到了這一步，這個案子的利用價值被挖掘得差不多了，高宗又一次展示出了他高超的演技，他長歎一聲，潸然淚下，說道：“舅若果爾，朕決不忍殺之。若殺之，天下將謂朕何！後世將謂朕何！”意思是，舅舅就算是謀反，朕也絕對不能殺他。朕要是殺了他，天下人會怎麼議論朕呢？千秋萬代之後，人們又將怎麼議論朕啊？
不是罪名的罪名，生拉硬扯地給長孫無忌扣上謀反的罪名，還要來一番仁慈的表演，要對長孫無忌法外開恩，免去長孫無忌的死刑，可見帝王之心是高深莫測的，這個高宗確實很高。不過，這樣的話他已經不是第一次說了，當年處理高陽公主謀反案的時候，他曾說：“荊王，朕之叔父；吳王，朕兄，欲丐其死，可乎？”意思是荊王李元景是自己的叔父，吳王李恪是自己的長兄，朕想赦免他們的死刑，行嗎？當時的長孫無忌沒有同意他的要求；現在的許敬宗也展示了和當初長孫無忌同樣的風範，勸他大義滅親：“古人有言：‘當斷不斷，反受其亂。’安危之機，間不容發。無忌今之奸雄，王莽、司馬懿之流也；陛下少更遷延，臣恐變生肘腋，悔無及矣！”許敬宗不愧是當年的秦王府“十八學士”之一，博古通今，把長孫無忌比附成曆史上的王莽、司馬懿，必須當機立斷處決他，以免引發禍亂，絕不能有半點婦人之仁。話說到這一步，該解決的問題都解決了，案情重大，處罰的理由足以讓天下人心服口服。但高宗心裏清楚，長孫無忌到底不是王莽、司馬懿，於是，在處罰時還是對他網開一麵：下令削去長孫無忌的太尉頭銜和封地，給他一個揚州都督的頭銜，押往黔州安置。黔州是現在重慶的彭水縣，那地方現在還是國家級貧困縣，更不用說當時了。不過，唐高宗又一次體現了他的“仁慈”，說長孫無忌到底是他的親舅舅，曾經有大功於國，不忍心看著他去那個地方受苦，因此仍按一品大臣的待遇供給飲食。
長孫無忌倒台了，唐高宗和武則天再也沒有什麼顧忌了，他們決定收網，把反對派一網打盡。
長孫無忌謀反案剛剛處理完，許敬宗又奏：“無忌謀逆，由褚遂良、柳奭、韓瑗構扇而成；奭仍潛通宮掖，謀行鴆毒，於誌寧亦黨附無忌。”就這樣，所有未曾追隨武則天的元老重臣無一漏網，全被免去了所有官爵。
但這還不是他們最終的目的，也許這些隻是高宗的意思。但現在很多事情都由不得高宗了，他的背後還有一個武則天，武則天可不是一般的女人，她是一個比男人還狠的女人，像這樣的事情，她要麼不做，做就要做絕。
於是，三個月後，李勣、許敬宗等宰相又奉命追查長孫無忌謀反案，進行深度挖掘。這是一個饒有趣味的人事安排，李勣本來不問朝中大事，可這回居然安插進了審判集團，這等於告訴世人：你看，連一向不多言語的李勣都認為你們有罪，你們還敢抵賴？李勣雖然受命，卻仍然保持了他的本色，沒有幹那些落井下石的事，這是情理之中、意料之中的事。不過，許敬宗表現出了再接再厲、痛打落水狗的本色，他派中書舍人袁公瑜到黔州去錄長孫無忌的口供。袁公瑜是當初擁護武則天當皇後的第一批先鋒，裴行儉和長孫無忌議論武昭儀的事，就是他告的密，那時他隻是一個八品的大理丞，現在他已經是五品的中書舍人，小人得誌後往往很張狂。他奉命去錄長孫無忌的口供，其實他什麼也沒有錄，連審問程序都省了，直接對長孫無忌說：“你最好自我了斷，省得我再費一把力，大家都難堪。”長孫無忌長歎一聲，心知大勢已去，無可挽回，死是他最好的選擇，於是他自殺了。
很快，王皇後的舅舅柳奭和韓瑗也被斬首。
“城門失火，殃及池魚”，隨著這批元老重臣的死去，他們的家族也遭受到了滅頂之災。成年的兒子全被處死，近親被流放嶺南，受株連貶官的遠親則更多。長孫無忌的兩個兒子長孫衝和長孫詮都是駙馬，一個娶了長樂公主，一個娶了新城公主，這兩個公主都是唐太宗與長孫皇後所生，是嫡女，跟李治是同父同母的胞親。但以她們這樣的身份，亦無法免去丈夫所受到的刑罰，盡管他們是無辜的，兩個駙馬一同被杖殺。真正是：覆巢之下，豈有完卵！
對啦，那個被廢太子梁王李忠不是也給牽扯進來了嗎？既然進來了，就甭想逃脫。顯慶四年七月，李忠被廢為庶人，安置在黔州原廢太子李承乾的故宅裏。
一番血腥的清洗之後，一種全新的政治格局誕生了。以關隴貴族為首的世家大族受到了沉重的打擊，重量級人物及其親屬死的死、貶的貶，已無還手之力。朝廷裏空出了很多位置，許敬宗、李義府、袁公瑜這些新近提拔起來的中下層官員進入朝廷中樞，成為武後參與和把持朝政的馬前卒。
此時，皇權得到了加強。自魏晉南北朝以來，皇帝一直在和貴族官僚聯合治理天下，正因為如此，在廢立皇後的問題上，皇帝才不得不征求大臣的意見，受製於大臣。隨著元老重臣的垮台和一些新生力量得到提拔，皇帝麵對的不再是一幫位高權重的名門顯貴，而是一幫一般官僚，可以對他們招之即來，揮之即去。皇權高高在上，有了更大的回旋餘地。
政治格局的重組是以廢王立武為導火線的，支持武則天的人上台，反對武則天的人滾蛋，武則天成了朝野上下抹不去的厚重符號。此時的武則天，上有唐高宗的專寵，中有太子李弘作為依托，外有許敬宗、李義府為羽翼，勢力遍及朝野後宮。麵對這樣的格局，想讓她安心地呆在後宮，滿足於六宮之首，是不現實的。
職場聖經語錄
武則天之所以能擊敗長孫無忌等元老重臣，是借助了皇權的力量，利用了皇權與相權的矛盾。在這一過程中，皇權與後權結成了統一戰線，皇帝和皇後不僅是夫妻，更是同一戰壕的戰友。一番艱難的角逐後，皇帝不再是大臣的槐儡，皇後超越了母儀天下的範疇，兩人實現了雙贏。統一戰線在任何時代都是克敵製勝的法寶。打擊元老重臣是武則天參與和幹預朝政的跳板，這個不安分的女人還想試一試朝堂的水到底有多深。