軒轅在得到了九天玄女的幫助後，逐漸地掌握了人族的大權，平定了人族中不滿的心聲，在這個過程中軒轅深深地被九天玄女那驚人的才華與氣質氣吸引，九天玄女則利用軒轅的好感在人族中傳播天庭的存在，讓人族感受天庭的威嚴。
至到此時廣成子方才清醒過來，明白自己犯下了大錯，竟然讓天庭插手到人族的事務中來，可是現在他想阻止也為時已晚，人族已有少數人開始對天庭產生了好感。
就在廣成子不知該如何是好的時候，玄都大|法師奉太上老君之命下凡，賜於軒轅後天功德至寶‘軒轅劍’，此劍是以首山銅合功德玄黃之氣所鑄，可鎮壓人族氣運，玄都大|法師在下界之時元始天尊讓其傳話於廣成子，小心防備九天玄女，盡早結束與蚩尤的爭鬥。
元始天尊之所以沒有提示廣成子如何破解蚩尤的‘玄陰大陣’是因為天庭既然插手了人皇之爭，那麼就不能白得好處，怎麼也要出一點力，九天玄女不是想用夔牛獸鼓與周天星鬥之力來破陣嗎？那正好成功了闡教可以順利地解決蚩尤，而巫族的怒火也會轉移到天庭之上，不成功那麼這主意是你九天玄女所出，後果自然由你負責。
廣成子在得到元始天尊的提示後，心情十分的複雜，正是因為自己等人的無知，才使得人皇軒轅一步步走入了天庭的陰謀之中，現在他雖然也想提醒軒轅不要輕易相信九天玄女，可是已為時太晚，軒轅已經被九天玄女給迷惑住。
天庭之上玉皇大帝與西王母見九天玄女如此容易就得到了人皇軒轅的信任，也是十分的高興，天庭終於在人族中有了一定的地位，雖然還比不了聖人但這也是一個不錯的開始。
廣成子明白如果不快點結束人皇之爭，那麼隨著九天玄女的宣傳天庭的名字將會深入人心，這對日後他們傳教會造成不必要的麻煩。
廣成子在與闡教諸仙商量之後，便開始鼓動軒轅早日出兵平定蚩尤及他的九黎部落，也好早日讓九天玄女離開人族。
九天玄女是個聰明之人，在見到闡教諸仙的這一舉動後立即明白對方看穿了自己的意圖，如果不是顧及軒轅恐怕自己難逃闡教諸仙的毒手，如今她已經完成了玉皇大帝的詣意，所以並不想與闡教諸仙發生衝突，也順水推舟鼓動軒轅早日出兵平定蚩尤，闡教諸仙見九天玄女如此知趣也放心了許多。
人皇軒轅在上次被蚩尤伏擊之後，便考慮到人族士兵沒有闡教諸仙那樣的神通，無法在‘玄陰大陣’中辯別方向，於是便在九天玄女的提醒下創造出了‘指南車’，有了‘指南車’人族大軍就不會再受‘玄陰大陣’的迷惑。
在準備好一切之後，軒轅一聲令下，人族大軍再次開拔向蚩尤所在的九黎部落殺去。
這一戰是決定勝負的一戰，自從廣成子殺了夔牛獸後，女媧娘娘便取消了對龍族的命令，四海龍王理所當然收回了大軍，可是應龍不滿當時龍王的決定便脫離龍族加入了軒轅大軍，人族大興乃是天道大勢，軒轅為人皇四海龍族也不敢在此時與之鬧翻，免得得罪了闡教諸仙，於是也就沒有對應龍進行抓捕。
經過了數次的失敗，軒轅也明白蚩尤的厲害，所以人族大軍一路上是小心依依，生怕再次受到蚩尤的伏擊。
軒轅大軍一動，蚩尤便已知曉，這時九黎部落也做好了戰鬥的準備，蚩尤明白這一戰是他與軒轅之間決定勝負的一戰，所以九黎部落也是傾盡全力，蚩尤並不想過於背動，在軒轅大軍出動之後，也率領大軍出擊，準備給軒轅應頭一擊。
軒轅大軍終於與蚩尤的九黎部落大軍在涿鹿平原相遇，如今軒轅大軍有廣成子等闡教諸仙相助，九黎部落有蚩尤、九鳳、河伯、雨師等幾位大巫。實力倒也相差不大。
軒轅一騎當先，對蚩尤說道：“蚩尤，我為人皇乃天下共主，你竟然以下犯上還勾結巫族，難道你想讓人族天下變成巫族天下麼？”
蚩尤冷笑一聲，說道：“軒轅，你那人皇之位不過是幾位聖人所商量的，人族眾多部落可曾都承認過你那人皇之位？天地乃是巫族父神盤古所開，在巫妖統治大地之時巫族也曾照顧過我人族，祖巫後土化身六道輪回，這是何等的造化，所以我請巫族相助也算不得過分之舉，而軒轅小兒，你這人皇之位卻是名不正言不順，隻是依靠著闡教諸仙強行霸占著而已，他們又為我們人族做過什麼？”