李世民沒有立即回答父皇，而是扭臉向身邊的尉遲敬德使了個眼色。尉遲敬德馬上會意，上前一步，向李淵一拱手，聲若洪鍾地回稟道：
“回稟皇上，太子、齊王於玄武門作亂，秦王起兵討之。”
“什麼？”李淵大吃一驚，厲聲問道，“太子、齊王現在何處？”
“俱以授首！”尉遲敬德回答句，說著把用戰袍包好的兩顆首級遞給李淵，“請皇上過目！”
這突如其來的變故像晴天一霹靂，震得李淵目瞪口呆，一時間竟說出話。他伸手扶著畫舫的廊柱渾身發抖，兩眼死死地盯著李世民，半天才咬牙怒道：
“你……你心真狠，竟敢對自己的兄弟下手！你殺了建成和元吉，不就是為了太子之位，為了坐上朕的皇位嗎？既如此，你何不早對朕說，啊！”
“父皇，請恕兒臣之罪！”李世民慌忙伏地叩首，辯解道，“兒臣並非為了太子之位，更不敢覬覦皇位，而是為社稷著想呀。太子不治常檢，荒色嗜酒，為天下人所詬，而齊王凶惡乖張，有謀反之心……”
“好了，你不要再當著朕的麵詆毀中傷自己的大哥和四弟了！”李淵忿然打斷道，“你想入主東宮之心路人皆知，朕又豈能不知，何必在此信口雌黃！”
此時，李淵對麵前這個活著的兒子充滿了敵意和仇恨。這種情緒使他根本不想聽對方的任何解釋，因為這場政變是由這個野心家發動，它不僅讓自己的所有計劃落空，而且還失去了兩個自己疼愛的兒子。這種打擊使他失去了應有的冷靜和理智，他衝著李世民怒斥不已，真想一刀劈下他的狗頭。
好在裴寂並沒有像李淵那樣被憤怒衝暈了頭腦，他清醒地認識到這場政變秦王取得了全麵的勝利，整個皇宮已被他牢牢控製住，倘若激怒了他，後果將不堪設想。不錯，他既然敢殺自己的親兄弟，那麼再前往走一步殺掉了自己的父親又有什麼不可能。此時此刻的秦王已經把君臣之義、骨肉之情完全拋在了腦後，他的思想裏隻有順我者昌逆我者亡的強盜邏輯。這……這實在是太可怕了！麵對這種情形，裴寂以為隻有識時務地退讓，才能保住皇上及自己的性命，否則很有可能會死在秦王那把沾滿血跡的刀下，跟隨太子和齊王共赴黃泉路。這麼一想，他便上前一步，拱手勸諫李淵道：
“皇上，秦王之言甚是有理。太子、齊王自晉陽起兵以來，沒有什麼功勞，反而妒忌秦王，肇禍蕭牆。秦王功蓋宇宙，內外歸心，今大義滅親，皇上宜趁此立秦王為太子，委以國事。如此，皇上便可高枕無憂，頤養天年了。此事緊急，請皇上三思呀！”
“你……裴寂，你怎麼能說這種話？”李淵見自己的寵臣也轉向替秦王說話，不由得又驚又怒，“裴寂，你難道也如此不明是非曲直嗎？你何故如此！”
“皇上，臣非不知其中曲直，實為皇上安危著想啊！”裴寂瞟了眼麵前一臉殺氣的秦王府兵馬，含蓄地答道，“皇上，你看秦王身邊的將士多威猛啊！”
李淵聽裴寂如此一說，慌忙掃了圈圍著自己的秦王府兵，看到他們手執刀劍殺氣騰騰地樣子，心頭不由一陣惶恐。到這時候，他才感覺到自己已身處險境。他清醒地意識到，如果自己再繼續得罪跟前這個透著殺氣的兒子，就恐怕要步建成、元吉他們的後塵了。他終於明白了裴寂的良苦用心，老眼裏閃著感激的光，對剛才指責他感到幾分愧疚。是呀，事已至此，他再不情願也隻能接受這筆以權換命的交易。他努力壓製住自己胸中的憤恨，使自己漸漸冷靜下來。沉吟良久，他最終接受了裴寂的主張，提起筆，用微微發抖的手寫下了手諭，同意立秦王為太子，並將國事委以他。
李世民看著父皇一筆一畫地寫著詔書，心裏樂開了花，想自己終於如願以償了。不過，當裴寂將詔書恭恭敬敬地遞到秦王手上時，他卻撲通一聲跪在地上向父皇磕頭謝罪，再三請求父皇收回成命。李淵知道這個詭計多端的兒子是在跟自己演戲，目的是為自己掩飾所有的罪行。他用憤怒而輕蔑地眼光瞥了秦王一下，嘴角邊浮出冷笑。默然會兒，他方開口勸兒子接受自己的委任。李淵三請之後，李世民才假惺惺地謝過父皇，接受了他的聖旨。
緊跟著，李世民又向父皇請求手敕，命令所有軍隊一律聽從自己的處置。李淵見兒子如此步步緊逼，加上喪子之痛，未免心灰意冷，萬念俱灰。他無奈地長歎一聲，然後又提筆寫了道手敕，並親自交到兒子手上。等李世民不再吭聲後，他便有氣無力地朝裴寂及侍衛們揮了揮手，示意他們護送自己回宮。
李世民拿到父皇的敕書，心頭一喜，當即就命尉遲敬德拿著皇上的手敕從東上閤門向全體將士宣讀，以安定人心。與此同時，黃門侍郎裴矩趕往東宮曉諭諸將士。如此一來，很快京城的局勢就穩定了下來。
為了斬草除根，隨後李世民又領著尉遲敬德、侯君集、段誌玄等人來到東宮和齊王府，將李建成和李元吉的兒子全部搜出來斬了。殺了這麼多人，李世民還覺得不過癮，又打算把李建成和李元吉的親信百餘人抓來統統殺掉，沒收他們的家財以犒勞將士。眾將聽了，一個個摩拳擦掌，躍躍欲試。