者的阻撓。他寫了封信給懷良親王，懷良親王懷疑趙秩是元朝忽必烈遣赴日本的使者趙良弼的後裔，說：我國雖處扶桑東，未嚐不仰慕中國。但元朝與我國都是平等的國家，卻要我們臣服於它。我先王不服，元朝便派姓趙的使者，用好話哄騙我們，他的話還沒說完，元朝的十萬水軍已陳兵我國海岸。幸賴上天保佑，雷鳴電閃，波濤洶湧，元軍一時盡皆覆沒。現今新天子就位，派來的使臣也姓趙，豈非元朝使臣的後裔莫不是也將用好話哄我，暗地裏卻派兵來進攻我們懷良親王說畢，用眼色示意左右武將，讓他們動手刺殺趙秩。趙秩麵無懼色，鎮定自若地說：我大明天子神聖文武，非元朝可比，我也不是元朝使臣的後裔。要殺，就殺吧!懷良親王被趙秩的話鎮住了，隻得離座下堂，延請趙秩，設宴款待。接著，派遣僧人祖來向朱元璋"奉表稱臣"，貢馬及方物，並送還明、台二郡被倭寇擄掠去的人七十餘人。祖來一行於洪武四年十月到達明朝首都南京，朱元璋很高興，設宴款待，賞賜禮品。
當時，為了解決倭患問題，朱元璋急於了解日本的情況。他曾在奉天殿召見南京天界寺的日本留學僧椿庭海壽，向他打聽過日本的國情。現在，他又向祖來詢問日本的國事，終於得知日本存在兩個互相對立的政權，北朝的實力大於南朝；而懷良親王也不是國王。親王之外，北朝的京都還有個天皇(南朝的後醍醐天皇此時已死)。南朝的懷良親王既然不願與明朝合作、製止倭寇對中國的侵擾，朱元璋就想直接同北朝的天皇交涉。但中國的使者去北朝必須通過南朝的轄境，為了避免南朝的阻撓，他決定利用日本君臣奉佛敬僧的習俗，以護送祖來返日為名，派明州天寧寺祖闡法師、南京瓦官寺無逸等八人出使日本。洪武五年(1372年)五月。祖闡、無逸等八人以日本僧人椿庭海壽、權中巽為通事，自明州乘船出發，五天後航抵日本肥前(今佐賀和長崎縣一帶)之五島，再前往博多(今日本福岡)。南朝見他們都是僧侶，連翻譯也是日本的留學僧，放他們北上京都。他們在京都與室町幕府作了交涉，兩個月後再到南朝，向懷良親王送大統曆及文綺、紗羅等禮品。懷良親王對他們的北朝之行本來就心懷不滿，要求祖闡法師留下來住持天龍寺。祖闡推說沒有明朝皇帝的命令，嚴辭拒絕，他便下令把祖闡等人拘留起來。兩年之後，他們才獲釋回到南京。
第二、三次遣使交涉又無結果，倭寇對中國沿海的騷擾有增無減。洪武三年(1370年)，入寇山東，轉掠浙江溫、台、明州濱海之地，並寇擾福建沿海郡縣。翌年，人寇山東膠州和廣東海晏、下川、大儋、丈持等地。五年，入寇江蘇海鹽、澉浦、蘇州、鬆江，浙江溫州、台州、明州，並寇掠福建海上諸郡，僅七月間入寇福州之福寧縣，前後即殺掠居民三百五十餘人，焚燒廬舍千餘家，劫取官糧二百五十石。六年，入寇山東即墨、諸城、登州、萊州和浙江海濱。七年，再寇山東膠州、江蘇海州及浙江沿海各地。
此後一段時間，懷良親王未再與明朝交往。有些地方的封建主想得到明朝優厚的賜賚，曾派人人明朝貢，因"無表"或"無國王之命"，都遭到明朝拒絕。後來，因為倭寇頻繁寇掠，朱元璋令中書省給征西府送去一份通諜，嚴加譴責。洪武九年(1377年)懷良親王派遣僧人廷用文璉入貢，表示謝罪，但表詞毫無誠意，朱元璋"降詔戒諭"。洪武十二年、十三年，他又先後兩次遣使人貢。十三年的貢使未帶表文，隻帶了一封征夷大將軍足利義瞞給明朝丞相的書信，書辭倨傲。朱元璋複"卻其貢，遣使齎詔譙讓"。洪武十四年，懷良親王再派僧人如瑤入貢，朱元璋再次拒絕，並命禮部以書責之，文日：