本來校長以為他們是聯合國的部隊，將巴比倫的手就不對成員關了起來，可是從他們的證件中認識到了一個新的國家存在，那就是巴比倫。所以校長也就見他們放了，可是巴比倫的談判代表就此威脅校長必須將比利亞斯劃歸到巴比倫當中，並且還向校長展示了巴比倫的軍事實力，可是所有人都沒想到的是，這個看似不能讓步的要求居然遭到了囂張的反對，同時將這批人驅逐出了比利亞斯。也就如此，才促成了後來被巴比倫稱為“隕落”的戰爭。
消息傳回到巴比倫本土以後，巴比塔並沒有對市民宣布找到了幸存者，相反，巴比塔裏的幾個靠著馬克辛機關度日的人居然將巴比倫本土的守備軍團抽調出去了一大部分參與到了對比利亞斯的作戰當中去了，同時在戰爭是嚐試了新的武器，包括新服役的飛行艦，以及巴比倫自己開發的機甲部隊，被人戲稱為“怪胎”的機甲。擁有四隻手臂，瘦小的機身都讓人懷疑能不能實現作戰計劃，在機甲的身後則是一個很大的圓柱形金屬背包，那裏麵裝的是人為製造的實體化的絕對防禦領域，雖然保護了隨時隨地都可以保護機甲，可是卻不能承受太大的傷害，機甲身上還有多個金屬扣環，可以讓怪胎們借助這些金屬掛環發射出去的小型鋼爪，以及連接鋼爪的合金絲，實現飛簷走壁。同時隨艦隊遠征的還有巴比倫的第一家非量產型機甲—刀鋒女王，巨大的黑翼下是原先的自由女神，機體被噴了個漆黑，手中拿著一把可以張開變成死神鐮刀，折疊後是一把連弩的武器，而它的駕駛員就是當年自由女神的駕駛員—白子嬌。
結果是教皇伊麗莎白在教會學校即將被攻破的時候派來了增援部隊，由斬月和重新翻修過的月神以及黑武神型新型量產機，最終教會堅守住了陣地，保衛了比利亞斯。當戰爭的消息傳到巴比倫本土時，終於有人站了出來開始阻止巴比塔的行為。最終遠征的部隊迫於壓力返回了巴比倫，參加了巴比倫建成以來最大的叛亂活動。可是，就算如此，比利亞斯還是沒有獲得重生，相反，字巴比倫部隊撤退後，比利亞斯便遭到了N-BOX2的打擊。
值得一提的是，巴比倫在設立軍隊配置上和過去有很大的不同，整個巴比倫的部隊被分為了常年進行海外搜救任務的搜救兵團，他們的肩章上的圖案是一隻五指都張開的手掌，在手掌的中央是一個船錨，一對翅膀在船錨後麵。
還有一支部隊是在巴比倫的海岸線上的衛戍兵團，他們肩章上的標誌是一塊中間繪著一把寶劍的盾牌，他們是巴比倫的所有部隊中擁有機甲種類最多的部隊，比如說他們擁有巴比倫唯一一支斯巴達該型機甲部隊，輕騎兵團，同時他們也擁有大量的重型火炮和裝甲部隊，並且擁有一支在由各種驅逐艦，護衛艦以及潛艇，導彈艇組成的海上部隊。可以說衛戍部隊是巴比倫最堅固的一道防線。
最後一支部隊就是很神秘的守備兵團，也被軍隊自己稱為守備駐屯軍。兵團士兵的肩章上是一把朝下的大鐵錘，他們擁有巴比倫軍隊中最多的飛行艦以及全部的怪台機甲，作為一隻活躍在整個巴比倫乃至全世界的武裝力量，隨時準備為巴比塔而戰。
巴比倫的曆史也是人類的新曆史，人類將在這一刻複興。