南京駐防八旗兵共有四千餘人，滿城內也有和他們一起從北方遷徙下來的三萬家眷，在明軍圍攻滿城之際，榮辱與共的滿人老弱婦孺跟著奮起反擊，他們都拿起武器登上城牆，抗擊明軍。
雖然經過數場戰鬥後，駐防八旗隻剩下了一千多人，但他們仍然沒有投降的想法，因為他們心裏都非常清楚，攻破滿城的明軍定然不會放過他們和他們的家人，為了保護自己的父母妻兒，他們隻能頑強抵抗下去。
在如此危急存亡之際，滿城內臥病休養的博洛也強撐著身子，穿上盔甲來到城牆上督戰鼓舞士氣，他的兒子愛新覺羅·塔爾納時刻護衛在父親身邊，為他打下飛來的流矢。
為了能夠快速拿下滿城，蘇言也是發了狠，他命人冒死將大量火藥堆放在滿城的城牆底下，點燃引線後強行將滿城城牆炸開，隻聽到一聲驚天動地的巨大爆炸聲，炸點頓時塵土飛揚，無數城牆碎塊飛上天空，如雨點般向周圍落下。
如此巨大的爆炸以至於在城西的明軍都能夠感受到地麵的震動，他們驚愕地看著那揚起數十米高的煙塵，不禁咽了咽唾沫。
隨後，還未等煙塵散去，以俄羅斯衛戍軍為首的明軍便呐喊著朝著缺口發起衝鋒，缺口後麵以及方圓一兩裏內的清軍都被衝擊波震碎了耳膜和內髒，七竅流血，死狀淒慘。
更遠一點的清軍也沒有躲過波及，他們都被震得七葷八素，很長時間內都沒有回過神來，等明軍如洪水般湧入缺口殺到他們麵前時，他們才終於反應過來，匆忙想要進行抵抗，卻是為時已晚。
明軍攻入滿城後，城中的駐防八旗與居住的旗人家眷皆奮起反擊，依托城中的民居營房負隅頑抗，明軍每前進一段時間，都會遭到來自四麵八方射來的冷箭襲擊。
城中頑強抵抗的消息很快就傳到了蘇言的耳中，身為明軍主帥，蘇言有責任盡可能避免麾下將士的傷亡，因此，他經過一番思考後，便下達了一道殺氣騰騰的命令——
屠城！
凡是參與反抗明軍之人，不論老弱婦孺，皆可殺之！
蘇言的命令很快就被傳達下去，得到許可的明軍不再束手束腳，向滿城內的三萬旗人展開血腥屠刀，凡是遇到負隅頑抗的民房，明軍或是直接放火焚屋，或是投入轟天雷和手榴彈，毫不手軟！
屠城與進攻同時進行，明軍一直殺到五月十八日上午，城中的三萬餘旗人皆慘遭屠戮，街道上血流成河，無數房屋被毀，城中硝煙四起，整座城市都被籠罩在濃鬱的血腥味之中。
到最後，滿城三萬餘旗人居民中僅剩下不到千人幸存，他們都是躲在房屋內沒有參加抵抗的，並且在明軍破門而入發現他們時，他們及時用不太熟練的漢語高喊投降，才幸免於難。
隨後，明軍逐棟搜查了滿城內的房屋，確保沒有一個漏網之魚後，屠城在遭遇結束，幸存的旗人戰戰兢兢地被帶出房屋，他們走在鮮血幾乎快要漫過腳背的街道上，被眼前的慘狀嚇得險些昏厥過去。
不僅如此，南京城內的百姓一整夜都聽著城東傳來的喊殺聲，皆驚得睡不著覺，躲在屋內瑟瑟發抖，生怕下一秒殺到興起的明軍就會破門而入，對著他們一起下手。
這並非是沒有先例的，就比如說幾年前的揚州十日，揚州城整整八十萬百姓就是先被明軍高傑部屠了一遍，後麵又被清軍屠城，可是後世似乎都刻意遺忘了明軍高傑部犯下的暴行，隻記得清軍的屠城行徑。