第二天，國民黨秘書長林豐正致電“總統府”秘書長遊錫堃，以“謝謝好意，不必相煩”為由，明確地拒絕扁連相會的安排。
陳水扁在“立法院長”王金平的服務處遭人破壞、多名在野黨“立法委員”聲稱遭到民進黨支持者的恐嚇、連戰婉拒接受他登門道歉，以及在野黨聯盟表明要在6日確立罷免“總統”的法定程序等情況下，11月5日晚發表電視道歉聲明，公開向國民黨主席連戰及台灣民眾道歉。
他說，“新政府”一路走來，無法避免跌跌撞撞，他個人必須反躬自省，也必須為“新政府”承擔起全部的責任。
陳水扁說，他對於許多內政、“外交”和兩岸關係問題感到十分心急，因為覺得責任重大，在義無反顧的同時，往往難以兩全，隻專注於問題的解決，而“忽略了一些人的感覺”。
他說，“核四”問題耗費了太多時間與社會成本，實在不應該再拖延下去，所以他必須支持“行政院長”張俊雄不再拖延的決心。
“但是，對於宣布時機的問題，個人應該負起全部責任，我了解連主席不是在乎麵子的問題，但是我還是要誠懇的向連先生以及國人同胞，致上最深的歉意。”
陳水扁並且兩度拱手作揖，呼籲支持他的反核人士一定要理性和冷靜，不可為難在野黨“立委”，對“立法院長”王金平要給予應有的尊重，對在野黨之間的結盟也不要有負麵的看法，因為強而有力的在野力量，才能對政府做最好的監督。他呼籲今後所有的公共政策的爭議，都應該理性討論、協商解決。
他說：“雖然麵對多數的在野黨，‘總統’真的是不好做，但是大家的關心和在野黨的批評，我都會用心來聽、用心來改進。阿扁非常感謝，也感覺不好意思、非常對不起。”
國民黨當晚7時15分針對陳水扁的道歉聲明，也召開記者會作出回應。國民黨發言人胡誌強指出，在野黨聯盟推動“罷免案”，其重點並非因為某個政黨領袖的個人情緒，陳水扁的道歉完全沒有必要。
他指出，目前台灣政治的亂象是由於“憲政”體製未受到尊重，政策無法連貫。“核四”議題經過了20年的討論，而興建“核四”是經過“立法院”以民主程序通過，“新政府”應該依法執行。但“新政府”卻宣布停建，藐視“法律”，也漠視“立法院”的職權。
胡誌強說：“在野黨聯盟對罷免案沒有鬆動立場，中國國民黨作為最大的政黨，必須伸張民意，加強與其他在野政黨的合作，與執政黨的協商大門也是敞開的。”
親民黨“立法院”黨團發言人李慶安表示，感受到陳水扁的誠意與歉意，但還是要看國民黨是否接受。至於罷免行動是否會調整步伐，要留待在野黨聯盟“立委”討論後再決定。
不過李慶安指出，陳水扁對停建“核四”決策違“憲”和違法的部分卻隻字未提，這個爭議必須徹底解決，在野聯盟“立委”將商議如何回應。
民進黨主席謝長廷表示，台灣沒有對立的本錢，陳水扁“總統”在錄影帶談話裏釋放相當的善意，並向連戰誠懇道歉，希望能將使這次“核四”問題所造成的動蕩不安告一段落。
第二天，國民黨秘書長林豐正致電“總統府”秘書長遊錫堃，以“謝謝好意，不必相煩”為由，明確地拒絕扁連相會的安排。