曾凡的身份已經從學生轉換為正式的研究員,回到實驗室繼續原先的工作。
酵母菌的基因功能驗證實驗一直在進行,不過有了超級計算機模擬出來的數據,這個實驗相對容易了許多,普通的功能基因已經不需要他親自動手了。
即便隻是做細胞實驗,酵母菌一萬多個基因也需要很長的時間才能全部做完,計算機模擬的再精確,也隻是預測,還需要實驗證實才行。
他要負責的是別人無法替代的程序修正,一些難度比較高的驗證實驗才用他出手,他的實驗操作手段公認實驗室最強,可能在整個學校都找不到對手。
全身心的投入工作,曾凡感覺時間就會過的很快,每次基因功能模擬演化後,都需要花費十幾天時間進行實驗驗證,確認模擬的準確率。
第五次模擬過後,經過長達一個月的實驗驗證,沒有再發現一次和模擬預測錯誤的情況,盡管全部的驗證實驗沒有做完,也可以宣布這次酵母菌的基因功能模擬實驗成功了。
帕米拉教授找曾凡談話,問他接下來的實驗方向,是繼續研究不同的酵母菌,還是模擬更複雜的多細胞生物。
“咱們的超級計算機算力不足,與其去做更複雜的多細胞生物,不如繼續研究單細胞菌類,或者更簡單的病毒,補充對酵母菌不包含的蛋白質種類的了解,以後算力夠了,再繼續更複雜的研究!”曾凡說著自己的想法。
“我聽說你和戴教授的一個學生在研究新型超級計算機,就算你們一切順利,建成實用的超算,最少也要兩三年後了吧?”帕米拉笑道。
“感覺你似乎比我還著急,那你是什麼意思呢?”曾凡問道。
“學校的超算是有點落伍,可是別的地方還有很多超算,你不用考慮算力問題,現有的數據你覺得能模擬到什麼程度?”
曾凡想了想說道:“最理想的情況,我覺得可以嚐試一下模擬果蠅,它們的身體足夠複雜,細胞種類也夠多,與人類基因的相似度也更高!”
“那你的程序是不是需要很大的變動,多久能完成?”帕米拉問道。
“核心算法不需要太大變化,在最新一次模擬結果的基礎上,補充一些果蠅的信息就可以了,三天時間足夠了!”曾凡回答道。
“我來解決超算的問題,你盡快完成程序的修改!”帕米拉和他商量完就離開了。
果蠅是一種小型蒼蠅,被廣泛用作生物學研究的模式生物。它是一種典型的雙翅目昆蟲,以腐爛水果和蔬菜為生,是一種小型的果樹害蟲。
這是因為果蠅擁有許多其他生物共有的特征,包括簡單但高度組織化的中樞神經係統,壽命可達40天,能夠快速繁殖、適應耐受性和易於實驗等特點。
此外,果蠅的基因數目有一萬三千多,其中百分之六十在人類中有同源基因,它的身體包含二百多種不同細胞,其中神經元細胞和哺乳動物的結構非常相似。
模擬果蠅的生命演化過程,有助於更深入的了解地球生物的細胞和組織結構,同時增加對人類自身的理解。
曾凡的基因模擬程序有點類似於數學推理題,通過已知的基因序列和部分基因功能,再輸入生物體盡可能多的宏觀特征信息,然後讓程序通過模擬基因演化,推測補全中間缺失的信息。
由於地球上已知的生物都是同源同種,有著同樣的基因結構,幾億年演化過程中基因序列的各種突變,才有了如今千姿百態的生物種群。