馮仲雲的革命思想，通過信件和書籍不斷影響著薛雯，使她的革命信念，伴隨著愛情一道增長。在她剛剛成年的時候，這兩者就已經堅定不移了——嫁給雲哥哥，與他終身相伴；投身革命，奮鬥到底。
1929年暑假，馮仲雲上清華後第一次回鄉。為省錢，他乘坐海船，皮膚被海風吹得黑黑的，頭發很長，穿著竹布大褂，衣服上還有做化學實驗時燒的好幾個小洞，鄉裏人說他不像一個清華大學生。鄉下人早準備好要看到衣錦還鄉的清華學子。現實與理想的巨大反差讓他們忽然很懷疑馮仲雲的前途。薛雯的一些親屬也開始動搖。接著第二年開春，又傳來了馮仲雲在北平被警察抓了的消息。
餘巷民風淳樸，老百姓一向覺得隻有壞人才會進局子。那些去年就對馮仲雲有些疑問的親屬，這下認準了馮仲雲這小子學壞了。
鄉裏鄉親湊在一起少不了要議論此事。可想而知，這對薛雯的壓力有多大。馮仲雲的母親也是她的姑母，此時隻有娘倆相對而泣。風言風語固然可怕，但她們最擔心的還是仲雲的安危。消息是村裏在北平做工的一個遠房親戚傳回來的，仲雲本人根本聯係不上，連一點兒音訊也沒有。她們擔憂的是不知仲雲在遭受怎樣的痛苦和折磨。甚至，都不知現在是死是活……
每天薛雯都希望夜晚快點到來，因為隻有夜裏她才能鑽到被子裏盡情地流淚。她在心中一遍一遍地呼喚著仲雲的名字。
就這麼煎熬了半年之久，終於那個親戚又來信了，說仲雲出來了。
馮仲雲的被捕，是因為參加北平地下黨組織的“五一節飛行集會”。飛行集會是我黨在敵占區的活動方式之一，意在動員人民，擴大革命影響。但選擇時機很值得商榷。有時甚至就是一種“左傾”盲動的表現。
1930年4月，北平市委決定動員學生黨員和群眾在東城基督教青年會教堂，利用教徒們做禮拜時奪取會場，舉行“五一節飛行集會”。清華黨支部指定馮仲雲去參加這次活動。在會上大家通過了《反對軍閥混占勸《打倒國民黨反動派》的決議。然後喊著口號衝擊大門，就在他們衝擊大門的一瞬間馮仲雲就被警察局偵察隊的人給綁住了。當時被綁的有100多人。雲哥被關進了軍閥閻錫山的北平警備司令部監獄，過了半年的囚徒生活。在獄中，他和劉瀾波（新中國成立後曾任電力工業部部長）、鄭眠石（長期從事僑務工作）、張靜之（原鬆江省副主席）等人團結互助。仲雲與鄭眠石長期被一副手銬銬在一起。仲雲是初次上陣，開始有些膽怯，但很快冷靜下來，堅持鬥爭，經受了考驗。9月軍閥混戰，閻錫山的軍隊退走，張學良的軍隊還沒開進來，所以監獄沒人看管。難友們互相幫助砸開鐐銬.衝出了監獄。（選自薛雯回憶錄）
這次被捕人獄，使馮仲雲馬上就要拿到手的清華大學畢業文憑化為烏有。畢業論文早已寫完，戴學位帽的畢業照已拍好。但是因為坐這半年牢，有幾科課程沒念完，也沒有成績。
文憑暫時無法拿到。要拿的話.還需要補課、補考。除了人學時帶來的180塊銀元，家中沒有能力再供給他學費。四年下來，馮仲雲已經欠下學校400多塊銀元。他不想讓教授、同學再接濟他。更重要的是，半年牢獄生涯堅定了他改造社會的信念。馮仲雲不想再耽擱下去了，他恨不得馬L投身社會，加耀人革命鬥爭。
回顧那段往事，馮仲雲曾說：“我在學校中課程基本上是不壞的，可以說是高才生。隻是後來由於革命工作忙，沒有能夠利用一定的時間，所以沒學好。我的同學王淦昌、趙忠堯、周同慶等，現在都是名學者。但是在那個時候我並不比他們弱。”
幾十年後，著名數學家華羅庚在馮仲雲逝世後曾多次去看望他的遺婿薛雯女士。華羅庚親切地把馮仲雲稱作師兄，深切地表達了他對馮仲雲的懷念之情。
馮仲雲主動放棄了成為中國頂級數學家和留美深造的機會。他那時作出的終極選擇就是——去革命。