以往在大多數教科書中對賁門的定義是：將食管鱗狀上皮末端與分泌胃酸的胃底黏膜區域分隔開來的一個區域。胃賁門起始於食管胃交界處，其遠端界限很難確定，在內鏡下看不到胃賁門遠端的標誌線。因此，近年來在很多文獻中用食管胃（OG）交界的解剖學名詞來代替“胃賁門”的概念。在2000年版《WHO消化係統腫瘤病理學和遺傳學》一書中明確主張不再采用胃賁門癌的診斷用語，並將食管胃交界定義為食管並入胃的解剖學區域。鱗柱交界可以在食管胃交界處或在食管胃交界處上方。當鱗柱交界與食管胃交界相吻合時，食管完全由鱗狀上皮所被覆。當不相吻合時，也就是鱗柱交界位於食管胃交界上方時，食管的一部分就被覆柱狀上皮。
賁門黏膜在組織學上是一種彎曲管狀有分葉的腺體，幾乎完全由分泌黏液的細胞所構成，僅有極少量泌酸細胞，而近端胃即使不完全，也主要由泌酸上皮細胞所被覆。在組織學上表現為賁門型黏膜並不能確定標本一定取自胃賁門，因為：①食管遠端可見賁門型黏膜；②位於食管遠端鱗柱交界下方的賁門黏膜極少向下延伸超過2～3 mm。因此，被稱作賁門的解剖學區域大部分並不被覆賁門黏膜。換句話也就是說，一個腫瘤即使位於賁門處，但也可能並不由賁門上皮細胞所發生。一個明確位於遠端食管的腫瘤也可能是由食管的賁門上皮細胞所發生。
為了能方便明確的診斷，目前對於食管胃交界腺癌的診斷標準為：①不論腫瘤發生在何處，隻要腫瘤穿過食管胃交界處即可診斷為食管胃交界腺癌；②完全位於食管胃交界上方的腺癌，應當認為是食管腺癌；③完全位於食管胃交界下方的腺癌應當認為是原發於胃的腺癌，根據腫瘤的部位，可稱之為近端胃腺癌或胃體腺癌。
1994年，Clark等首次提出賁門炎是胃食管反流性疾病（GERD）的組織學標誌。從食管胃交界處活檢資料證實，在334例伴有上消化道症狀的患者中75%有賁門型或賁門泌酸型黏膜。drasome等進一步證實，食管鱗狀上皮黏膜向賁門型分泌黏液的柱狀上皮轉化是遠端食管暴露於酸性胃液中的早期病理改變，其為黏膜對炎症的反應，化生的賁門型分泌黏液的柱狀上皮細胞實際上是食管黏膜的一部分。
一般認為賁門炎多數繼發於幽門螺杆菌（HP）感染。不過，盡管賁門炎患者大多數伴HP感染，但仍有20%不伴有HP感染，因此，賁門炎可能存在著不同的病因和不同的類型。近年來研究結果表明食管和胃所發生的腸上皮化生均是癌前病變，但兩者在形態學、組織化學、病理遺傳學及臨床意義上均有著顯著的差異。發生於胃的腸上皮化生的特點為常與HP感染和胃食管反流性疾病相關聯，多數為完全性腸上皮化生，免疫組化染色見無CK7br20表達，發生癌變的危險性較低。與此相反，發生於食管的腸上皮化生的特點為常與幽門HP感染和胃食管反流性疾病不相關聯，常為不完全性腸上皮化生，免疫組化染色見有CK7br20表達，發生癌變危險性較高。所以，區別近端胃與食管來源的腸上皮化生具有重要的臨床意義。以往的經驗告訴我們，僅根據內鏡下胃黏膜活檢標本來區別胃與Barrett食管常是很困難的，此時化生的腸上皮細胞對細胞角蛋白亞型（bsp;subt）的表達十分重要，細胞角蛋白亞型的表達對鑒別食管胃連接處化生的腸上皮類型及監護和隨訪癌症高危人群很有幫助。
以往在大多數教科書中對賁門的定義是：將食管鱗狀上皮末端與分泌胃酸的胃底黏膜區域分隔開來的一個區域。胃賁門起始於食管胃交界處，其遠端界限很難確定，在內鏡下看不到胃賁門遠端的標誌線。因此，近年來在很多文獻中用食管胃（OG）交界的解剖學名詞來代替“胃賁門”的概念。在2000年版《WHO消化係統腫瘤病理學和遺傳學》一書中明確主張不再采用胃賁門癌的診斷用語，並將食管胃交界定義為食管並入胃的解剖學區域。鱗柱交界可以在食管胃交界處或在食管胃交界處上方。當鱗柱交界與食管胃交界相吻合時，食管完全由鱗狀上皮所被覆。當不相吻合時，也就是鱗柱交界位於食管胃交界上方時，食管的一部分就被覆柱狀上皮。
賁門黏膜在組織學上是一種彎曲管狀有分葉的腺體，幾乎完全由分泌黏液的細胞所構成，僅有極少量泌酸細胞，而近端胃即使不完全，也主要由泌酸上皮細胞所被覆。在組織學上表現為賁門型黏膜並不能確定標本一定取自胃賁門，因為：①食管遠端可見賁門型黏膜；②位於食管遠端鱗柱交界下方的賁門黏膜極少向下延伸超過2～3 mm。因此，被稱作賁門的解剖學區域大部分並不被覆賁門黏膜。換句話也就是說，一個腫瘤即使位於賁門處，但也可能並不由賁門上皮細胞所發生。一個明確位於遠端食管的腫瘤也可能是由食管的賁門上皮細胞所發生。
為了能方便明確的診斷，目前對於食管胃交界腺癌的診斷標準為：①不論腫瘤發生在何處，隻要腫瘤穿過食管胃交界處即可診斷為食管胃交界腺癌；②完全位於食管胃交界上方的腺癌，應當認為是食管腺癌；③完全位於食管胃交界下方的腺癌應當認為是原發於胃的腺癌，根據腫瘤的部位，可稱之為近端胃腺癌或胃體腺癌。
1994年，Clark等首次提出賁門炎是胃食管反流性疾病（GERD）的組織學標誌。從食管胃交界處活檢資料證實，在334例伴有上消化道症狀的患者中75%有賁門型或賁門泌酸型黏膜。drasome等進一步證實，食管鱗狀上皮黏膜向賁門型分泌黏液的柱狀上皮轉化是遠端食管暴露於酸性胃液中的早期病理改變，其為黏膜對炎症的反應，化生的賁門型分泌黏液的柱狀上皮細胞實際上是食管黏膜的一部分。
一般認為賁門炎多數繼發於幽門螺杆菌（HP）感染。不過，盡管賁門炎患者大多數伴HP感染，但仍有20%不伴有HP感染，因此，賁門炎可能存在著不同的病因和不同的類型。近年來研究結果表明食管和胃所發生的腸上皮化生均是癌前病變，但兩者在形態學、組織化學、病理遺傳學及臨床意義上均有著顯著的差異。發生於胃的腸上皮化生的特點為常與HP感染和胃食管反流性疾病相關聯，多數為完全性腸上皮化生，免疫組化染色見無CK7br20表達，發生癌變的危險性較低。與此相反，發生於食管的腸上皮化生的特點為常與幽門HP感染和胃食管反流性疾病不相關聯，常為不完全性腸上皮化生，免疫組化染色見有CK7br20表達，發生癌變危險性較高。所以，區別近端胃與食管來源的腸上皮化生具有重要的臨床意義。以往的經驗告訴我們，僅根據內鏡下胃黏膜活檢標本來區別胃與Barrett食管常是很困難的，此時化生的腸上皮細胞對細胞角蛋白亞型（bsp;subt）的表達十分重要，細胞角蛋白亞型的表達對鑒別食管胃連接處化生的腸上皮類型及監護和隨訪癌症高危人群很有幫助。