1646年9月13日，遼陽城在時隔25年後，被明軍重新占領。
鑒於城中的建奴進行了激烈的反抗，並殺傷許多。進城後的明軍將其中有官銜地位的建奴先行挑出，然後餘者全部斬殺殆盡。
而到了下午時分，待徹底控製全城後，明軍開始對建奴的的居所進行有組織的劫掠。一些被解救釋放的漢奴自發地拿起棍棒、石塊，也對曾經高高在上的“主子”進行清算。他們在明軍士卒搶掠完建奴屋宅後，緊隨其後地躥入屋中，再次進行一番徹底搜檢。未了，對昔日凶惡的建奴“主子”和包衣奴才，瘋狂地虐待和殘殺。
此役，明齊聯軍克複遼陽，斃建奴盛京總管葉克書以下八旗佐領、參領等將官五人，八旗甲兵三百餘（含眾多老弱壯婦），盡俘城中八旗軍民。雖然，建奴在城破時，到處點火焚城，試圖與來攻明軍玉石俱焚。好在聯軍攻入城中速度夠快，撲滅部分主要府庫大戶的燃起的大火，估計在清點收獲後，多少令聯軍官兵感到滿意。
但是，最為聯軍看重的糧庫，卻是焚毀大半，讓牛虎等人大為惱火。隨即，令李本深部，將俘獲的八旗將佐和婦孺，實施三一抽殺令，以示懲戒。
既克遼陽，此行攻略遼東的目的基本全部達成，接下來，就是組織官兵和解救的漢民將這座遼陽城搬空，最後順利撤退至海邊，返回登萊。雖然，聯軍派出了許多遊騎和狙擊隊官兵遮斷沈陽方向的一切聯係，但誰也不敢保證，不會有漏網建奴逃回沈陽。
不過，待沈陽的建奴集結各地軍隊，然後再前來追擊聯軍的話，最快也要四五天以後了。那時，想必聯軍已經撤到海邊了。
“牛帥，我們得到一個重大消息！”李本深帶著幾個軍官匆匆地趕到昔日奴酋修建的所謂王宮，滿臉喜色地說道：“建奴不僅是遼陽非常空虛，就是他們的都城--沈陽，也是異常的虛弱，駐防的八旗甲兵不僅四五百人！”
“確切嗎？”牛虎聞言，神色一動。
“剛才實施抽殺令時，一名來自沈陽的八旗參領竟然有一個恩封的三等奉恩將軍爵位（皇室近支因祖恩而得封爵稱為恩封），臨刑時，突然跪地乞降，聲言可提供我等有關遼東情形，隻為活命。”李本深興奮地說道：“我部一名參將隻是隨意詢問他一番沈陽情況，對方卻說，沈陽與此地一般，都是無大軍駐守！”
“不會是誆我們吧？”李發德懷疑地問道。
雖然建奴已經遷都北京，可沈陽好歹也是他們此前的都城，更是遼東的統治中心，怎麼會不留軍隊駐守。
“好叫這位李將軍知道，那建奴剛才告知我等，沈陽原本有甲兵五百餘，半個月前，他們的盛京總管帶了一百餘甲騎來到這遼陽城。如今，沈陽之兵恐怕已不足四百之數！”李本深笑著說道。
“將人帶來，俺們再仔細詢問一番。”牛虎說道：“另外，再多拷問幾個建奴，確認沈陽到底有多少兵力。”
“牛帥，我們當真要打沈陽？”鄭森顫聲問道，他隻覺得此時血脈噴張，眼中透出異樣的光芒。
那可是建奴的都城！若能克之，必然天下震驚，世人為之矚目。
“有機會的話，也可以考慮做票更大的！”牛虎也覺得自己此刻有些血往上湧，然後深深的吸了一口氣，沉聲說道。
明齊聯軍的最初目標，不過是攻克遼陽，然後毀其城，掠其財貨人口。但令他們所有人意想不到是，建奴於遼東的軍事部署，要比他們想象中還要薄弱。
建奴在入關後為了與南明、農民軍作戰，曾經數次從關外抽調甲兵進入關內。多爾袞帶八旗主力隨吳三桂進入山海關後，一路追逐李自成的順軍，直至山西。後來，順治帝福臨入關遷都北京，又將留守的關外大部分兵馬悉數帶至關內。
隨著清軍勢力的迅速擴展，作戰、戍守部隊肯定會比初始派出的13～14萬軍隊的基礎上增加很多。幾乎將遼東所有精壯、甲兵全部抽調入關，以鞏固和維護清軍的統治秩序。