而弊案的爆發為“第一家庭”帶來了人性的衝擊，一場親情角力戰大戲上演，頃刻間，夫妻關係、父子關係、父女關係、婆媳關係變的複雜而吊詭。正如國民黨“立委”邱毅所說，陳水扁一家各懷鬼胎，貪汙家庭無親情可言。
夫妻關係：從“救夫保子”到“舍大保小”
過去，吳淑珍曾經這樣形容陳水扁，“阿扁的人就像喝白開水一樣，喝起來沒味道，可是如果少了他，又活不下去”。陳水扁因家族弊案被羈押，二人第一次無法一起慶祝情人節，吳淑珍更通過友人轉告陳水扁，這輩子嫁給阿扁，她無怨無悔，如果有來生，一定還要再當陳水扁的太太。就是這樣一對夫妻，即使隔著大牢兩相遙望，也依舊高調宣誓愛情。
弊案初期，吳淑珍為了保護丈夫陳水扁與兒子陳致中，曾采取部份認罪的司法策略，企圖將全部罪責攬在自己身上，通過這一手段來達到“救夫保子”的效果。而陳水扁也同樣罪推妻子，將吳淑珍說成“不是正常人”，瞞著他在官邸撈錢、搬錢、洗錢。
隨著案情的進一步明朗，扁家人似乎意識到“誠實才是最好的對策”，陳水扁負隅頑抗實非明智之舉，唯有坦白認罪才能減輕家人、尤其是兒子陳致中涉罪的責任。
此後，吳淑珍的策略由“救夫保子”轉為“舍大保小”，陳水扁辦公室透露，先前曾帶著一封吳淑珍親手寫的信轉交給陳水扁，吳淑珍在信中措辭強硬，表達對陳水扁的不滿。
扁辦秘書江誌銘表示，吳淑珍對於陳水扁有所責備，因為陳水扁絕食、行使緘默權來抵製司法審判，造成陳致中、陳幸妤被起訴、遭境管，吳淑珍希望陳水扁可以認罪，加速案件審理。
之後，吳淑珍更進一步發動勸扁認罪攻勢，甚至對扁撂話：“不認罪以後就不來探視！”而吳淑珍“棄夫保子”這一招注定得不到丈夫陳水扁的配合。陳水扁公設辯護人曾德榮曾說，陳水扁已明確表示“不可能認罪”。
麵對陳水扁夫婦關係的驟變，連扁係“立委”邱議瑩都直言，這樣的轉折可顯示：“夫妻本是同林鳥，大難來時各自飛，非常可悲！”
邱毅則強調，“這一家真的都是變態，吳淑珍不也說過，她半夜要起來打陳水扁、要殺陳水扁嗎？陳水扁又說吳淑珍不正常，說要把家裏的菜刀藏起來，怕吳淑珍殺人。所以這對夫妻不隻是同床異夢。”
父子關係：從“避實就虛”到“當庭對質”
扁家弊案初期，陳致中、黃睿靚夫婦由當初僅承認是母親吳淑珍的“人頭”到後來主動要求“認罪協商”，形式上雖表現“進步”，但實際上卻誠意不足，不僅海外巨款未能如期彙回台灣，就連司法策略也依舊采取推責於母親，稱父親對洗錢一事毫不知情，力保陳水扁的痕跡相當明顯。
然而，隨著弊案審理的進一步白熱化，當陳致中堅定的向審判長蔡守訓表示願意出庭做證，願意與父親陳水扁對質，當陳水扁聽到兒子在法庭上侃侃而談，而表現出眉頭深鎖，坐立難安時，一切謎底似乎皆在世人眼中。
為了讓父親陳水扁達到認罪的目的，陳致中也曾以死相逼，表示如果吳淑珍有事，他準備“隨母而去”。而陳致中妻子黃睿靚探扁時更是直接哭訴，希望扁配合院檢，不要累及子女與第三代。
陳致中更直接投書媒體，表達對出身扁家的不滿。他說“寧願自己出生在一個平常的家庭，在那種狀況下，我可以自由地、快樂地‘Be Mylf’，而這個社會所看的也會是原本的我、完整的我。”
國民黨“立委”邱毅接受采訪時說，陳水扁一家人動作連連，讓人看到的就是“父不慈，子不孝”。
父女關係：從“為父叫屈”到“對扁發飆”
2008年8月18日，當陳水扁遭到起訴後，陳幸妤上班被媒體圍堵狂奔跌倒，她發飆痛批民進黨：“他們現在就要鬥死我們全家啊！”“那些當初有拿錢的人，有去選舉的人，現在每個出來假清高。”在陳水扁涉及洗錢案進入緊要關頭之際，陳幸妤高聲嘶吼，為家人辯護，強調彙往海外的錢都是“選舉結餘款”。她還點名前“行政院長”蘇貞昌、謝長廷和高雄市長陳菊，都曾拿過父親陳水扁的錢。