學校當然不忘它是教會學校的性質，宗教儀式是天天都有的，早晨要做禮拜。星期三、六要開祈禱講經會。孔祥熙對這些儀式非常虔誠，也非常積極。因為學校是把這作為品德標準的。但是有一次上神學課時，孔祥熙向牧師發出了駁難。
牧師這天講的是《聖經》的創世記。他說，上帝創造了天和地。第一天，上帝說，要有光，於是就有了光。第二天，上帝說，要有空氣，於是就有了空氣。他把水分開，一部分留在地上，一部分放在空氣之上，以雲和雨的形態留在天上。第三天，上帝把天下的水彙集在一起，彙集起的水叫作海，露出的陸地叫作地，並且讓地上生長青草、蔬菜和樹木。第四天，上帝在空中造了兩個發光體，大一點的白晝發光的叫太陽，小一點的夜裏發光，叫月亮。第五天，上帝說，水裏要有魚遊，天上要有鳥飛翔，於是就有了魚和鳥。第六天，上帝照著自己的身體形象，摶土造了人，讓人管理地上的一切。天地萬物造齊了，第七天，上帝就休息了。上帝賜福給第七天，定它為萬世的節日……
這些故事是那樣新鮮有趣，同學們聞所未聞，一個個聽得全神貫注。但孔祥熙卻覺得似乎有些不對勁，他舉起了小手，但牧師為自己講的故事情景所迷，沒有看見。他仍滔滔不絕地講下去——上帝在東方富饒的平原上，建造了一所美麗的花園，這就是著名的伊甸園。上帝把它造的人亞當安置在伊甸園裏，叫他在那裏耕作管理。後來上帝看到亞當一個人很孤獨，就乘他睡著時，從他身上取下一根肋骨，造了一個女人，叫作夏娃，讓夏娃做亞當的妻子。開始他們都赤身裸體，不知道害羞……
牧師偶然抬頭，看到了孔祥熙倔強地舉著的小手，有些吃驚，於是停了下來，他問：你有什麼事？難道要在講經的時候出去上廁所嗎？
不。老師，我有一個問題。
好的，有沒聽明白的地方，盡管提問。
上天文課的老師說，日出日落和一切風雨雷電都是自然現象，他說得對嗎？
牧師看了孔祥熙一眼：那是科學，不能懷疑。他講的當然是對的。好，我們接著往下講……
老師，我還有一個問題。你剛才說日月風雨都是上帝創造的，這對嗎？
住口！這是《聖經》上說的，你怎麼敢懷疑？用這樣的口氣提問是對上帝的褻瀆和不敬！
孔祥熙一股打破砂鍋問到底的架式：老師，我隻是要弄清楚，日出日落風雨雷電究竟是上帝操縱的結果呢，還是自然現象？
這——，牧師變得口吃了，鼻子尖上冒出了汗珠，一時竟無法自圓其說。
孔祥熙在學生中成了敢於駁難老師的英雄，許多人來主動和他交朋友。學校方麵也竭力給他多做工作，以免再出現讓老師難堪的類似事情。他們經常給他提供出頭露麵的機會，利用他的影響力，帶動其他學生按校方設定的路子發展。結果，五年後，孔祥熙以品學兼優的成績在華美公學畢業，並且成了教會重點跟蹤培養的人才。
十三、倔強的選擇帶來真正的發祥
華美公學一畢業，教會方麵立即把孔祥熙作為重點培養對象，準備送往設在京畿要地通州的潞河書院繼續深造。那也是一所美國人開辦的教會學校。
說來也是奇怪，按孔祥熙的家世，本來應該是像他的父輩一樣，走讀書經商的道路，可自從9歲那年一場大病，卻把他推上了外來的教會方麵，而且似乎是從進入福音院門的那一刻，上帝就給他安排好了一條阻力重重又不能回頭的人生道路。現在，孔祥熙又一次麵臨著一個人生的十字路口。
華美公學畢業，孔祥熙已經15歲，長成一個小夥子了。孔家族人及時聚在一起，警告孔繁茲：行了，這小子在洋人跟前混得已經夠久了！應該從此把他領回來，經營錢莊當鋪了！如果再讓他跟洋人攪在一起，一是難免變成一個從思想到行為都洋化了的二毛子，二來也可能有性命之憂。
族人們的議論並非毫無道理。因為早在1891年初，長江流域就已經爆發過大規模的反洋教運動。成千上萬的人把各地的教堂圍住，向教堂吐唾沫，進行抗議的呼喊。花花綠綠的反洋教傳單貼滿大街小巷，繼而在城市的街道上空飄飛。一些平時耀武揚威的傳教士在街上一露頭，就會遭到憤怒群眾的追打。各地教堂被毀、傳教士被殺的消息時有所聞。雖然朝廷應洋人的要求，每次都對反教的行動進行血腥鎮壓，但許多地方群眾與教會的矛盾似乎越來越深，難免早晚鬧出一場大風波。