葉秀峰自上任以來，總擺脫不了與前任徐恩曾的比較。與徐恩曾相比，葉秀峰在反共方麵的成績可謂乏善可陳。葉秀峰深知：想要打開局麵，必須要在反共方麵做點文章。
抗戰勝利後，蔣介石在戰後的國內政治鬥爭中取得勝利，於是他派遣張治中偕同美國特使赫爾利飛往延安，迎接毛澤東來重慶參加政治協商會議。會議地點設在重慶國民政府大禮堂舉辦，時間為1946年1月10日至31日。出席此次會議的有國民黨8人、共產黨7人、民主同盟9人、青年黨5人、無黨派人士9人，共計38人。
本來政協會議與葉秀峰等人無關，但是此時的他卻秉承蔣介石的旨意，像一隻餓狼般盯著各民主黨派的一舉一動，特別是共產黨。葉秀峰還專門成立了一個“十人特工組織”，在“重慶實驗區”內進行大範圍調查、搜集共產黨人的情報。為此他還將其情報彙編成冊，每日呈報給陳立夫和蔣介石批閱。與此同時，國民黨極右分子對中共談判抱著悲觀態度，作為極右分子中的一員，葉秀峰也不希望國民黨在共產黨麵前妥協。於是他對局內特務強調：“即使政協會議談判成功，我們也要破壞共產黨的行動。”葉秀峰與陳立夫“珠聯璧合”，在與會期間便製造了著名的“滄白堂事件”。
政協會議召開期間，重慶各進步人士為了促進會議的順利進行，自發成立了政協會議“陪都各界協進會”。自1946年1月12日至27日間，連續八次召開各界民眾大會。大會從第四次起便在重慶滄白堂進行。由於與會民眾眾多，每一次開會都會引起國民黨的極大恐慌。葉秀峰見此狀況，非常煩惱。他問陳立夫：“咱們是不是該行動了？這樣下去非鬧出事情來不可！”
“是啊，重慶人已經瘋了，唯獨棍棒才可解決！你盡快安排一下，千萬不能讓這群人鬧出亂子！我擔心的是，共產黨會借此機會大做文章。”陳立夫目露凶光，他見不得民主分子在他眼前“跳舞”。
葉秀峰非常重視此事，於是連續派中統特務在會場裏進行搗亂、打雜。其中1月14日，協進會恰逢郭沫若講話，當郭沫若激情澎湃地講到“軍隊要成為國防軍，不能成為黨軍”時，混在人群中的特務便開始搗亂起來。特務們時而大呼小叫，時而揮舞著棍棒，現場一度陷入混亂，此次會議不得不被迫終止。
1月17日，協進會剛剛開始沒多久，一群特務拿著喇叭在民眾間狂吠：“打倒共產黨，擁護國民黨。國民黨萬歲！總裁萬歲！”特務們一邊喊，一邊趁機搗亂，如此一鬧又令會議終止。
1月18日，葉秀峰安置的特務變本加厲，他們一邊搗亂，一邊向會議主席台投擲石塊。本來政協代表王若飛要發言的，見此場景隻好作罷。
1月19日，搗亂已經演變為赤裸裸的恐怖事件，其中許多政協代表、媒體工作者遭到了特務們的謾罵和毆打，許多人被特務打傷。這個事件就是著名的“滄白堂事件”！得知協進會無法召開，葉秀峰非常高興。他表揚自己的手下一番：“你們做得不錯！他們散了會，共產黨就無法做文章了！”雖然葉秀峰有些沾沾自喜，但是卻無法控製政治協商會議的走向。
由於與會人員代表著中國三種不同的政治力量，即國民黨、中共以及民主力量，所以政治協商會議圍繞著“改組國民政府、施政綱領、軍隊、國民大會、憲法草案”等五個問題展開了尖銳、複雜、激烈的討論。中共代表順應民意，團結各黨派民主分子與國民黨極右勢力進行堅決鬥爭，最後使會議通過了有利於和平民主和人民的決議。關於軍隊問題，經過反複討論，最後通過了“軍隊屬於國家，軍黨分離，軍民分治”等原則，並由國民黨、共產黨、美國代表三方商定整編國共兩黨軍隊的辦法，從而挫敗了國民黨的政治陰謀。關於政權問題，經過艱苦的協商討論，會議通過了《和平建國綱領》，綱領確定建立統一、自由、民主的新中國，從而確保國家的和平發展。綱領還規定政府委員會為最高國務機關，並擁有用人權，政府委員名額的一半由國民黨以外的人士充任，而所有涉及施政綱領之變更，須由出席委員三分之二讚成始得議決等，一改國民黨一黨獨大的政治局麵。關於改組後的政府，三方協商認為，從結束國民黨“訓政”到實施憲政的過渡政府，負有召集國民會以製定憲法的任務。政協會議通過的憲法草案規定，確立立法院為最高立法機關，並由選民直接選舉產生，而行政院作為最高行政機關，並對立法院負責。但是立法院對行政院內閣不信任時，行政院或辭職，或有權提請總統解散立法院。政治協商會議前後曆經22天，最後共產黨與各民主黨派聯合迫使國民黨簽訂了《關於政府組織問題的協議》、《和平建國綱領》、《關於國民大會的協議》、《關於憲章問題的協議》、《關於軍事問題的協議》等五項協議，蔣介石非常生氣。