小智在來到金黃市之前經曆了與巴大蝴的分別。
之後繼續著訓練，不過加上了每天早上的打坐和跟著小霞和小剛做小精靈的實戰訓練。畢竟幻境跟現實還是有些區別的，在幻境中對戰鬥能力的認知是有一些誤差的，所以隻能作為增加小智和小精靈之間的默契。當然小精靈的其他一些知識像讓小智大體的認識一下各個地區比較常見的小精靈也是直接通過幻境來交給小智的，免得在對戰的時候還要看圖鑒，並不是所有人都給小智看圖鑒的機會的。
時間在這樣充實的訓練下過得也非常的快，在來到金黃市之前王靈特地給常磐森林正在建設的家裏打了電話，讓冰菱、鬼蟬、鬼依前往大木博士的研究所，告訴它們自己會在黃金市的時候將它們傳送過來。之後王靈又聯絡大木博士，告訴大木博士這件事情。
在之後的時間裏小智的修行已經看見了效果，皮卡丘現在不僅僅擁有強悍的電係能量攻擊，還有著不俗的近戰能力，並學會了鋼之尾等近戰的絕招。還有就是皮卡丘的速度，敏捷以及靈活性也是大大的增加，同樣的順利的學會了電球，打雷等電係絕招，使得皮卡丘的實力更上了一層樓，
小智的火恐龍也有了十足的長進，不管是火係的能量還是近戰的能力都非常的突出，顯然這隻火恐龍的天賦非常的出眾，而且在經曆過遊町碼頭的戰爭之後，火恐龍和小智之間有了一段時間的磨合，並沒有像原本那樣小火龍自進化成火恐龍之後就不聽小智的指揮，現在的火恐龍認同了小智作為它的主人所擁有的實力，能夠激發出它全部力量的訓練家指揮的實力。
雖然王靈的主要是讓小精靈自己訓練，有著豐富的戰鬥經驗和一套自己的戰鬥方式，當然這主要是為了以後小精靈實力強大之後訓練家跟不上戰況無法下達指令從而使自己落敗的尷尬情況，但是現在卻是要小精靈在訓練家指揮它戰鬥的時候努力的吸取其中的經驗，讓自己不會在沒有訓練家指揮戰鬥的時候使自己的戰力降低，讓原本應該勝利的戰鬥失敗。
然後是小智的其他小精靈，都有了不少的實力提升，傑尼龜學會了水炮絕招，妙蛙種子學會了種子炸彈，比比鳥學會暴風，現在的比比鳥隨時都能夠進化成大比鳥。
而小智現在依然沒有感應到波導的存在，其實在之後的幾天的時間裏小智就已經做不下去了，都是靠著王靈和小剛的監督才堅持下來的。除了小智之外，小霞和小剛也有了不少的提升。
不久之後，王靈和小智等人來到了黃金市，這一次是由王靈帶的路，自然也就沒有出現走著走著就迷路的情況發生。
來到金黃市之後，王靈感受到了一股能量的波動，覆蓋著極大的一片區域，王靈知道是娜姿已經發現了自己等人，同時也不由的驚訝娜姿的實力比之之前提升了很多，跟自己一樣也是六階，甚至還在自己之上。
“來了！”娜姿睜開了眼睛，她“看”到了這幾年的時間唯一一個擊敗自己的人又來了。