至於左良玉，雖說被人護著上了船，可是沒有能逃出多遠，便被越來越多的叛軍控製的船隻給堵住了去路，在肖天健巨額懸賞之下，這些參與叛亂的官兵們，無不爭先恐後的上去廝殺，試圖抓住或者殺掉左良玉爭功，雖然左良玉的手下們也拚了命的抵抗，可是殺退一波便又圍上來一撥，剛開始這種廝殺還是無組織自發形成的，可是後來逐漸越來越多的船隻圍上來，將左良玉帶著的幾條船圍得是裏三層外三層的，楊昆山和劉江都趕到了這裏，開始指揮圍攻左良玉的船隻。
幾條左良玉手下控製的船隻被包圍在中間，四麵八方箭如雨下，不時的有人中箭倒在船上抑或是翻落在江水之中，不管他們如何拚殺，始終都無法透圍而出，左良玉也瘋狂了，在戰船上指揮手下拚死抵抗，可是很快便矢盡彈絕，隻能盡可能的阻止叛軍靠幫跳上他們的船隻。
一番激戰下來，左良玉手下死傷慘重，雖然也殺傷了不少的叛軍，可是他們的幾條船都開始被叛軍的火箭點燃，左良玉也身負重傷，倒在了船上，逼得左良玉仰天大叫：“天亡我也！”
隨即大批叛軍開始湧上了他們的船隻，刀槍並舉的朝著左良玉和他殘存的幾個手下撲了過去……
荊州之戰直到七月二十三才算是徹底結束，這一戰下來，刑天軍將左良玉所部徹底全殲在了荊州一帶，隻有極少數的左良玉的手下潰圍而逃，但是自左良玉一降主要的部將，皆被刑天軍陣斬抑或是抓獲。
左良玉在江麵上被楊昆山和劉江指揮的叛軍所殺，他的屍體當天下午被送回到了荊州城中，交給了肖天健，肖天健帶傷檢視了左良玉的屍體，確認無誤之後，當場兌現了他的懸賞，賞了幾個最後殺掉左良玉的六個人每人二百兩銀子，但是因為局麵太亂，左良玉被砍得滿身都是傷口，還有不少箭傷，也認不清誰才是真正殺掉他的人，所以營將之說就免談了，凡是參與圍攻左良玉的人，每個人都賞銀二十兩，算是作為補償，使得這些叛軍上下無不高興萬分。
至於左良玉的家眷，基本上都被燒死在了船上，而他的兒子左夢庚則被幾個叛軍當場格殺，人頭也被找到，送至了荊州城之中。
可以說荊州一戰，左良玉全家基本上被滅門，以後根本不用再擔心左良玉這一家人再折騰出什麼浪花了。
而除了左良玉和他家人之外，左良玉手下諸將基本上也沒有跑掉，不是當場死於亂軍之中，便被刑天軍抓獲，跑掉的可以說是屈指可數，即便是跑掉一些，以後這些人也都嚇破了膽子，諒他們不敢再興風作浪跟刑天軍為敵了。
此戰共斬殺左軍近萬人，說是一場屠殺也不算過分，徹底將左良玉集團給殺了個血流成河，染紅了荊州的長江江麵，許多屍體沉入了江中喂了魚無法考證，但是起碼可以保證，殺人盈萬是沒有一點問題的。
而刑天軍這邊損失則有千餘人左右，陣亡四百多人，傷五六百人左右，其中重傷二百餘人，損失也相對來說是比較重的一次，基本上趕上襄陽一戰的傷亡數量了，可見這一場仗打得是相當慘烈。
除了左良玉所部被屠之外，此次攻占荊州，還生擒了被分封在荊州城的惠王以及惠王的全家，這個惠王也算是倒黴到家了，攤上了個左良玉這樣的家夥坐鎮荊州，多次被左良玉敲詐，王府在城破之前，還被左良玉以籌措餉金為由，派兵衝入王府洗劫了一番。
對於這個惠王，肖天健念在他在荊州為禍不深，也就饒了他一命，沒收了惠王的家產之後，將其和他的子女妃子們遷至保康縣安置，貶為平民之身，令其自耕自織，以後不要再想過安逸、豪奢的日子了。
雖然肖天健在荊州城下中了幾箭，但是好在他身上披有重甲，傷勢很輕，基本上沒有影響到他的活動，但是也正是他這樣的舉動，一是爭取到了民心，二是徹底激怒了刑天軍上下兵將們，也更獲得了兵將們的人心。
隻可惜了他的那匹愛馬，在馱著肖天健回去之後，傷勢過重，兩天之後死在了軍中，讓肖天健好是傷心了一番，這匹黃驃馬已經跟隨他好多年時間了，跟肖天健感情已經相當深厚了，多次手下都要為他換一匹更好的戰馬，都被肖天健拒絕了，現如今為了肖天健，這匹黃驃馬陣亡在了軍前，肖天健豈能無情，所以肖天健親自堅持埋葬了這匹愛馬，並且立碑予以紀念，單單隻為了這匹愛馬，肖天健就殺了不少的左良玉的手下來祭奠它。