會師地點選在新會，乃是經過深思熟慮的，新會瀕臨南海，河網縱橫，自己雖有廣東義師水軍接應，但畢竟實力不能與清軍的廣東水師相提並論。而新會是廣州南麵的門戶，戰略位置十分重要，若想取廣東，必先取廣州，若想取廣州，又得先拿下新會。
從另一方麵來說，此時攻打新會乃是千載難逢的時機，上回清廷派來的援軍在攻破潮州後，便已班師回朝，如今廣東本地的清軍兵力捉襟見肘，在全國各地抗清運動風起雲湧下，順治帝手中根本沒有多餘的兵力可以前來增援。若鄭成功派一支艦隊從海上來攻，就能夠一舉擊潰清軍廣東水師，水陸夾擊收複新會，然後乘勢進取廣州，故而此戰的關鍵，就在於鄭成功的水師能否及時趕到。