至於剩下的張獻忠的那些部下，大部分在接到了張獻忠的親筆信之後，都選擇了投降刑天軍，其中包括艾能奇和劉文秀兩人，還有前營將軍二虎、右營將軍賀國觀等人，也都投降了刑天軍，隻有少數人不願意投降，但是這些人也成不了什麼氣候，肖天健暫時也沒興趣去收拾他們了，放在以後，等平定了湖廣之後，再收拾他們也不遲。
如此一來，肖天健便以迅雷不及掩耳之勢，輕鬆的將張獻忠這個大麻煩給解決掉了，同時還順手將湖廣的西北部包括穀城、保康、南漳、興山、房山等縣，也納入到了刑天軍的轄地之中，下令各部抽調一小批人馬去接收這些地盤，負責在這些地盤組建當地的預備營駐守，同時也委任了一批臨時性的文吏對這些地方進行管理。
至於張獻忠麾下來投的幾萬人馬，肖天健對他們統一進行了甄選，兵油子一概不要，痞兵一概淘汰，以刑天軍選兵的標準進行挑選，留下了七千餘人，其餘的兩萬多人則都就地遣散，安排他們落地為民，去幹回他們的老本行，繼續種田去了。
而對於張獻忠，肖天健是不會將他和羅汝才相提並論的，表麵上對他很是客氣，但是卻實質上將他軟禁了起來，考慮到襄陽一帶他的舊部太多，可能會生出事端，所以在整編過他麾下的兵馬之後，便將張獻忠全家都遷至晉南找地方編管起來，榮華富貴不敢保證他繼續過了，起碼暫時先保證他全家生命安全，讓他們吃飽穿暖即可，對於肖天健這樣安排他，張獻忠雖然滿心不樂意，但是也沒敢放個屁，隻得老老實實的被一隊近衛“護送”著上路，一路上朝著山西行去，如此也徹底切斷了他和舊部之間的聯係，生的他的舊部再有什麼念想了。
當然不得不提一下徐以顯和潘獨鼇這兩個人，肖天健在俘獲了張獻忠的時候，也同時將他們二人一同俘獲，私下裏將他們招至了帳中聊了一番，發現這兩個人還算是比較有用，要不然的話也不會被張獻忠倚重，於是對他們安撫了一番，問他們有什麼想法，是去是留。
兩個人到了這會兒，也都被刑天軍的強大所震懾了，他們這樣的文人之所以“從賊”，其實都不是安分之人，就是想在這亂世之中，幹點出人頭地的事情，眼下他們都是朝廷要抓要殺的人，張獻忠已經完了，這不用想了，他們這樣的人才不會跟著張獻忠一條路走到黑的，同時他們也都發現肖天健其實不是那種心慈手軟之輩，比起張獻忠來，更有英雄之氣，現在讓他們自行決定去留，其實就是看他們兩個的表現。
去那是胡扯，能去哪兒？這天下現在還能數得著的幾路人馬，也就僅剩下了李自成一路還算是聲望高一點？可是他們兩個人輔佐張獻忠的時候，都和李自成有過間隙，故此去根本沒地方可去，所以兩個人也都隻能選擇留下來，跟著肖天健幹，雖說在刑天軍之中，他們的地位可能會比跟著張獻忠時候要低很多，但是好歹也可以混下去，於是二人都立即跪下向肖天健稱罪，表示願意自此之後追隨肖天健。
對於他們兩個的投靠，肖天健當然是笑納了，其實在肖天健內心之中，這兩個人隻要說走，他就會立即派人幹掉他們，這樣的人留給其它人也是禍害，絕對不能放走，至於他們兩個也很明智，選擇了留下來，於是肖天健便令他們也暫時做隨軍參議，也就是參謀的幹活，歸於李信的參謀部暫時聽命，以後看他們的強項，再決定他們是主民務還是軍務。
這一次滅了張獻忠，肖天健還繳獲了張獻忠不少的戰馬器甲，當然這些年來，張獻忠南征北戰斂財頗多，雖然在穀城蟄伏期間，花掉了不少，但是好歹張獻忠還有幾十萬兩銀子的存貨，也都被肖天健笑納了。