晨霧漸漸消散了，猩紅的太陽跳躍著鑽出了海麵，平靜的大海碎銀萬點，閃爍著紅寶石般的粼粼波光。看著南方水天交際之處出現的一片黑黝黝的陸地，站在甲板上顧盼自得的陸軍少將、混成第四旅團旅團長伏見宮貞愛親王感到一陣激動：台灣！那就是天皇陛下“開萬裏之波濤，布國威於四方”的新疆土，那就是帝國軍人建不朽功勳，立萬世基業的地方！
自禦前會議內閣與軍方達成共識後，在內閣有意識的輿論宣傳及引導下，日本國內擴大戰爭的論調甚囂塵上，迅速形成了一股異常狂熱的好戰狂潮。幾乎所有的報紙都以“支持聖戰”、“為正義而戰”為題，連篇累牘地為日本繼續出兵台灣造勢，《時事新報》上還發表了“文野的戰爭”的論文。另外，三井、岩崎、涉澤等實業家還組成了報國會，積極籌集軍費；婦女們則從事恤兵運動。和政府嚴重對立的議會，也在各方麵的壓力下，通過了巨額軍費預算，做出了協助戰爭的決議。原計劃再次募集2000萬元的軍事公債，在國民們的踴躍認購下，實募數竟然達到了4700萬元。
為了配合第二師團南進增兵台灣，日本各報紙還紛紛向戰地派遣隨軍記者報導戰況。國木田獨步作為《國民新聞》的特派員，隨第四混成旅團旅團長伏見宮貞愛親王上了千代田艦，開辟了“愛弟通信”專欄；畫家久保田米仙作為畫報的從軍記者，也在《讀賣新聞》上設立了專門介紹戰爭場麵的專欄。佛教各宗也借機隨軍布教，慰問軍隊。《雪的進軍》、《婦人從軍歌》等表現侵略狂熱的歌曲更是在國民中廣為流傳，令軍隊的士氣與鬥誌愈發的高昂起來。與此同時，各地還出現了一些義勇兵誌願者，強烈要求入台作戰。日本國內終於再次形成了輿論一致，上下協力的“團結”場麵。
日本此次南進台灣的“第二師團”，是在原來“第二師團”的基礎上，重新進行整編之後組成的。第二師團師團長由乃木希典中將擔任，下轄第三、第四兩個混成旅團，旅團長分別為山口素臣少將和伏見宮貞愛少將，其作戰兵力達到了25000人。由於運輸及補給等多方麵的原因，日本大本營決定由伏見宮貞愛親王率領第四混成旅團，以及配屬給該旅團的臼炮大隊、工兵大隊和憲兵大隊共計13000餘人先期入台。就是帶著這樣一種“神聖的使命感”，第四混成旅團於9月16日，踏上了這塊讓幾代日本人垂涎三尺、夢寐以求的肥沃土地。
這一個多月，台灣總督兼軍務司令官樺山資紀可以說是慘淡經營、度日如年。第一旅團被殲以及比誌島支隊受重創，使得侵台日軍已經無力對新竹地區發動新的攻勢，而台北民眾此起彼伏的頑強抵抗，更是令日軍疲於奔波、一籌莫展。盼望已久的第四旅團在基隆登陸，終於讓心有不甘的樺山資紀、北白川宮能久親王等來了與台軍再決雌雄的時機。
9月19日，當剛剛抵台、人地生疏的第四旅團才接替完第二旅團在台北各地的防務，樺山資紀就迫不及待地再次組成了以近衛師團第二旅團為主力，由北白川宮能久親王任總司令官的征南支隊。日軍征南支隊分為東西兩路南侵新竹，其中：東路由比誌島支隊和臨時配屬的第四旅團一個步兵大隊，以及一個憲兵中隊、一個工兵中隊、一個騎兵中隊和一個炮兵中隊約4400餘人組成。比誌島義輝擔任總指揮，循山路經三角湧（今三峽西南）、大科嵌（今大溪）、龍潭坡，直指新竹；西路由近衛師團本部、第二旅團及臨時配屬的總督府直屬騎兵中隊共7800餘人擔任主攻。沿大道經桃仔園（今桃園）、中壢、楊梅、大湖口，合擊新竹，由北白川宮能久中將親自指揮。另外，為了牽製台南劉永福的黑旗軍大規模北上增援新竹，新組建完成的澎湖艦隊在完成封鎖台灣海峽任務的同時，還要派軍艦不斷在台南各主要港口外遊弋，並進行試探性攻擊。
9月21日，日軍征南支隊自台北出發，正式南進新竹。天剛蒙蒙亮，北白川宮能久親王就率隊出了北城門，總督樺山資紀、伏見宮貞愛親王、民政局長官水野遵、陸軍局長官大島久直、海軍局長官角田秀鬆等數十名總督府官員皆至北門外送行。總督府直屬軍樂隊高奏《君之代》樂曲，為征南支隊壯行，以期此戰能夠順利攻克新竹，一舉打通他們南進的通道。
盡管誌願軍入台已經引起了日本大本營的極大重視和關注，但他們還是對攻取台灣的難度有些低估。通過對各方麵的情報進行綜合分析，他們發現義勇軍渡海援台的人數應該是很有限的，近衛師團第一旅團被全殲隻不過是被義勇軍鑽了空子而已。一旦台灣海峽被封鎖，斷絕了義勇軍在人員和餉械上的後援，就算他們是“支那煞神”也唯有被慢慢困死一條路可走。也正是這種對誌願軍入台後，台灣抵抗力量發生的質的變化、以及台軍戰略戰術的改變和軍民鬥誌的再度高昂認識不足，注定了日軍此次南征仍會向上次一樣不可能一帆風順。