既然裝備了霍爾式步槍，勢必影響到戰術運用。陸軍目前費了很大力氣才建立起體製：不管是編製、後勤、訓練都是圍繞米尼槍這一武器進行的。如果大規模的換裝霍爾式，要冒很大的風險。
相比之下規模小，經常執行小規模作戰任務，以散兵戰鬥為主的海兵隊來承擔實驗性部隊就顯得比較合適。而且霍爾式較快的射擊速度也比較適合海兵隊以散兵戰，精確射擊為主的戰術模式。
二人一拍即合。石誌奇的新編製新裝備的方案就得到了批準，小規模實驗性的裝備部隊試驗用。利用原香港支隊的人員重新編製了一支僅有三個連的第一遠征隊作為實驗部隊。
在左營基地的指揮室裏，已經製作了大比例的圍頭灣沙盤模型。包括安平、廈門島、鼓浪嶼和大小金門島。
如何對鄭開戰有過一些爭議，但是最終還是決定采取“直搗黃龍”的策略，用主力重拳突擊鄭芝龍的老巢安平鎮。一舉將這些地方的鄭家勢力掃蕩幹淨。如果有可能，乘勢捕殺鄭家的主要首腦，一勞永逸的將鄭家的勢力鏟除幹淨。
當年清軍對廈門的突然襲擊，雖然未能一勞永逸的摧毀鄭成功的軍力，但是掠走了鄭家多年積累起來的糧草和金銀，嚴重打擊了鄭成功的經濟力量，使其元氣大傷。
現在正是鄭家的草創階段，遠不如鄭成功時代那麼家底豐厚。如果能夠通過一次強大的水陸聯合打擊使得掠走其積蓄，摧毀其船隊，即使不能成功捕殺鄭家的主要首腦也足以讓鄭芝龍一蹶不振。
這一方案在入夏前就得到了批準，為此進行了軍力的調動。總參和海軍方麵經過情報綜合，提出在九月下旬發動這一攻勢比較合適。九月下旬，台風季節已經基本結束，海峽風平浪靜，有利於航渡部隊。其次鄭家前往日本的船隻均為六月出航，一般在九月前後歸航。可以最大限度的抓住鄭家的主要對日貿易船，沉重打擊其海上力量。
不過，情報部門也提醒總參和海軍，鄭芝龍的海上力量恢複的速度是非常快得。在福建沿海快速建造大型貿易船用不了一年的時間，一艘大型海舶最多七八個月就可以下水。雖然質量不佳，但是航行到日本或者南洋是沒有問題的。在舊時空的曆史上，鄭芝龍多次失利，船隻減少很多，但是每次他都能夠很快的重建艦隊――這和熊文燦的支持和他在漳、泉地區強大的根基有關。
現在熊文燦已經調往廣東，新巡撫鄒維璉雖然對鄭芝龍在海防上有所倚重，但是遠不如熊文燦信任鄭――鄭芝龍勢力漸大，在許多事務上自行其是，並不完全聽巡撫的調遣。所以他們之間的關係遠沒有熊文燦時代那麼“融洽”。
情報局分析認為，要動搖鄭家在漳泉地區的威望，同時使得撫鄒維璉對鄭的能力產生懷疑――福建的許多官吏對招撫鄭芝龍原本就是懷著無可奈何的心態，認為鄭芝龍“隻可用不可信”――使得其實力短時間難以恢複。就必須貫徹以重度打擊，徹底摧毀安平、廈門、鼓浪嶼和大小金門島。如果能擊斃鄭家主要首腦更好。
最後總參製定的作戰方案是，在9.20發動陸海軍聯合登陸作戰。海軍第一艦隊主力突入圍頭灣，一舉摧毀停泊在海灣內的全部船隻，同時海兵隊和陸軍對安平、廈門島、鼓浪嶼和大小金門島進行登陸占領。
占領這些區域之後，將對各島嶼的堡寨、城池進行全麵的掃蕩，逐一摧毀。人口、糧食和財物全部掠走，城池燒毀。使得圍頭灣“焦土化”，失去對外貿易能力。大圖書館和情報局都認為通過一次戰役徹底消滅鄭家是有困難的，必須最大程度的摧毀其經濟和物質基礎，再配合下一步的貿易封鎖和軍事打擊，才能最終將鄭家消滅。
這一計劃中陸海軍對安平、廈門島、鼓浪嶼和大小金門島地區隻進行摧毀作戰，不占領。總參考慮一旦直接占領這些區域，勢必造成大規模的分兵守備。而且對於福建官場來說，廈門、金門被占領，等於是漳、泉地區遭到了直接威脅，勢必造成較大的反彈。福建官場會拚了命的支持鄭芝龍反撲。
反之，他們隻是狠狠的打擊了鄭家，福建官場原本對鄭芝龍家族看著不順眼的官僚縉紳們反而會群起而攻之。
對貿易來說來說，福建沿海也不是必不可少的地方：殖民和貿易部的船隻可以從上海、廣州或者高雄出發航向任何貿易地點，從收購大明的貿易商品的角度來說，福建的商品也不具備不可替代性。