黃帝成為人皇之後，先得常先、大鴻，又得風後、力牧，更有大神應龍相助，這應龍乃是與燭龍一般的龍族。天皇伏羲證道，龍神應運而出，便取名為應龍。行雲布雨，號令四時，為人族崇拜，以其為圖騰。
且蚩尤自煉成蚩尤旗後便大肆進攻黃帝，使得黃帝族民死傷無數。黃帝便欲再次征伐蚩尤，眾臣亦願隨黃帝再次征討蚩尤以使天下太平。今九黎有將前來渭水叫戰，黃帝以力牧為大將，隨同出戰。
蚩尤聞黃帝再次親帥大軍前來，由九黎部前來，要與黃帝再爭高下。大軍陣前，謂左右道：“軒轅小兒不自量力，上次敗回，今我煉成大陣，其竟又來。實不畏死也，其心可嘉。其若做家中不出，我還需費些功夫將其擊敗，今其率大軍而來我當將其斬殺於此，奪得人皇之位。說完便率軍而出，意欲一戰而定，將黃帝斬殺於此。
兩軍擺好陣勢，這邊黃帝仁慈還欲勸蚩尤歸降便說道：“蚩尤，汝擅起刀兵，使得生靈塗炭，今我起大軍而來，汝若早降還可免得九黎之眾免遭屠戮。”
蚩尤大笑道：“軒轅小兒，汝有何德何能，可竊居人皇之位，不若早降，我還可留你一命。”那邊應龍大怒道：“蚩尤！汝不過一蠻荒匹夫，怎做的人皇之位，來來來，且與我大戰三百回合。”
說完便上前使出神通，隻見九天之上降下大水向蚩尤大軍衝去，直如九天破碎，天河倒懸。
九黎部眾一時大為恐慌，皆兩股顫顫欲轉身而逃，大巫風伯、雨師見狀大笑道：“應龍，此乃小術爾，且看我兄弟神通。”
說完便使出神通。隻見風伯一揮袖天上頓時卷起大風，將應龍所放之水攔於半空，卻是落不下來。雨師揮手間降下大水向黃帝陣中落去，風伯見狀也將自己所攔之大水向黃帝陣中落去，應龍雖有神通卻也是不敵風伯、雨師兩位大巫。一時敗下陣來。卻見一陣大水將黃帝軍陣衝散，蚩尤趁機一陣掩殺，將黃帝殺的大敗。
不說蚩尤大敗黃帝收兵回去舉城歡慶，這邊黃帝收攏敗軍後退百裏紮營。應龍上前說道：“陛下，臣先敗一陣使得蚩尤衝動了陣腳，致使我軍大敗，今特來領罪。”
黃帝上前扶起應龍說道：“卿何罪之有，那風伯、雨師神通廣大，且是兩人其上，卿不敵也是無可奈何。”
黃帝將應龍扶起便轉身對眾臣說道：“今我軍大敗軍無戰心，我欲退兵，以助其驕狂之心，等十日之後，再行與其交戰，不知眾位意下如何？”
眾人皆曰：“善。”黃帝遂退兵守住關隘，以阻蚩尤大軍。
十日後，黃帝遂再起大軍前往攻伐，蚩尤亦是親領大軍迎戰。風伯、雨師兩位大巫故技重施，刮起颶風、降下大水。
黃帝大軍見又是如前次一般，頓時大懼。卻見從黃帝身後走出風後力牧，以異術定風雨，黃帝乘勢掩殺，九黎部措手不及，大敗！
炎黃部場大勝，再九黎部近期再無戰事，便等待廣成子邀大神通者前來破了都天煞氣。
卻說廣成子回到昆侖山，與元始天尊稟明因由。元始天尊切指一算後，對廣成子說道：“人族自有仙神前去相助，你耐心等待便是。好生輔佐人皇！”
聽到元始天尊如此說，廣成子拜別後，再次回到人族，與軒轅說明後，再不如九黎交戰，掛起免戰牌，任九黎部將如何叫戰，都不回應。
再說虎魄神刀出世，天地有異象，被太清道人所知。叫來玄都大法師，與他吩咐道：“如今人皇有難，你可持此物前去瀛台山，聽從明玉道友所囑，接引應劫者前去相助人皇。”太清道人說完後，取出一方印璽，正是先天靈寶崆峒印。
玄都大法師得了崆峒印後，與太清道人拜別後，去往海外瀛台山。
自巫妖大戰後，有天皇伏羲證道。明玉出瀛台，教導伏羲，功成身退後，便回了瀛台山，息心教導眾弟子。
當年鯤鵬帶著商羊昆吾截殺後羿，被明玉所救。隻等巫妖大戰後，便為他們重塑身體，收其為弟子，修行正宗道法，如今個個道行已然恢複大半，已經鑄成道基。他二人原來乃是妖族大聖，根腳不凡，此次重修，進境極快。知巫妖大戰後，妖族精英盡失，更有大太子也入了明玉門下，便心甘情願入了明教，再不理妖族之事。