在九尾人柱力漩渦玖辛奈即將分娩之時，木葉高層相當重視。因為女性人柱力在懷孕期間，封印抑製尾獸的能量都去用來孕育胎兒，會導致封印減弱，之前水戶分娩的時候封印就差點解開。
三代提議將產房設置在村外，並由嚴密的結界和眾多直屬火影管轄的暗部高手保護。
三代之妻猿飛琵琶湖與另一位暗部女忍田路擔任接生婆，同時水門也會在旁邊陪同保護玖辛奈並保住封印不被解開。
一切準備就緒後，玖辛奈與琵琶湖開始前往村外，途中遇到好友宇智波美琴，與其聊天，得知美琴懷中所抱的嬰兒正是已出生兩個多月的宇智波佐助。
玖辛奈希望將來鳴人能和佐助成為好朋友，但兩位媽媽誰也沒想到鳴人與佐助會掀起翻天覆地般的巨變以及他們之間會產生深深的羈絆。
在產房中，九尾數次想要衝破封印，但都沒成功。最後玖辛奈有驚無險地生下了一個健康的男嬰——鳴人，水門為此高興地流下了眼淚。
而在產房外，眾多暗部忍者卻被前來尋釁的一個自稱為“宇智波斑”的“麵具男”悄無聲息地秒殺，隨後“麵具男”用時空忍術穿透岩壁進入產房，瞬間殺害了兩位接生婆後奪走了鳴人，並用卑鄙的手段強迫水門帶著救下來的鳴人用飛雷神之術離開了玖辛奈的身邊，而玖辛奈的封印尚未修複完成。
隨後“麵具男”再度用時空間忍術將玖辛奈帶到室外某地方，告訴玖辛奈此事他早就蓄謀已久，要用九尾來摧毀木葉。
隨後“麵具男”便用寫輪眼控製九尾衝破了封印。
尾獸被抽出，但玖辛奈並未立即死亡，因為她擁有漩渦一族的強悍體質，這令“麵具男”都感到驚訝。接著“麵具男”操縱九尾攻擊玖辛奈，玖辛奈幸運地被水門救下。
之後水門將極度虛弱的玖辛奈帶回家安頓好，玖辛奈抱著睡著的鳴人哭泣，水門換好衣服便急赴木葉村。
而“麵具男”先到一步，將九尾用通靈術通靈過來，引發災難。三代組織人馬奮起抵抗，趕赴到現場的水門用時空間結界術轉移走了九尾的尾獸炮。
緊接著水門與“麵具男”交戰，並憑借出色的謀略分析出他的弱點進而擊退了他。之後再度回到木葉，看到木葉的慘狀，聯想到“麵具男”的野心，心中默念：“對不起了，玖辛奈。”
隨後將正在準備發射第二發尾獸玉的九尾連同自己一起瞬移到自己家附近，同時帶出玖辛奈和鳴人，準備將九尾再度封印。
玖辛奈用查克拉鎖鏈勉強將九尾捆住並製造出結界，但卻因身體已經達到了極限而吐血。
鳴人被吵醒後哇哇大哭，她用無比溫柔的眼神望著鳴人說，對不起，不是故意把他吵醒的。玖辛奈的覺悟，是想用僅存的查克拉跟九尾同歸於盡，以保護水門和鳴人。
當她強忍痛楚，微笑著說謝謝水門為她所付出的一切時，水門心中無比愧疚，怪責自己受到玖辛奈那麼多的幫助，但他到最後卻沒能夠很好地保護母子倆。