印尼的內亂自然引起了聯合國的重視，特別以美國為首的西方勢力，並不希望在印尼形成一個親華勢力。而他們在印尼華人的突然倔起中，似乎看到了中國的影子。為了遏製中方在印尼的影響力，很快地，一個聯合國多國組成的調停小組就進駐印尼，敦促印尼各方坐下來，商量出一個解決之道。
此時，印尼各民族有武裝的已經在不少數，想回到過去那種國體顯然已經不可能了。
於是，一個依照美式民主的各民族自治聯合政府，就成為比較受歡迎的選擇。在這個聯合政府的大框架下，各自治省都有自己的警察部隊。但聯合政府對外隻有一隻軍隊。
謝寸官自然不能答應這一點，因為這變相地就是要收繳華人手中的軍隊。因為在整個印尼國內，此刻隻有華人自治軍能與政府軍進行全麵抗衡。
以林耀輝牽頭成立的華人自治政府堅決地拒絕了這個提議。
拒絕就意味著內戰，經過近一年的紛爭，總統和國會已經幾乎失去了大部分權力，印尼的經濟已經急劇衰退，各方也都沒有得到什麼好處。而且，現在的印尼政府軍已經是一盤散沙，很難有統一步調的指揮了，這樣也就很難在短期內同華人自治軍的作戰中取得勝利。
最後雙方就不得不各退讓一步，華人自治軍做為印尼軍隊的組成部分，在和平時期，隻保留目前人數的三分之一存在，主要留存全部空軍和海軍，以及極少部分陸軍。在戰爭時期，華人自衛軍接受印尼政府的統一領導，抵卸外敵。
這當然是目前的妥協，因為華人對印尼政府缺乏信任感。
也許有一天，華人真正的同印尼人融為一體時，互相取得信任和尊重時，這個問題也就迎刃而解了。
在新政府成立的紛亂時刻，林耀輝和過去的華商總會，以及印尼幾個華人政黨，在緊急組成華人自治省政府，而謝寸官則同王一丙對一起，對黑龍會一幫人進行了分別審問。在任盈取得的大量錄音證據麵前，幾乎沒有什麼可問的。
發給謝寸官的隻是任盈所有錄音的最後關健部分，其他大量的證據，都被任盈保存著。
所關鍵的，隻是確定這些人的身份。
而且，在這些日本人的文件中，也發現許多前政府官員收受賄賂，縱容甚至幫助日本人實施暴亂的證據。就好像波拉瓦局長隻所以遲遲不出警，就是因為收到了黑龍會送來的大量現金。而且，收受賄賂的並不僅僅是泗水市的一些市政官員，也包括當時的政府部分高官。
在取得充分證據後，華人自治省政府公務的第一件事，就是將泗水九月暴亂的相關證據和策劃人員提供給新任政府，要求對此事做出處理。
麵對這個所有自治省中，惟一擁有可抗衡政府軍隊的自治省，印尼政府在多次磋商後，終於作出決定：柴田弘等人做為日本公民，在印尼國內從事暴亂策劃，首犯柴田弘判處監禁六年，其餘人分別判處一年到三年不等，執行監禁後遣返日本國內；日本國民做為印尼不受歡迎國民，在短期內禁止入境；目前在印尼的日本國民，立刻限期離開印尼。
對於哈迪斯做為印尼公民，做出策劃暴亂，嚴重威脅印尼國家安全的行為，判處絞刑。
其他參與九月泗水暴亂的那些極端民族分子，都一一按其罪行逮捕判刑。而那些受賄的高官，也都受到了應得的處罰。
然而，印尼內亂剛平，自然難免各方勢力的滲透，柴田弘等日本人被移交印尼政府的當天晚上，竟然集體越獄逃跑。而前去抓搏哈迪斯的警察，也撲了一個空，哈迪斯早就帶著幾個得力的手下，帶著大批金錢，逃離了泗水市。