如同許多新生事物，進化心理學難免被人誤解。簡單一句話，從隊伍第一個人傳到最後一個人，信息可能完全失真，學科傳播也麵臨這一問題。不隻是進化心理學，幾乎所有學科都會麵臨被人誤解的問題。許多人對進化心理學一知半解，以為自己理解了，實際上理解偏頗或者錯誤，這一現象在普通人身上尤其明顯，從事與進化心理學無關的研究者也一樣。
進化心理學的反對者則有各自不同的原因。狂熱的創始論信奉者無法接受進化心理學的理念，秉持“自然主義”觀點的人則把進化心理學看作種族主義者的學科。不過，一些人的反對觀點本身就是錯誤的。
進化心理學強調基因決定論或環境決定論嗎?怎麼可能，它所反對的正是這些偏激的觀點。此外，並非所有行為都有適應性，尤其是現存的人類行為。畢竟，百萬年前人類環境和今天完全不同，行為發生的情境不同，行為也是不同的。
進化心理學認為，人類的心理屬性是進化的結果，也就是說，在漫長的進化歲月中，有利於生存、繁衍的心理屬性被選擇出來，而這些心理行為在隨著時間、空間的變化進行調整。比如人在尋找配偶時，會選擇地位盡可能高的人，還是門當戶對的人?按照進化心理學的觀點，選擇地位盡可能高的人，以保證後代更高的成活率。可是，數據分析的結果顯示，人們更傾向選擇門當戶對的人。
進化心理學研究愛情、親情、信仰、道德、母愛等現象，從自然科學的角度解釋其可能性，比如說，進化心理學解釋母愛為何會超越父愛。第一，母親能夠確定孩子是否親生，父親卻不會，因此父親不會對一個孩子投入更多關注。第二，父親和母親對待孩子的關愛策略是不同的。動物界的雄性遵守的是多交配原則，盡可能多地留下自己的後代，雌性則不會，她希望保證每一個孩子都能存活。這是從純粹動物學的角度解釋人類行為，與人類文明中的父愛、母愛、神聖的愛情之類毫無關係，但是它也在冥冥中影響著人類的行為和情感。
另外，為什麼不管年齡多大的男人總是喜歡20歲的女人?皮膚要好，容貌也好，腰部不太粗壯……這些特點都是繁殖力的特征。另一邊，女性在選擇配偶時要求對方擁有較高的社會地位和金錢、權力資源，這些都是確保後代存活的條件。其次考慮挑選身體健康、聰明俊秀等因素。從征婚節目中，男女嘉賓提出的擇偶條件可以清晰地發現，與其說擇偶，不如說擇的是對自己繁殖有利的客觀條件。為此，人們把進化心理學視為心理學回歸了動物學。這顯然是一種誤讀。
其實，不隻是進化心理學，心理學整體都在被誤讀。心理學研究的現象和日常生活貼近，非專業人士很容易將生活中的看法和見解代入其中。進化心理學被誤讀、過分解讀或者附加道德判斷的情況經常出現。
進化心理學涉及一些更敏感的問題，有時甚至挑戰倫理道德。比如，雄性的性攻擊行為有利於留下更多的後代，放在人類社會中，有人就要開始道德批評了，“這樣的研究想證明什麼?家庭暴力合理?還是支持強奸?”實際上，這些人隻是看到了研究的表麵，而沒有真正理解理論。不過，心理學家對大眾的看法並沒有興趣，更沒有精力與坊間人士一辯高下，他們自己爭來爭去都忙不過來呢。
心理學整體被自然科學鄙視，作為新興學科的進化心理學因其研究方法不夠成熟、積累的數據不夠豐富而更加得不到重視。進化心理學剛剛出現時遭到了許多正統心理學家的批判，隨著實證研究的發展，反對者的聲音變小了。
現在的學界對進化心理學的態度可以用四個字概括：靜觀其變。畢竟，進化心理學本身還在發展，許多理論並不成型，真正以實證方法進行研究的學者也在探索中，基本上都是摸著石頭過河。不過從整體來說，進化心理學的學科地位是被承認的，進化心理學的研究結果也被其他領域的研究者所引用。
如同許多新生事物，進化心理學難免被人誤解。簡單一句話，從隊伍第一個人傳到最後一個人，信息可能完全失真，學科傳播也麵臨這一問題。不隻是進化心理學，幾乎所有學科都會麵臨被人誤解的問題。許多人對進化心理學一知半解，以為自己理解了，實際上理解偏頗或者錯誤，這一現象在普通人身上尤其明顯，從事與進化心理學無關的研究者也一樣。