朱元璋還以鳳陽作為皇子的教育基地，經常派自己的孩子們回老家體驗生活，憶苦思甜。早在吳元年（公元1367年）十月，他就令剛剛十三歲的世子朱標前往臨濠謁祀祖宗陵墓，“以知鞍馬之勤勞”，“衣食之艱難”，“風俗之美惡”，“吾創業之不易也”。
洪武八年（公元1375年）十月，又命皇太子朱標和秦王、晉王、楚王、靖江王等王子“出遊中都，以講武事”。洪武九年二月，因秦王、晉王、燕王即將就藩，朱元璋命皇太子帶他們前往鳳陽，“觀祖宗肇基之地，俾知王業所由興”。十月，又詔秦王、晉王、燕王、吳王（後改封周王）、楚王、齊王練兵鳳陽。
洪武十一年（公元1378年）三月，詔秦王、晉王就藩，仍令燕王、周王、楚王“還駐鳳陽”。從此，“諸王之國，皆令詣辭皇陵而後行”，便成為“定例”。為了給皇子提供閱武練兵的場所，朱元璋於洪武十四年特命駙馬都尉黃琛在鳳陽獨山之前開設一個“廣三裏”的演武場，令諸王在這裏操練二三年或六七年，然後就藩。此後，在洪武十八年，遣湘王朱柏、魯王朱檀、澶王朱梓就藩，又命蜀王朱椿還駐鳳陽，“閱武中都”。
朱元璋還將鳳陽用作囚禁犯罪宗室的地方。朱元璋的從孫、朱文正之子朱守謙，因事被朱元璋廢為庶人，“使居鳳陽力田，冀其知稼穡艱難而思所以保富貴也”。由於這一先例，後來的明朝皇帝，都把犯罪的宗室遣送鳳陽囚禁。到明末，此處共關押過一百一十六批皇族。
由於以上種種設施，中都雖已罷廢，但這個經濟文化本不發達，交通也並非十分方便的鳳陽，仍然成為淮河流域的政治經濟文化中心，成為大明政局中一個特殊而重要的城市，對明朝的政治、經濟、軍事和社會生活等各個方麵，一直有著重大影響。這一格局延續到明末，波及清代。
朱元璋對家鄉的特殊政策
如何複興鳳陽這塊“龍飛之鄉”，保護好這塊國家“根本重地”，讓家鄉的經濟發展得快一點，讓鄉親們生活得好一些，朱元璋沒少費腦筋。他為鳳陽提供了許多“特殊政策”。
第一條是大移民。
至正二十六年（公元1366年）四月那次回鄉，給朱元璋留下了極為深刻的印象。他深深為戰爭對家鄉的破壞而震驚，後來他和大臣們聊起此行的感受說：“田野荒蕪，由兵興以來，人民死亡，或流徙他郡，不得以歸鄉裏。
骨肉離散，生業蕩盡，此輩寧無怨嗟？”（《明太祖實錄》卷二十）當時史書也記載，“兩淮以北，大河以南，所在蕭條”，“長淮南北，悉為丘墟”
（《元史》卷一八六，《張禎傳》），由於“民多逃亡，城野空虛”（《明太祖實錄》卷三十四），大片土地荒蕪，至洪武改元，鳳陽府已是“十年之間，耕桑之地變為草莽”（《明太祖實錄》卷五十一）。
在大明開國之際，鳳陽縣的本地居民僅有三千三百二十四戶（《中都誌·戶口》，引自陳梧桐《洪武大帝朱元璋傳》），不到一萬六千六百二十人。整個鳳陽府人口不超過十三萬，人口密度每平方公裏僅為五人。處處殘垣，村村寥落，這當然讓朱元璋心中十分不舒服。