李克用帶兵回到晉陽，馬上上表給僖宗李儇要求討伐朱溫。他在給皇帝的表章說：“臣討黃巢立有大功，而中了朱全忠的陰謀，臣僅以身免，將佐以下三百多人被殺，符命、印信都被劫走。朱全忠還在東都、陝州、孟州造謠說臣已死，使得臣的行營兵潰散，更調遣軍馬攔截殺戮，不使逃脫，將士們都哭述冤情，要求複仇。臣以為朝廷是公平的，因此回歸本道，等待詔命。請求朝廷派大員過問此事，發兵討伐朱全忠。臣已命臣弟克勤帶領壹萬騎兵在河中待命。”
朝廷接到李克用的表章，都很惶恐，認為大寇初平，不可輕啟戰端，於是派出中使替兩方和解。李克用八次上表，稱：“朱全忠妒功疾能，陰險狡詐，異日必為國患。惟乞削其官爵，臣請自帥本道兵馬討之，不用度支糧餉。”僖宗隻好派與李克用關係很鐵的楊複恭去勸阻李克用，又答應了割麟州屬李克用管轄和任命其弟李克修為節度使的要求，並封李克用為隴西君王才算罷休。此時楊複光已病死，楊複恭是楊複光的弟弟，同樣是僖宗身邊大太監。
李克用多次上書朝廷要討伐朱溫，可朱溫卻沒時間和李克用打筆墨官司，他正麵對著一個無比凶惡的敵人，這人就是原蔡州刺史秦宗權。秦宗權原屬忠武軍，是節度使周岌的部下，黃巢從長安撤出後攻打蔡州，秦宗權投降了黃巢，跟隨黃巢攻打陳州。黃巢死於狼虎穀，可秦宗權的隊伍卻沒有受到很大損失，他反而收羅了不少黃巢的敗兵，變得更強大起來。秦宗權要擴大地盤，就不斷的侵擾鄰鎮，朱溫的汴州首當其衝。
秦宗權是一個非常殘暴的人物，他野心很大，盤踞蔡州，是繼黃巢之後第二個與大唐對著幹，自稱皇帝的人物。他派出大將陳彥去攻擊淮南；秦賢去打江南；秦誥攻陷襄、唐、鄧等地；孫儒攻陷東都洛陽、孟、陝、虢等州；張晊攻陷汝州和鄭州；盧瑭去攻擊汴州與宋州。秦宗權的隊伍所過之處燒殺搶掠，無惡不作，使得許多地方成了無人區。秦宗權的軍隊缺乏軍糧就去殺人，把屍體用鹽醃起來放在車上隨軍充作軍糧。
公元884年秋七月，秦宗權帶兵來攻打汴州，朱溫感覺自己的力量對付秦宗權力量單薄，於是他派人去請天平節度使朱瑄前來助戰。朱瑄有一位堂弟朱瑾，手中一杆镔鐵大槊，有萬夫不擋之勇，朱瑄就派他去救援朱溫。有了朱瑾的援兵，朱溫在合鄉打敗了秦宗權。朱瑄是宋州人，離朱溫家鄉蕩山不遠，與朱溫又是同姓，朱溫為了感謝朱瑄兄弟，就與他們聯宗，稱朱氏兄弟為兄。
正當朱溫與秦宗權打得不可開交的時候，感化軍節度使時溥派使者來到成都，向僖宗李儇獻上黃巢及妻子兄弟的首級，同時也帶來了活擒的黃巢的眾姬妾，李儇登大玄樓接受貢獻。李儇問這些女人：“你們都是本朝勳貴子女，世受國恩，為什麼從賊呢？”為首的姬妾答道：“狂賊凶惡，國家以百萬之眾，丟下祖宗基業，逃到巴、蜀，今陛下以不能拒賊責問一女子，置公卿將帥於何地？”李儇非常生氣，下令把這些女人都殺掉。許多人由於同情送酒給她們喝。其他女人都喝了酒，隻有為首者不飲不泣，直到受刑，神色不變。