三萬皇家近衛軍自然不能縮編，縮編的是野戰軍和地方部隊，二十七萬野戰軍裁減為二十萬人，以數字編號，重新編成二十個軍，分成五個軍團。（);分別為東北軍團、漠北軍團、西北軍團、南方軍團和東南軍團，原來淘汰的軍事人員卻有不同的分流，大多被編入建設兵團，這些士兵因為比一般的老百姓有紀律性，可以說是建設的最後人員。
東北軍團下轄第一、第二、第三軍共三萬人，擔任著護衛帝國北方和繼續向鄂霍次克海方向挺進的重任，軍團長由右都督，加封左柱國，並授特進光祿大夫，紫陽侯吳三桂擔任，副軍團長則由帝國子爵任繼榮、曹文昭兩人擔任。
漠北軍團下轄第四、第五、第六、第七軍共四萬人，擔任著護任整個蒙古大草原。並繼續向捕魚兒海方向挺進地重任。軍團長由原湖北總督、帝國伯爵劉芳亮擔任，同時撤消湖北總督之職，另設巡撫。布政司，副軍團長由帝國子爵馬繼先兩人擔任。
西北軍團下轄第八、第九、第十、第十一、第十二軍共五萬人，護衛著整個帝國的西北方。並有向新疆、青海、**方向滲透的重任。軍團長為懷化大將軍。帝國伯爵盧祥生擔任，副軍團長則由帝國子爵左光先、趙勝兩人擔任。
南方軍團下轄第十三、十四、十五、十六、十七、十八軍共六萬人，分守雲南和廣西兩省，同時伺機進入緬甸和安南兩國，軍團長由原湖南總督，帝國伯爵秦良玉擔任。同時撤消湖南總督之職，另設巡撫，布政司，副軍團長一個由原廣東總督。帝國伯爵李萬成擔任，同時撤消廣東總督之職，另設巡撫，布政司，另一個由驍衛大將軍，帝國伯爵高傑擔任。
東南軍團下轄第十九、二十軍共二萬人，駐守應天府、山東一線，和南海艦隊共同守衛整個南方海岸，軍團長由武衛大將軍，帝國伯爵楊勇擔任，副軍長團則由帝國男爵張誠、張化兩人擔任。
不難看出，帝國西北軍團和南方軍團最為強大，這也預示著朝庭下一個階段地用兵方向，皇帝雖然沒有在五年內大規模用兵的打算，但並不禁止帝國的將軍們向各自劃分地區域進行試探和小規模地攻擊。
從野戰軍中縮編出來地人員則並入地方守備軍，地方七十萬守備軍則要縮減一半，事實上總共要裁減出四十二萬人的部隊，其中有二十二萬人轉為築路部隊，其餘二十萬人則進入快擴張的各個工廠。
6軍大力裁減的同時，海軍卻在大量的擴軍，朝庭計劃在五年內，海軍由現有的編置提高到十萬人，朝庭也鼓勵被裁減下來地6軍報考海軍，裁軍節省下來的軍費除了用來提高官兵的薪水外，有很大一部分流入到海軍手中。最後海軍額定的軍費五年後高達一千二百萬銀元，比現有地四百萬銀元提高了整整二倍。
現在的軍隊也會在這次裁軍中受益，總共二十萬野軍戰，三十五萬地方守備軍分享每年三千九百萬銀元的軍費，其中野戰軍的士兵軍餉從現在的每月五塊銀圓提高到七塊，地方守備軍的軍餉由原先的三塊提高到四塊。而皇帝近衛軍的軍餉則另外單獨列算。
軍隊之後，就是官吏的整改，朝庭決定在莫南蒙古大草原上設立漠北省，在北京之外的整個遼東設東北省，加上又將湖廣拆分成湖南、湖北，行政區比大明多了三省，而且在縣以下又增加了鄉一級，使之大明的官吏比之大明不可避免的增加了許多。
崇禎時全國的官吏統計隻有二萬多人，而到了開明二年，大明的官吏已經有五萬多人，幾乎是翻了一倍，而且這個數字還在增加，預計補齊所有的職位，大明的官吏人數將會達到十萬人。
官員的增加相對於讀書人來講當然是好事，孫承宗等人雖然擔心大明會重現宋朝的冗官冗員情況，但明朝官員太少也是一個事實，近二億的人口才有二萬多官吏，使之基層的權力幾乎大半掌握在當地的豪門手中。