混亂來得很快，中忍考試最後一關的現場，大蛇丸就露出了本來麵目，而佐助卻是在現場留下了一個影分身，然後自己的本體卻是往根部基地去了。
佐助也沒傻到用自個的本來麵目大搖大擺地進入根部基地，當然，死還是要讓團藏死個明白的。佐助隨便變成了一個草忍村的忍者，一路潛行到了根部，然後就用土遁遁入了根部基地之中。
根部基地雖說布置了各種各樣的防禦術式，但是也隻能防得住忍界的忍術，忍界的忍術雖說也有五行遁術的影子，但是兩個放在一起，那是大和遇上了千手柱間，一個隻能搞個綠化帶，一個一拍手就是個原始森林。根部的防禦結界甚至不比木葉村的差到哪兒去，甚至猶有過之，畢竟，木葉需要防衛的是一整個村子，而根部的基地範圍也就是那麼大，團藏又是個怕死的，所以，日複一日之下，將根部打造得跟鐵桶一般。
然而，佐助早就是慣犯了，早早就將根部的情況摸得一清二楚，他熟門熟路地進入了根部深處，那裏有人在給團藏彙報木葉如今的亂局，團藏冠冕堂皇地表示，自己要給木葉保存有生力量，所以，根部所有忍者，都不許出麵。進了根部，性命就被團藏控製在手中，所以，即便有人覺得不好，最終也隻能閉嘴，免得團藏一個不爽，發動舌禍根絕之印，這個咒印不僅可以防止忍者泄露秘密，同時也因為是用團藏的查克拉種下，所以，當團藏發動咒印，對方就算是不死，也要吃許多苦頭。既然團藏下了命令，根部忍者自然是全麵收縮，躲在根部地下基地裏，等待塵埃落定之後，再去收拾餐具。
佐助見到這般情況，心中冷笑起來。寫輪眼最擅長的是製造幻術，而且不是視力層麵的幻術，而是精神層麵的幻術，風昕雖說對於真幻之道隻是知道個皮毛，不過，他所知道的那些已然是高屋建瓴，立意極高，如南華尊者的化蝶之道，就將真幻之道推演到了一個極高的境界，所以，風昕稍微指引了佐助幾次之後，佐助就對幻術有了更深的理解，雖說還沒有覺醒萬花筒，但是借助於三勾玉寫輪眼，已經能夠發揮不亞於月瀆的威力。
這會兒，佐助沒有結印，隻是借助於根部收藏的那些寫輪眼，就發動了一個大型的幻術，幻術之中，時間飛快推進，三代在與大蛇丸的戰鬥中戰死，大蛇丸重傷，逃出木葉，團藏趁勢而起，借助於根部的勢力，迅速搶班奪權，又有大名的支持，順利成為第五代火影。
幻術都是隨著團藏的本心在推進，細節部分自有團藏自個補充，因此，團藏根本沒有發現什麼異常，他戴著火影鬥笠，披著禦神袍，誌得意滿地發表著任職宣言，聽著下麵村民們的歡呼，團藏隻覺到達了人生巔峰。
就在這個時候，趁著木葉因為之前的亂子實力大損，死了四代風影的砂忍村首先發動了戰爭，雲隱村和岩隱村也跟著發動，忍界大戰再次爆發！
原本屬於根部的那些忍者一個個戰死在戰場上，而木葉內部，也掀起了反對團藏的聲音，為了鞏固自己的統治，團藏更是大肆排除異己，用錯誤的軍令命令那些忍者去戰場上送死……
雖說佐助還沒能做到讓幻術變得真實的地步，但是對於那些根部忍者來說，他們已經陷入了幻境，原本的同伴在幻術中都成為了敵國的忍者或者是村子的叛徒，因此殺戮起來毫不手軟。
支持這麼大範圍的幻術，即便有著根部儲備的那些寫輪眼的幫忙，對於佐助來說，同樣是個沉重的負擔，因此，當根部忍者死傷過半的時候，終於有人發現了不對勁。
木葉村中，豬鹿蝶三家一直以來簡直親如一家，他們素來同進同退，戰場上，三家的忍者也更容易配合。原本團藏是想要三家各要一個的，但是奈良一家算是三代的心腹，又一向精明，各種推三阻四，秋道一族主要是還有個秋道取風在，那位雖說在年輕一代裏沒什麼名氣，但是他要是真發飆，還真是要帶來不小的麻煩，最終山中一族出了個山中風加入了根部。山中一族都是感知型忍者，對於根部來說也是一大戰力，經過洗腦，他對團藏忠心耿耿，這會兒他終於意識到了一股不協調的氣息。