事實上，蔣介石在居正見他請示時，陽為讚成，背裏卻準備全力予以破壞，並派親信袁守謙立即從台北飛抵廣州，會同保密局局長毛人鳳一個個向蔣係立法委員打招呼，要他們投票否決居正組閣案。當時，親李宗仁的立法院長童冠賢受到蔣係特務的威脅棄職躲到香港去了，立法院由親蔣的副院長劉健群主持。5月30日，立法院投票結果，居正以一票之差未能通過。這個結果，完全出乎李宗仁等人的意料之外。
之所以出現這樣的結果，李漢魂分析其原因說：“立法院實施投票，孰知結果竟差一票，居閣遂致流產。予固十分失望，德公及一般人士，都感出乎意外。嗣詳加調查考察，則甲方（引者按：蔣係勢力）之不擇手段，多方破壞，固在意料中；但乙方（引者按：擁護李宗仁的勢力）之人謀不臧，活動不夠，且大都既驕且惰，殆非初料所及。蓋所以獲此結果，殆由CC及黃埔係之多數人員，認為居殊親李，特加大力阻撓。至桂係方麵，一般固少活動，而立委韋永成、張嶽靈，更以樂於優遊香港，間或本身所圖未逞而失望，雖經電促參與投票，亦複於票決後始姍姍雲歸，遂致一票之差，便累及眾所推崇的覺老，亦足見中國過去的政治，終不免‘恩怨大於主張，而人事則重於製度’也。全局如此，失敗亦殆可知。”
梁升俊則認為，說起居正組閣失敗，至少有以下四個原因：第一，CC係和黃埔係認為居正是親李宗仁的，所以盡管國民黨中常會通過提名，而立法院投票時，他們仍用盡手段阻撓居氏的當選。第二，居正雖屬年高德劭，到底不是撐支危局的適當人選，不宜於此時出任閣揆。第三，親李派立委過於輕敵，自信心太強，以為一定有半數的同意票，所以對於拉票工作，視若等閑。第四，桂籍立法委員韋永成、張嶽靈優遊香島，雖經電催，亦樂而忘返，他們萬料不到竟因一票之差而告流產，而他們就握有這神聖的兩票。
居正組閣案遭立法院否決後，兩廣勢力反應強烈，陳烈等親李宗仁的數十名立法委員主張幹脆由白崇禧組織軍人內閣；陸軍總司令張發奎、廣東“綏靖”公署主任餘漢謀、廣東省政府主席薛嶽、內政部長李漢魂等廣東將領則主張由李宗仁向立法院第二次提名居正，認為第二次投票一定可以設法拉攏足夠半數以上的立法委員投票讚成。張發奎、餘漢謀、薛嶽、李漢魂等商量後，隨前即往麵見李宗仁，要求他第二次提名居正，李宗仁當麵“甚表同意”，但張發奎等人走後，優柔寡斷的李宗仁思之再三，最終決定向蔣介石妥協，轉而提名閻錫山組閣。
6月2日，國民黨中央政治會議通過對閻錫山的提名。6月3日，立法院第三會期第25次會議以254票對56票的多數通過閻錫山任行政院長。近800人的立法院現今隻剩下300餘人勉強開會，說明國民黨殘餘政權已開始作鳥獸散。
事實上，蔣介石在居正見他請示時，陽為讚成，背裏卻準備全力予以破壞，並派親信袁守謙立即從台北飛抵廣州，會同保密局局長毛人鳳一個個向蔣係立法委員打招呼，要他們投票否決居正組閣案。當時，親李宗仁的立法院長童冠賢受到蔣係特務的威脅棄職躲到香港去了，立法院由親蔣的副院長劉健群主持。5月30日，立法院投票結果，居正以一票之差未能通過。這個結果，完全出乎李宗仁等人的意料之外。
之所以出現這樣的結果，李漢魂分析其原因說：“立法院實施投票，孰知結果竟差一票，居閣遂致流產。予固十分失望，德公及一般人士，都感出乎意外。嗣詳加調查考察，則甲方（引者按：蔣係勢力）之不擇手段，多方破壞，固在意料中；但乙方（引者按：擁護李宗仁的勢力）之人謀不臧，活動不夠，且大都既驕且惰，殆非初料所及。蓋所以獲此結果，殆由CC及黃埔係之多數人員，認為居殊親李，特加大力阻撓。至桂係方麵，一般固少活動，而立委韋永成、張嶽靈，更以樂於優遊香港，間或本身所圖未逞而失望，雖經電促參與投票，亦複於票決後始姍姍雲歸，遂致一票之差，便累及眾所推崇的覺老，亦足見中國過去的政治，終不免‘恩怨大於主張，而人事則重於製度’也。全局如此，失敗亦殆可知。”