就在肖天健暗中調集兵馬在大名府一帶到處給孫傳庭、吳三桂挖坑，準備收拾孫傳庭和吳三桂的時候，山西這邊的閻重喜也沒閑著，整個晉南被刑天軍控製住之後，閻重喜的經略重點便放在了太原府上麵。
閻重喜知道太原府作為朝廷重鎮，城堅炮利而且還有部分守軍在駐守，如果冒然攻打的話，可能會損失很大，於是這過年之後，便先從太原府外圍下手，用刑天軍慣用的老辦法，先將太原府周邊的官府勢力給肅清，拔掉了一個個太原府周邊的州縣，用了幾個月時間，終於將太原府給孤立了起來。
這個時候坐鎮太原的乃是新任的山西巡撫範誌完，範誌完在太原府搜集了近萬山西潰兵鎮守太原府，連同守將牛勇、王永魁、張雄等人一同防守太原府，同時城中晉王朱求桂也拿出了十萬兩銀子助餉，死守太原城不出。
閻重喜則集結兵力，在三月間包圍了太原府，開始架炮對太原府猛攻，數戰之下都未能攻克太原府，但是卻還是嚴重的打擊了太原府城中的守軍士氣，同時太原府城中糧盡，官兵不得就食，戰鬥力也大為削弱。
到了四月間之後，太原府城中便開始出現了逃卒，幾乎每天都有人縋城而下，逃奔刑天軍的大營，而且閻重喜下令在城外招降城中的守軍，讓他們休要再做無謂的抵抗，到了這個時候，太原府已經沒有多少抵抗的意誌了。
就在四月初六這一天，閻重喜在太原府城外集結了兩萬兵馬，開始最後一次大舉攻城，而巡撫範誌完親自帶著家丁登城禦守，要和刑天軍決一死戰。
可是作為刑天軍起家的山西，自然在太原府城中少不了安插了很多細作，城中的細作們這些日子也沒有閑著，最終在四月初遊說通了太原守將參將張雄，就在閻重喜率兵猛攻太原府的時候，張雄突然間宣布投降刑天軍，並且帶著部下在傍晚的時候打開了太原的東門，將刑天軍放入了城中。
經過一夜的激戰之後，太原府終於被閻重喜所克，巡撫範誌完死於亂軍之中，另外還有守將牛勇等人也力戰陣亡，其餘有數千名守軍則倒戈投降刑天軍，至此整個山西，僅剩下了忻州一帶還在官府的控製之中，基本上山西算是被刑天軍控製在了手中。
對於太原被圍，坐鎮宣大的楊國柱也隻能坐視，他一方麵不願和刑天軍為敵，另一方麵也知道即便是他率兵出戰，也不見得能打到太原府救了太原之危，畢竟有王承平和李淩風這兩員刑天軍的大將還在朔州一帶對整個宣大虎視眈眈，有他們在，是絕不會坐視讓他率兵馳援太原府的，王樸便是例子，所以楊國柱也隻能屯兵於大同一帶，防止刑天軍趁機攻占大同，就此眼睜睜的看著太原府被刑天軍給拿了去。
而朝廷也不是沒想過要救太原，就在崇禎逮問陳新甲，調傅宗龍入京繼任之後，陝西這邊的剿撫之事便交給了新任的陝西巡撫汪喬年負責，於是崇禎多次想再次抽調陝兵入山西救援太原府，可是這種想法卻並無法實現。
自從崇禎去年調洪承疇和孫傳庭入衛之後，洪承疇從陝西帶走了近十萬秦兵和不少的大將，留下的秦兵數量已經不多，刑天軍倒是沒有趁著這個機會攻入陝西，但是沒成想已經被洪承疇和孫傳庭打得成了落水狗的李自成，卻在洪承疇率部離開陝西之後複振了起來，一路攻入到了漢中一帶，把持住了漢中近十個縣，效仿刑天軍屯兵息養，同時不斷的對陝西和四川攻掠，迫使傅宗龍這一年來，一直在想辦法和李自成交戰。
而陝西重將賀人龍去年又在襄陽府一帶被刑天軍殲滅，投降了刑天軍，使得陝西這邊僅剩下了李國奇和左光先這兩員大將，有李自成屯兵於漢中一帶，就夠他們忙活了，所以崇禎雖然想過要調秦兵入晉救援太原府，哪怕是入晉牽製一下刑天軍也成，但是最終都因為陝西缺兵，無法成行，眼睜睜的看著太原府就這麼被刑天軍給拿下了。
太原府丟了，對於京師來說便威脅更大了，崇禎趕緊招傅宗龍商議，傅宗龍於是便隻能提議加強宣大一帶的防務，待重新編練起來新軍之後，再謀重新奪回山西，將刑天軍趕出山西，但是這種話，也就是說說罷了，到了眼下的這個時候，大家其實都心知肚明，等朝廷的新軍編練好之後，刑天軍那邊也絕不會閑著，這山西丟了便恐怕是再也沒機會拿回來了。