按照曾華的改製草案，他把“異世”的三權分立原則巧妙地設立進來了。隻是當時的人們還意識不到這一點，而隻是以為這不過是曾華分權製衡的帝王之術。將權力分別交給不同的部門，然後互相製衡牽製，達到既能最大程度地幫助他處理國事，又能避免一家獨大擅權。
曾華把行政權給了尚書行省，把立法監察權分別給了中書行省和門下行省。而三權分立的第三權－司法權，曾華把它交給了大理寺。大理寺相當於北府最高法院，一是掌司法訴訟，審刑斷事，讞天下斷案。凡各地所判案件，定罪至流、死，皆上大理寺審定核準，而大理寺也有權力從地方各級法司調閱審查任何一件它覺得有問題或者是檢察總署、法務部、都察院申訴的案件，而它的審判裁決具有最高法律效果。
二是具有律法最高裁定權。地方各級官府有司，一旦有其它有司或者貴族百姓申訴其行為違法，都會先到地方法司審理判決。一旦地方法司認為該有司行為違法，不但其行為無效，主官和相應官員都要被該級檢察署訴訟追究責任。而尚書行省、中書行省、門下行省和它們下屬的機構有司，則由大理寺直接審判，一旦裁定違法，下場跟地方有司差不多，連平章國事、參知政事也難逃被追究的結果。
大理寺由七名大理寺正卿和十八名大理寺少卿組成，十八名少卿分審刑少卿和斷事少卿，分別主理刑事和民事。正卿和少卿由平章國事提名，中書行省通過，門下行省沒有行封駁權進行否決，則最後由曾華任命，任期終身。
平章國事是不能任意任免大理寺正卿和少卿，他擁有的隻是提名權而已。平章國事隻有在正卿和少卿缺額時才有機會提名，要不然就是全體大理寺正卿和少卿跟他意見不合也隻能幹瞪眼。
由於大理寺正卿和少卿位高權重，除了任命複雜外，免職出缺也非常複雜。因為曾華希望這些司法官能避免外界幹擾，保證最大程度上的司法獨立。大理寺正卿和少卿隻有兩種方式離職。一是正卿和少卿年滿六十歲，或者是任職滿三十年，必須請辭。
這一種請辭的正卿和少卿都會被保留原來的俸祿，享受極高的禮遇。當然，也不免除正卿和少卿自己中途請辭，不過這一類請辭，無論是由於身體原因還是其它“壓力”，都不會享受到前一類請辭的待遇。
二是正卿和少卿審刑斷事不公，有違法瀆職的嫌疑，或是昏庸無用，失職不作為，尚書行省法務部，中書行省都察院都有彈劾權，一旦彈劾案在中書行省立案，必須有超過三分之二的朝議郎同意才算通過。而門下行省也沒有行使封駁否決權，那麼曾華就會依據該彈劾決議案罷免被彈劾的大理寺正卿和少卿。
大理寺在各地設分支機構，設州、郡、縣三級理判署，是為法司，行理法裁判職權。州理判署設十六名州判官，郡理判署設十四名以上郡判官，縣理判署設十二名以上縣判官，州判官和郡判官均由大理寺正卿和少卿和議任命，縣判官由州判官合議任命，都分審刑、斷事。而所有判官和檢察官類似，都必須是律法學院畢業的，精通律法。
由此可見，大理寺及其下屬的各級法司職權極重，可以極為有效地監督地方各級官府。所以說，地方各級官員除了畏懼喜歡神出鬼沒 “微服”四處探訪的都察院禦史，剩下的就是這各級法司的判官。許多喜歡讀報刊有“學識”的北府百姓在遇到官府處事不及或者不公時，最是喜歡去理判署，一張訟紙就可以把官府告了。斷事判官和當地官府的行政官員有很大不同，從進學到為官都不是一個“係統”的，攀不上什麼交情。而且斷事判官在每一個地方隻能任職三到五年，過後就會轉到其它地方去了。加上法司的費用俸祿等撥款都是由戶部直接撥付，再在內部一級級下發，跟各地官府沒有太多的關聯。所以法司判官們斷起案子來可沒有那麼好交情可講，而一旦被他裁斷違法，不但以前的行政處理無效，還要背上處分，不比被禦史彈劾來得輕鬆。
接下來是非常關鍵的軍事機構。
按照草案，曾華以大將軍職總領北府最高軍隊領導權，以下設樞密院，算得上是北府總理軍務的最高機構。主官是正三品上“同知軍事”，由謝艾出任。
這裏需要提到的一句是謝艾歸附北府後，除了治軍理政之外，就是非常熱衷學習“曾氏兵法”。他原本就是一位“知兵”的大家，但是在長安卻是把自己當成學生，不但去長安武備學堂旁聽，還虛心向曾華和跟隨他多年的將領們請教。幾年下來，謝艾居然將“曾氏兵法”非常係統地寫成好幾部書，還以此為基礎，充分發揮、完善和補充，居然寫出了《軍略》三百篇，成為長安武備學堂的經典教材之一。原本謝艾卸任涼州刺史之後倒是很屬意去做長安陸軍軍官學院的教正，但是曾華怎麼能放過他呢，直接任命他為樞密院同知軍事。
同知軍事的副職是同知樞密院事，設兩名，分別是甘芮和劉顧。跟尚書行省一樣，同知軍事的命令沒有一名同知院事的副簽是無效的。
樞密院的職權非常大。首先，它最大的權力就是隻有它才有調兵權和指揮權。一旦有戰事，隻有樞密院能夠接受大將軍曾華的授權，調遣北府各處陸海軍，組建戰時軍隊製度，發布作戰目的，下達作戰命令，通知尚書行省陸海軍部立即執行命令等等。從很多功能上看，曾華把它按照“異世”總參謀部來設置的。
樞密院下設兩署五司，等同於尚書行省的部。
軍機參謀署，平時負責整理軍事情報，並以此為據進行分析和推演，給出時局報告。並定期組織各處廂軍和府兵進行聯合演習，考課各級主管軍官將領。它平時還有一項特殊的職權，那就是負責管理北府各陸海軍軍官學院以及組織每年的軍官畢業考試，並有優先錄選優秀畢業軍官的權力。而在戰時，軍機參謀署就自動成為作戰指揮中樞，負責全局的作戰指揮，發布戰略命令。主官是軍機都事，由謝艾兼領，並設軍機主事十餘人，分領各科，每科均對應不同區域，均屬有參謀數十人。