會稽那是什麼地方？會稽又叫茅山，而且是大禹彙聚各路能人共同商議治水的地方，可謂秘傳無數。孫泰把南遷事情搞定，便向家人介紹了他的師傅杜子恭。這杜子恭確實是能人，在五鬥米教的江浙一帶算是呼風喚雨，本人也確實有本事，信徒大把。但杜子恭依然是肉體凡胎，幾年後也暴病而亡。杜子恭一死，孫泰憑借從他那裏學來的一身本事，再加上平時的暗地經營，搖身坐上了五鬥米教教主寶座，一時間孫家風頭無兩，威風再振！
此事一起，孫家全家老少無不對孫泰恭敬有加。尤其是在孫恩眼裏，這位叔父簡直就是神仙般的人物。而孫泰也喜歡這個好學上進的侄子，叔侄倆天天如影隨形，知道孫教主的人，也都知道孫教主的這位聰明伶俐的大侄子。
又過了一段時間，天下格局大亂，孫泰自忖手下教徒甚眾，也意圖舉兵作亂，結果被會稽內史發現，私下告發了他。幾日之後，會稽王司馬道子率兵圍了孫府，一舉格殺了孫泰，外帶孫家上下幾十。
而孫恩則被數百教眾保護著逃到了附近的海島避禍，一支人馬就這樣孤懸在了海外。
孫恩本來隻是想避禍罷了，也確實有幾個教眾勸他返回大陸振臂一呼，為叔父孫泰報仇，可孫恩一直沒答應。直到他某天在整理孫泰遺物時發現了一冊竹簡，這才引起了他內心極大的波動，那就是孫泰整理出的養骨術。
這本來隻是孫泰信手一寫，內容大致就是骨乃人之根本，精氣神肉血皮毛均要附於骨之上，煉什麼都不如煉骨，骨好了，人才會有整個的改變。這竹簡的後麵還有孫泰寫的一些養骨煉骨的法決。如果換成別人來看，這就是個發牢騷或者開腦洞的東西，一笑置之罷了。可孫恩不是，這冊竹簡直接命中了他的命門，和他曾經想過的事情一模一樣，死去的叔父無意間給他打開了一扇大門，而他在其中看到了希望。孫恩每天在海島都抱著這捆竹簡讀來讀去，不問世事，不再操心其他。
本來保著他跑到海島的教眾們都快絕望了，本以為跟著盡得真傳的孫恩能帶著他們重舉大旗，沒成想這孫恩整個就是個不諳世事的書呆子。但就在半年之後，看完了所有竹簡的孫恩，突然把所有教眾召集到了海邊一片石台上，迎著海風，孫恩宣布要舉大計，謀大事！
五鬥米教和天師教一脈相承，現在原教主被滅門，少教主隱忍半年後率眾複仇！
隨著孫恩的船隊出航，這消息如同長了翅膀一般飛到了各地。無論是起義軍、士族還是各地豪強，都把目光投降了從孤懸海外的小島回來的孫恩，看他到底是有些真本事，還隻是靠著嘴巴想拉攏人。而孫恩也一共隻有幾百號人，憑著點人也許占個村霸個縣還行。複仇？說夢話怕是都不敢這麼大聲吧？
但孫恩確實是個奇才，他並沒有沿襲以往那種雙方排兵布陣的傳統戰法，而是充分利用自己人少船多靈活性大的優勢，利用水流做機動頻繁騷擾沿岸的守衛官兵，迅速的完成了突破封鎖線和串聯各地教眾的目的。短短幾個月的時間，孫恩已經利用自創的戰法在沿海建立起一片屬於自己的地盤，把之前五鬥米教的散落教眾聚到了一起。而此時正在觀望的一些起義軍也有了動靜，看跟著他有希望便紛紛來投奔。短短半年時間，孫恩手裏的隊伍已經從數百人暴漲到了近十萬人之多。