但是由於耶律齊背叛的太過隱秘，郭破虜還相信這個姐夫，因此被耶律齊給八思巴帶路，將郭破虜擊殺，屠龍刀也由此落入了元廷的手中。隻是後來，元廷始終沒有發現屠龍刀的秘密，於是便將屠龍刀當成一件普通的神兵利器。乃到元末，元朝忌憚中原武林，於是故意放出屠龍刀，並放出百年前的傳言“武林至尊，寶刀屠龍，號令天下，莫敢不從，倚天不出，誰與爭鋒”，來吸引江湖人士因為屠龍寶刀而自相殘殺。
至於郭芙帶著倚天劍，也遭到了耶律齊的截殺，正在此時，神雕俠楊過出現，擊殺了耶律齊，擊退了蒙古國師八思巴，救下了郭芙。原來小龍女當年情花之毒其實並沒有解掉，隻是因為絕情穀底與世無爭的特殊環境得以壓製，然而一離開絕情穀，動了情愛之心，數年後就病逝了。
楊過悲痛欲絕，然而終究緩了過來，他聽說蒙古人攻勢凶猛，於是就來襄陽相助郭靖黃蓉一臂之力。然而楊過終於晚來了一步，郭靖黃蓉以身殉國，郭破虜未能逃脫，被八思巴殺害。
楊過也隻來得及救下郭芙而已，眼見郭芙國破家亡，楊過與郭芙訴說當年情感，卻是發現楊過其實愛著郭芙，郭芙心中也愛著楊過。於是乎，孤苦無依的兩人就結為伴侶，後來又生下了兒女。耶律齊死後，因為和丐幫和郭芙的淵源，古墓一派始終都丐幫照拂有加。這也就是為什麼倚天屠龍記時機，丐幫出現大危機，卻去找古墓派求救，而沒有去找同樣淵源極深的峨眉派。
而那黃衫女，眾人皆以為是楊過與小龍女的後裔，卻殊不知，小龍女出絕情穀底之時，已經四十歲了，又情花之毒未解，積毒多年，已經不可能生育。因此小龍女在度過一段快樂時光之後，就香消玉殞。這黃衫女卻是楊過和郭芙的後代。
一是這黃衫女出現在屠獅大會，以正宗的九陰神爪破去周芷若的九陰白骨爪，精通九陰真經。而眾所周知，楊過所學的九陰真經殘缺不全，全本的九陰真經包括總綱，隻在郭靖黃蓉那裏。所以其實是郭芙帶來了全本的九陰真經，傳給後裔。
而郭芙不止帶來了完整的九陰真經，還帶來了降龍十八掌還完整的桃花島一派的武功，這也就是為什麼古墓派隱藏極深，外人絕難窺探，就是因為有黃藥師的九宮八卦之陣防護。而黃衫女的侍女，也以八卦排列。
而那郭襄，雖是“一見楊過誤終生”，但是聽聞父母殉國弟弟慘死的噩耗，終於大徹大悟，創立了峨眉派。峨眉派幾代人都立誌反元，哪怕傳到滅絕師太，滅絕師太都和元朝勢不兩立。無他，實在是峨眉派與元朝有著血海深仇。
而多年之後，楊過和郭芙來到峨眉，將倚天劍交給郭襄。三個人都已經老了，郭襄看到姐姐與自己朝思暮想的楊過在一起，卻是一時無語，百感交集。
所以後來郭襄半句話不提姐姐郭芙，峨眉派也去丐幫老死不相往來。
但是由於耶律齊背叛的太過隱秘，郭破虜還相信這個姐夫，因此被耶律齊給八思巴帶路，將郭破虜擊殺，屠龍刀也由此落入了元廷的手中。隻是後來，元廷始終沒有發現屠龍刀的秘密，於是便將屠龍刀當成一件普通的神兵利器。乃到元末，元朝忌憚中原武林，於是故意放出屠龍刀，並放出百年前的傳言“武林至尊，寶刀屠龍，號令天下，莫敢不從，倚天不出，誰與爭鋒”，來吸引江湖人士因為屠龍寶刀而自相殘殺。