經過了一天的協商之後，荷蘭殖民政府在英國的壓力下，終於答應了華東政府的要求，讓爪哇華人全麵進入殖民政府中任職，但也提出了一個條件，就是在爪哇行政體係中的華人比例，不能超過三成，因為這樣可以保持荷蘭在政府中的絕對多數，確實爪哇的行政依然控製在荷蘭手裏，這也是荷蘭方麵的底線了。
於是雙方又經過了3天的協商，反複的討價還價之後，最終確定，在行政體係中，華人在總督府的８個部門中可以占２個部門，而每個部門的工作人員都全由華人擔任；在立法體係中，華人將可以得到5個理事的席位；而在司法體係中，華人可以獲得１個法官的席位，並且在警察體係中，占約3成的比例。
總體來看，雙方對這個比例的分配都比較滿意，荷蘭殖民者終於保持了在爪哇的主導地位；而對爪哇華人來說，也是可以接受的結果，畢竟不可能一下子就達到和荷蘭人平起平坐，甚至淩架在荷蘭之上的地步。雖然3成的人數不足是動搖荷蘭人的地位，但如果運用得當，還是可以發揮相當大的作用。
如在立法體係中，5個理事的席位當然無法主導理事會的決議，但整個理事會並不是鐵板一塊，而是各方利益的交彙，從理論上說，如果政府的某項決議能夠得到５個華人理事的支持，那麼隻用在剩下的15個理事中獲得６個席位支持就可以獲得多數優勢，反之也亦然，這樣5個華人理事席位做為政治交易，將具有極大的價值，而且其他體係中也是大同小易，當然要達到這個效果，前提是所有華人必須完全保持一致。
於是在接下來的在殖民政府中任職的華人如何產生的談判討論中，華東政府寸步不讓，堅持要求在殖民政府中任職的華人必須由華人自行決定產生，殖民政府不得幹涉。荷蘭殖民政府最終隻能接受這個條件，不過也提出自己的條件，就是隻有爪哇華人才有資格參加選舉，或是投票，同時政府指定的罪犯不得參加選舉。這樣將海外華人通過選舉進入殖民政府的道路給封死了，也箅是荷蘭人守住最後一塊陣地。
對此華東政府到也沒有異議，因為華東政府在短期內也沒打算直接參與爪哇的政治，而是盡力在爪哇華人中培養自己的代理人，因此當然不會在這個問題上多做糾纏，不過華東政府要求在爪哇成立華人工會，負責管理在殖民政府中任職的華人產生工作，以及為華人提供必要的服務，當然並具有行政權力。
而荷蘭殖民政府也答應了這個條件，畢竟條約簽定之後，華人的政治地位必會大增，也確實要有一個組織，不僅負責管理在殖民政府中任職的華人產生，同時也便於對華人的管理。
雙方最終決定，給爪哇華人５個月的準備時間，完成華人工會的成立，以及在殖民政府中任職華人的產生，在１０月份正式上任，開展工作。
最後華東政府又提出，在爪哇設立辦事處，協調處理華東政府和爪哇華人，以及荷蘭殖民政府的各項關係。這個要求也十分合理，荷蘭殖民政府盡管不願意，但也沒有拒絕的理由。
就這樣華東政府和荷蘭殖民政府終於完成了談判，最終簽定了【巴達維亞條約】。華東政府不僅獲得了６５０萬英磅的賠款，而且是繼鄭和七下西洋之後，中國的勢力第一次伸入東南亞地區，並且由至獲得了廣大南洋華僑的支持，其影響力極為深遠，一直到若幹年之後，再充份的顯現出來。
當然，對英國政府來說避免了和華東政府徹底決裂，還可以全力遏製俄國的擴張，同時又暫時將華東政府的勢力擋在東南亞之外，也不失為為可以接受的結果。雖然按照【巴達維亞條約】的規定，爪哇華人可以在政治上取得很大的權力，但從總體來看，仍然還是由荷蘭殖民者在政府中占主導地位，華人僅僅隻能提升自己在爪哇的地位，但並不能左右爪哇的局勢，而且這是唯一的可行辦法，其他的條件都無法令雙方都滿意，至於荷蘭殖民政府無法再向過去那樣隨意壓迫華人，則不是英國考慮的問題。
盡管華東政府仍然可以借助爪哇華人的力量，以扶植代理人的方式向東南亞擴張，但那至少也是數年以後的事情，而當前英國主要的目標還是遏製俄國的擴張。根據英國政府的判斷，對俄戰爭將在未來一、二年內發生，而集中日本、華東政府的力量，加上英國在背後支持，擊敗俄國的可能性很大，既然不能擊敗俄國，也能極大的削弱俄國的力量，令其無法再在遠東擴張，而英國則可以視對俄戰爭的結果，再來確定應對華東政府的戰略，慢慢將華東政府的力量擠出東南亞。