林肯的征兵令是根據國會7月4日通過的征兵法進行的。該法令授權總統可以隨時為軍事工作而自行征召任何數量的役期1至3年的誌願兵。
格蘭特因再戰中損失慘重，這時正是最需要人的時候。但同時因軍隊無所建樹，又是人們對軍隊意見最大的時候，林肯的征兵令引發了北部強烈的不滿情緒，而這種情緒正好又出現在和談未果的時候。
這時，格蘭特又失去了一次攻占彼得斯堡的良機。
給林肯雪上加霜的是韋德和戴維斯，他們因總統擱置其法案而導致的滿腔怒火，終於在8月5日的《紐約論壇報》上發泄了出來，譴責總統蓄意踐踏人民立法權。
林肯的不順到此並未結束。8月9日，當他就和談問題要求反對派格裏利公開與自己的往來信件時，吃了一次暗虧。
11月8日，天氣陰沉，下起了雨。19時整，林肯與秘書海來到陸軍部，坐聽選舉結果。因受風暴影響，電報線路不能正常工作。林肯便在那裏演講，同時告訴了在那裏的幾個聽眾他第一次選舉後所做的夢。
這天午夜，盡管有幾個州結果還沒來，但已可以基本肯定，林肯的當選是無疑了。
11月10日晚，人們前來白宮向林肯祝賀。當林肯走出白宮的時候，草坪上一片歡呼。
1865年3月4日中午時分，在國會大廈前舉行了林肯總統第二次就職典禮。人海中爆發出經久不息的雷鳴般的歡呼聲，總統同應邀出席的各界知名人士一道登上了講台。
林肯走到前列，宣讀第二次總統就職演說。全場頓時鴉雀無聲，人人凝神傾聽在這一莊嚴時刻所發表的具有曆史意義的演說。林肯在演說中說：
同胞們：
在這第二次宣誓就任總統時，我不必像第一次那樣發表長篇演說。對於將要執行的方針稍作詳盡的說明似乎是恰當而適宜的。現在，四年任期已滿，對於這場仍然吸引著全國關注並占用了全國力量的重大鬥爭的每一重要關頭和方麵，這四年間已不斷地發布公告，因此我沒有什麼新情況可以奉告。我們軍隊的進展是其他一切的主要依靠，公眾和我一樣都清楚地了解軍隊的情況，我深信，大家對之都是感到滿意和受鼓舞的。我們對未來抱有極大的希望，但卻不敢作出任何預測。
我們的軍事進展，是一切其他問題的關鍵所在，大家對其情形和我一樣明了，而且我相信進展的情況可以使我們全體人民有理由感到滿意和鼓舞。既然將來很有希望，那麼我也無須在這方麵做什麼預言了。
假使上帝要讓戰爭再繼續下去，直到250年來奴隸無償勞動所積聚的財富化為烏有，並像3000年前人們所說的那樣，直至被鞭笞所流的每一滴血為刀劍下流的每一滴血所償付為止，那麼，我也隻好說：“主的裁判是完全正確而公道的。”
我們對任何人都不懷惡意，我們對任何人都抱好感。上帝讓我們看到哪一邊是正確的，我們就堅信那正確的一邊。讓我們繼續奮鬥，以完成我們正在進行的工作，去治療國家的創傷，去照顧艱苦作戰的戰士和他們的遺孀遺孤，盡一切努力實現並維護我們自己之間，以及我國與他國之間的公正和持久的和平。
當林肯念到最後一段時，許多人眼裏已噙滿淚水。林肯把他的右手放在攤開的《聖經》上，跟著首席法官蔡斯複誦就職誓詞。