但是，武國的局勢並沒有緩解，四國大軍攻入武國境內，雖然遭遇激烈抵抗，但是卻穩步朝武都推進。
長公主率領飛鳳軍與周國大戰數十場，最後帶著數萬殘軍逃入了太行山中。當四國大軍兵臨武都城下時，武國國師背叛，擊殺了武青帝與諸位皇子，滅了武國皇氏，僅有長公主逃過一劫。
武國被滅，百姓流離失所，流民遍天下，而四國之間也因瓜分不均，爆發了更加混亂的戰爭，在巴山脈也受到影響，先後有多支軍隊攻打山寨，但是都被消滅。
而武國的大量殘軍，紛紛逃入各地大山中，在一批年輕將領的帶領下，繼續頑強地抵抗著各國的軍隊，時不時傳來一些消息。
方賢醒來，發現自己全血經脈盡斷，已經失去了修為。而桃花夫人殷素心比他先醒來，還保留著一流高手的修為身手，然而卻失憶了，自以為是方賢的夫人，因此在方賢醒來的晚上主動與他雙修，幫助他療傷。
方賢動彈不得，隻能任她施為，如此半月後他才恢複了行動能力，但是卻不敢告訴殷素心兩人的真正關係，同時雙修確實有助於彼此療傷。
而在方賢療傷的同時，葉紅袖、鳳玲分別帶著山寨人馬潛入劍門縣內搜尋方賢，並與各國派來搜尋方賢行蹤的武林人士展開廝殺，朱十妹也從道宗下山而來，她已經突破化境宗師，並習得道宗的太清妙法。
在她們遇到各國武林人士圍殺時，有一個老人突然現身救了她們，卻是方賢之前所救的七叔，他在劍門大戰前，被方賢送到了廣元城去，此時恢複了所有記憶與實力，竟然是一個先天大宗師。
就在眾女一籌莫展時，隼王突然返回，帶來了方賢無事的消息，隻不過方賢現在距離她們太遠，讓她們不要著急，回山寨等候消息，七叔與她們一同返回了山寨。
此時，山中基地已經收容百姓三十餘萬，外圍多個山寨還有十餘萬陸續收容的百姓，而山寨的軍隊也達到十五萬左右，正在進行著不斷的訓練，那近兩萬將士成為骨幹，天天向士兵講述方賢的神勇故事。
兩個月後，方賢恢複，他的身體素質全麵提升，修為也突破到化境宗師境界，而殷素心的修為則恢複了先天大宗師境界，但是她的頭部受傷，記憶仍然沒有恢複。
武都淪陷，武朝覆沒，四國繼續爆發亂戰，天下蒼生受苦受難。方賢帶著一眾紅顏輾轉江湖，憑借神醫之名活人無數，收納無數百姓到各地山寨。
四國均不顧武朝百姓死活，將中原當做肥肉爭奪搜刮，致使中原民不聊生，方賢決定自立旗幟，聯合武朝有誌之士，自任大元帥。
方賢采用新式練兵方式訓練精銳大軍，采取自治方式聯合各地義士，采取均田分地法收納流民，在四國夾縫中一邊生存一邊壯大。
最終，武者大軍練成，橫掃四國精銳，逐步恢複原武朝地盤，並不斷吞噬原四國領地。方賢擊敗天下三大巔峰強者，成為當世第一人，滅四國統一天下，方賢登基為大帝。
二十年後，方賢的孩子們揮軍征戰四海，統一大海遠方諸國，建立大小公國，而他則將帝位傳於他和長公主的兒子，帶著一眾紅顏破碎虛空飛升而去。