忍界大陸，戰禍連年，哀鴻遍野，民不聊生！原本寬廣而美麗的大陸，此時卻有些滿目瘡痍，被披上了一層血腥的外衣，和那森森白骨作點綴。
無數的平民，因為戰爭而失去家園，不得不流離失所，苟且而活。整片大陸似乎都被那無盡的戾氣所籠罩，仿佛無形的黑幕一般遮蓋住那蔚藍的天空。
而在這戰爭之中，卻又兩名忍者如同彗星一般崛起，將那籠罩世界的戾氣所劃破，給整個忍界都帶來了一絲的名為希望的光明。
這二人就是森之千手一族的族長――千手柱間，和團扇宇智波一族的族長――宇智波斑。
二人聯手，並在和火之國大名的商討下，帶領著各自的家族，在火之國中共同建立一忍村，名為――木葉村！然後在忍村成了之後，二人各自帶領著族人，以那絕強的實力，四處強力鎮壓戰火。
千手柱間那一手出神入化的木遁忍術，宇智波斑那詭異強大而被詛咒的寫輪眼，在忍界之上大放異彩，所過之處為人可以掠其鋒芒，紛紛停息了戰火。
而這時其他國家的勢力也紛紛仿效二人，各自同國家合作，成立忍村。
如此一來，整個忍界徹底的從戰國時代，進入到了忍戰的時代。
整個忍界大陸，除了千手柱間和宇智波斑二人成立的火之國木葉村之外，最出名的分別是雷之國的雲忍村，風之國的砂忍村，土之國的岩忍村和水之國的霧忍村。
五大忍村鼎力，還有數百中小型忍村遍布忍界。各個忍村為了防止村子的戰力流失，開始逐漸收攏，於是，忍界中的戰爭也開始漸漸消失。
不過為了製約各個忍村以後再次發動戰爭，千手柱間和宇智波斑二人同時出動，將隱藏才忍界之中的九大尾獸一一捕捉，分別送到其他五大忍村，作為最終武器。
五大忍村有著尾獸這種破壞力強大的生物作為武器，每一個忍村都有所估計，不敢隨便開展。就這樣，在五大忍村的互相限製之下，忍界的戰爭也算是徹底的結束。
戰爭結束，整個忍界都迎來了短暫的和平，每個忍村也都開始了高速發展。
隻不過很快，這份平靜就被一件大事件給打破。
火之國木葉村千手一族的族長，也是這第一代火影千手柱間，在終結之穀和曾經的盟友宇智波一族的族長宇智波斑，因為不合，而進行了巔峰的決戰。
沒有人知道過程，所有人都隻知道最後，宇智波斑下落不明，千手柱間亦是重傷，被趕來救援的其弟弟千手扉間帶回木葉村。
如此看來，應該是千手柱間更勝一籌，這讓忍界各大勢力都為之感歎。接下來，木葉應該就是千手柱間，千手一族的囊中之物。
隻不過木葉村中很快傳出來的一個消息，讓在所有人都在為此事觀望的人都震驚了。
千手柱間因傷勢過重而與世長辭，將二代火影之位傳與弟弟，千手扉間。
整個忍界為之嘩然，畢竟千手柱間的木遁忍術，鎮壓亂世，在他們心中是不可磨滅的。可就是這樣一位戰神，如今竟然死亡了。
不過震驚之餘，就是那心中的蠢蠢欲動，這是戰爭將來的征兆。不過各大勢力並沒有馬上動手，他們依舊在耐心等待，等待那最佳的時機。
二代火影千手扉間剛剛上位，就開始對木葉村大肆改革，建立眾多部門以維護村子的正常運行，其中最為著名的就是忍者學院。
當然千手扉間也知道木葉村因為大哥的死亡，已經成為眾矢之的。為了在戰爭期間保護木葉村的安全，木葉忍村也是需要找一個忍村作為盟友。