盡管孫可望在貴州全力備戰，然而除了少部分心腹死黨外，他進攻雲南的計劃卻並不能夠獲得部下的真心支持，畢竟雲、貴兩軍，同根同源，皆出自大西軍一脈，沒有多少人願意為了孫可望一己之私同室操戈。
就在此時，孫可望任命的兵部尚書程源、都察院鄭逢元突然來到貴陽大興寺，探望被囚禁於此的原四川巡按錢邦芑。
先前，錢邦芑由於對孫可望心懷不滿，屢屢拒絕出任其官，更是在孫可望的逼迫下，不惜削發為僧，取法名大錯。孫可望知其隱居僻處，仍不死心，又命人前去相勸，哪知錢邦芑卻回詩答道：“破衲蒲團伴此生，相逢誰不訊孤臣？也知官爵多榮顯，至恐田橫笑殺人。”
孫可望勃然大怒，立即派人前往捉拿錢邦芑，把他關了起來。盡管坐困於此，可錢邦芑的消息卻是靈通，在風聞孫可望即將進犯滇都之後，他不禁憂心忡忡，今日正好見程源、鄭逢元前來問計，經過一番試探，知其二人皆都忠於永曆帝，錢邦芑於是便將自己心中構思已久的計劃和盤托出：“馬進忠、馬寶、馬惟興三位將軍，以同姓相密，與鞏國公多有交情，雖隸屬秦王麾下，然皆朝廷舊勳故臣，受國恩頗重，他們曾與貧僧談及此事，盡是忿忿之色，皆言愁圖報朝廷而無路也。至於秦王標下，惟鞏國公心向朝廷，貧僧曾與之私誓，相約決不相負。今秦王欲取雲南，必用此數人為將，隻須從中用計，打敗秦王可謂易如反掌！然貧僧被幽禁在此，無法外出，隻能勞煩二公代為轉達了。”
二人大喜，遂拜別了錢邦芑，匆匆從大興寺出來，直奔白文選府邸，向他轉告了錢邦芑之言，旋即又馬不停蹄地去見了馬寶，與其定下行事方案，並托馬寶勸說孫可望歸還白文選兵權，委以重任。
貴陽城中暗潮洶湧，可孫可望對此卻是一無所知，他認為自己穩操勝券，甚至命人預先打造了扭鎖三百副，打算等到大軍攻破滇都之日，以此囚禁永曆君臣返回貴陽。
定國在得到細作從貴陽傳來的密報後，深感獨木難支，急奏請永曆帝道：“秦王反形愈顯，恐不日便將進攻雲南，如今朝廷缺兵少糧，而秦王勢大，諸臣皆懼，更有秦王舊部暗中串聯，謀奪滇都。臣請皇上降旨，速召蜀王回滇，以禦強敵。”
永曆帝心中恐懼，臉色不由大變，擔心一旦城陷，自己性命不保，慌忙頒下諭旨，急召文秀領兵入衛。
自從入川以來，文秀不斷派兵攻略附近州縣，廣積糧草，漸漸有了些許起色，他本打算以此作為抗清的根據地，沒想到頭尾才不到一年光景，永曆帝居然又命自己返回雲南。
眼見心血付諸東流，文秀自是心痛不已，忍不住仰天長歎道：“吾本待在此屯兵積糧，養精蓄銳，而後光複大明，不料內亂叢生，禍起蕭牆，大明危矣！”
然而君命不可違，在無奈之下，文秀也隻能是揮淚別川，率軍退回了滇中。
與此同時，清平西王吳三桂也得到了明朝內訌一觸即發的密報，他深知這是徹底消滅盤踞於西南一隅永曆朝廷的最好機會，當即親自趕往廣西桂林，召開軍事會議，與尚、耿二藩商討進兵之策。
清廣西提督線國安率先在會上發言道：“末將以為可以趁著明朝內訌之際，兵分兩路，同時進攻貴陽、昆明，徹底剿滅永曆小朝廷，活捉朱由榔！”
待線國安把話說完，靖南王耿繼茂又接著說道：“本王倒是以為不必急於出兵，盡可以等到孫、李二人打得兩敗俱傷之時，再坐收漁利，如此方為上上之策！”
平南王尚可喜不禁點頭稱是道：“本王讚同靖南王之策，如此一來，咱們即可以坐收漁利，又可以減少我軍傷亡，可謂是一舉兩得！”
諸將也都紛紛跟著表示附和，吳三桂見大家全都是這個意思，於是決定道：“既然如此，且傳本王軍令，各營回去之後，抓緊籌備軍械糧草，以逸待勞，隻等時機成熟，立刻兵分兩路，一舉生擒朱由榔，不得有誤！”
“謹遵平西王令！”諸將齊聲高喊一聲，旋即各自離帳散去。
就在清軍蠢蠢欲動之時，孫可望卻為了集中全力對滇用兵，不斷從各州縣抽調兵馬，對於清軍可能發起的進攻，根本無暇顧及，一時間，貴州門戶洞開。
吳三桂見有機可乘，遂派出一小股精銳，試探性地逐步向貴陽方向逼近。然而孫可望居然選擇性地忽視了這份軍報，仍舊決定繼續出兵，進攻永曆朝廷。
大戰在即，孫可望原本是打算委任馮雙禮為征逆招討大將軍，可馮雙禮卻力辭不就，馬寶借機對孫可望建言道：“正所謂使功莫如使過，毓公將軍受恩有年，威名服眾，軍中可為大將者無出其右也。末將以為，欲要攻滇，以毓公將軍為帥最為合適。”
孫可望仍心有顧慮：“話雖如此，然其畢竟違抗過孤之軍令，孤又如何能夠放心使之為將？”
馬寶看出孫可望有所動搖，於是接著勸說道：“當初毓公將軍於雲南受封，屢辭不允，亦是勢不得已，並非出於真心。今秦王若能重加爵賞，委以大任，其當必感恩圖報也！”