“這到底是什麼？”
李白乍看到這個東西極為驚恐，不過很快地理智回籠。這絕對不會是幽靈。
他看到了花瓣飄落在這個怪物的身上，並沒有穿過這個怪物。這個東西是有實體的，不可能是幽靈鬼怪之類的傳說中的東西。
不是人類，不是幽靈，行動得異常完美。那麼還剩下什麼？
——機關術。
這是由機關術創造的機器人，這是唯一的解釋。
李白知道，他觸及到了長安城最深處的秘密，方舟之謎。隻要著手研究這個機器人，那麼他很快就能夠見到方舟了。
太過興奮的李白，一直沒有發現，他被人跟蹤著。
宮本武藏沒有想到，方舟的秘密就這樣被他發現了。
從扶桑來到大唐，他確實是為了挑戰強者而來的。同時，他也是為了自然巫女娜可露露的請求來的。
作為最優秀的劍客，宮本武藏一直天下第一為目標。一路上他戰勝了無數對手。可是扶桑太小了，這裏沒有更多的強大的對手。所以宮本武藏聽從了路人的建議，去大唐，那裏人才濟濟。到那裏就可以找到更多值得挑戰的對手了。
而他沒有想到，青梅竹馬的阿通也在一直找自己。
在京都，宮本武藏離開後不久，一場災難就降臨了。
一個名叫徐福的男人，用長生不老作為誘餌，欺騙貴族們，讓他們服用不死藥。然而這些人雖然獲得了長生，實際上與行屍走肉無異。他們全部都變成了血族。
血族嗜血，為了得到糧食，得到活人的鮮血，他們互相殺戮，整個京都籠罩在腥風血雨之中。
自然巫女娜可露露感受到了這場危機，感受到了自然的靈魂發出的痛苦哀鳴。她確定，如果在這樣下去，扶桑，連同自然之靈，都會死去。為了拯救扶桑，娜可露露決定前往京都，去淨化災難。
也是那個時候，娜可露露遇上了阿通。
宮本武藏一生的對手太多了，輸在他‘二天一流’下的人也太多了。他隻知道，一個叫徐福的男人倒在了他的劍下。但沒有想到，血族竟然向阿通伸出了報複之手。
娜可露露遇上阿通的時候，阿通已經奄奄一息了。在自然巫女的禱告下，阿通說出了最後的囑托。於是娜可露露決意找到宮本武藏，這個強大的劍客，或許真的有拯救扶桑的能力。
兩人在江戶川相遇，娜可露露也不確定如何能夠拯救扶桑。唯一能夠有所幫助的，即是傳說中的方舟。
方舟是一切奇跡的起點，在那裏，也許有著能夠讓扶桑樹恢複生機的秘訣。隻要扶桑樹恢複了生機，那麼整個扶桑的生靈必定能夠被淨化。
宮本武藏知道，娜可露露的請求，隻是一種無可奈何的嚐試。但是現在，他似乎看到了拯救扶桑的希望了。
不過到底怎麼樣才能進入方舟內部呢？宮本武藏不知道。但是他知道，跟著李白，就一定有機會。
李白也在尋找方舟，隻要自己緊盯著他，搶先他一步就可以了！
宮本武藏悄無聲息地離開了。因為李白沒有繼續跟隨著這個怪物，而是站在房簷上靜靜思考。