於是忒修斯成了雅典的國王。在他執政之前，阿提喀地區的居民大多居住在雅典小城和周圍散布的村落裏。忒修斯讓居民向城裏集中，並把零星的村莊組織起來，加強城市與鄉村的分工和聯係。又把治下的居民分為貴族、農民和手工業者三大階級，規定各階級的權利和義務。又取消了各個市鎮的小議會，代之以規模更大、更有組織的雅典市議會。
為了達到這些目標，他親自去各個村鎮解釋，這麼做對大家都是有利的。改革能給貴族帶來利益，因此貴族歡迎；於是大勢所趨，守舊、模棱兩可的人、貧民和低賤的人也就都沒有意見了。忒修斯的執政能保障所有居民能公平地獲得權利，因此吸引來許多新的移民。這樣雅典成為一個自由、開放、強大的城市。
忒修斯又宣布限製國王的權力，讓國王的權力受到貴族議會和人民會議的節製，他說：“我隻願在戰爭時當你們的首領，平時更願做一個遵守法律的人。”雅典因而製訂了一部憲法，以保障雅典自由、民主的社會秩序。
他又要求雅典人敬畏神靈，把雅典娜女神作為雅典的保護神。他還定了一個假日，稱為泛雅典節，即全體雅典人的共同節日；又在哥林多地峽舉行角力賽會。雅典由此發展成為一個強大的城市。
忒修斯為公眾作的貢獻，遠遠超過了他所崇拜的赫拉克勒斯。
3後期故事
當他把這一切完成，年紀就已經很大了。在這漫長的時間裏，王後希波呂忒死於外族的攻擊。忒修斯當年跟伊阿宋冒險經過阿宗瑪婦人國時，希波呂忒作為使者來到他們的船上，被忒修斯帶回雅典，她後來生的兒子叫希波呂托斯。阿宗瑪人卻認為她是被拐騙走的，於是有一天她們登陸並攻進雅典城，但激戰之後未能取勝，與雅典締結了和約離去。希波呂忒在與忒修斯共同戰鬥時陣亡，雅典人立了一根大石柱紀念她。
忒修斯在晚年交了一個年輕的朋友，叫庇裏托俄斯，是伊克西翁的兒子。他聽說忒修斯身強力壯，人人敬仰，就全副武裝，牽走忒修斯的牛。忒修斯也全副武裝地去追他。當庇裏托俄斯看到追來的忒修斯時，很欽佩他，放下武器甘願受懲。然而忒修斯也被他所吸引，對他說：“做我的朋友和戰友吧！”兩人成為朋友，相互立誓，永遠忠於友誼。後來庇裏托俄斯請忒修斯參加他的婚禮，新娘是帖撒利地區的拉庇泰族人。拉庇泰人是最先馴服馬匹的人類。參加婚禮的還有陶洛斯人。陶洛斯人被稱為“雲霧的子孫”，本與拉庇泰族有仇，但因為是庇裏托俄斯的親戚，所以也參加了婚禮。婚禮中，陶洛斯人歐律提翁飲酒過多，突然抓住新娘，要把新娘拖走，緊接著其他的陶洛斯人也學著搶參加婚禮的女人。客廳變成了戰場。血戰之後，庇裏托俄斯才穩穩地保護了他的新娘。他們與拉庇泰族的戰爭就此展開，直到他們被完全征服。庇裏托俄斯與忒修斯的友誼也更加堅固。
婚禮大戰取勝後不久，忒修斯去克裏特娶阿裏阿德涅的妹妹淮德拉。淮德拉也早就從雅典回到了故鄉克裏特，跟國王哥哥丟卡利翁在一起。克裏特的老國王彌諾斯去世後，兒子丟卡利翁成為新國王，對忒修斯產生了好感，與他結成了攻守同盟。忒修斯自從希波呂忒死後一直未娶，聽說淮德拉長得嫵媚動人，請求丟卡利翁將妹妹淮德拉嫁給自己為妻，丟卡利翁答應了他。淮德拉長得像她的姐姐，這令忒修斯很欣慰。淮德拉生了兩個兒子，阿卡瑪斯和得摩豐。
忒修斯的長子希波呂托斯早年在祖母埃特拉的兄弟們那兒接受教育，現在他回到雅典。當淮德拉第一次看見他時，就愛上了他，他們兩人也正好同歲。那次淮德拉還以為麵前站著的是年輕時的忒修斯。但希波呂托斯已經把自己獻給了處女神阿耳忒彌斯，發誓永不結婚。淮德拉在雅典衛城建了一座神廟，以向愛情女神祈禱，又常躲在桃金娘樹下悲歎自己的命運。後來，她向她的年老的乳母吐露了心事，乳母好心地把她的心事告訴希波呂托斯。希波呂托斯拒絕了，並從此盡量避開淮德拉。這時忒修斯去了特洛曾，回來後，他發現妻子淮德拉已自縊，留下遺書說：“希波呂托斯要對我無禮，我隻好以死躲避，以免使國王名聲有損！”