他已認真考慮過婚姻這個問題，並且為自己的一生訂出了計劃，他在給表兄吉姆的信中說：“雖然我們的專業差別大，但我們都會在商界，出於這一原因，我們有責任選擇這樣的女人做我們的妻子，也就是說當我們下班回到家時，她們必須做好一切準備使我們開心，而且對我們的家庭感到滿意。”
談到未來的妻子時，他說：“重要的是她必須是內向的，她的心必須在家裏係在丈夫和孩子身上，而不是在外麵世界。”
盡管霍夫曼小姐不是他理想的選擇，但摩根還是很熱情地陪她去戲院，而且同她多次共進晚餐，後來霍夫曼小姐去了美國。摩根向他的表兄吐露內心的想法時說，他從來沒有認識過像她這樣的年輕女子。“她現在走了，我可能再也見不著她了。但假如我在那裏生活許多年的話，我相信我會對她另眼相看的。”
在這次漫長的假期結束後，他回到了哥廷根，而且是帶著一口流利的德語回來的。他開始學習擊劍，他曾為自己不是那些德國人的對手而感到有點尷尬，雖然他們都是專業選手。到了冬天，讓他非常痛苦的氣管炎又犯了，他不得不放棄這項課程。
至11月，他對自己在德語方麵的進步感到異常高興，並說他能很流利地與同學對話了。學生聯合會為一部分教授辦了一次聚會，表演了幾場喜劇，通過這些劇目他知道自己達到了能觀看和欣賞節目的德語水平。
幸好摩根的德語進步得非常快，否則他就無法為自己伸張正義了。在哥廷根大學學習期間，摩根遇到了一件令他十分憤怒的事情。他的滿滿一箱子的信件和照片被偷，包括一張他母親的很珍貴的照片和他十分珍視的簽名紀念冊。後來摩根告訴他的表兄吉姆說：“這最起碼得值100美元。”
警察逮捕了兩個青年，並找到了那隻箱子，可是裏麵的東西不知去向。
在法庭上，摩根不僅條理清晰，並且用很純正的德語向法庭提供了證詞，結果盜竊者被判了9年徒刑。
摩根其他各科的成績也都十分優異，尤其在數學方麵更表現出非同一般的才華。他的數學教授曾建議他留下，說再過一年他就會被聘為助教和輔導員了。
教授說，摩根完全有可能在類似這所大學的研究所的某一數學領域取得一席之地。這是哥廷根的教授對一位學生，特別是一名入學時間不長的美國學生的高度讚揚。
這位教授甚至認為，如果摩根回到美國去經商的話，他就是在浪費自己的生命，所以他鼓勵摩根把這門科學作為自己的終身事業。
當然，摩根除了經商外，他沒有別的野心，要他放棄祖業而從事學術生涯是不可能的。假如他真如教授期望的去搞數學，那麼美國金融史上就會少一位傑出的人物了。但摩根還是非常感激教授給予他的這一榮耀，而且在後來的日子裏經常提起。
這一年，他除了數學和化學，還選修了歐洲曆史，還有法國戲劇學和文學。
他對歐洲的興趣更廣泛了，因為他已決定要回美國經商了。他說這是他自己的主意，因為他父親抱怨過在這期間自己也搞不清該怎樣對付他，在他父親看來，摩根堅持要回去是沒有道理的。
1857年4月，他同他的朋友們一同慶祝了他的20歲生日。